Mendeley文献管理软件使用介绍

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/* GitHub stylesheet for MarkdownPad (http://markdownpad.com) /
/ Author: Nicolas Hery - http://nicolashery.com /
/ Version: b13fe65ca28d2e568c6ed5d7f06581183df8f2ff /
/ Source: https://github.com/nicolahery/markdownpad-github */

/* RESET
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margin: 0;
padding: 0;
border: 0;
}

/* BODY
=============================================================================*/

body {
font-family: Helvetica, arial, freesans, clean, sans-serif;
font-size: 14px;
line-height: 1.6;
color: #333;
background-color: #fff;
padding: 20px;
max-width: 960px;
margin: 0 auto;
}

body>*:first-child {
margin-top: 0 !important;
}

body>*:last-child {
margin-bottom: 0 !important;
}

/* BLOCKS
=============================================================================*/

p, blockquote, ul, ol, dl, table, pre {
margin: 15px 0;
}

/* HEADERS
=============================================================================*/

h1, h2, h3, h4, h5, h6 {
margin: 20px 0 10px;
padding: 0;
font-weight: bold;
-webkit-font-smoothing: antialiased;
}

h1 tt, h1 code, h2 tt, h2 code, h3 tt, h3 code, h4 tt, h4 code, h5 tt, h5 code, h6 tt, h6 code {
font-size: inherit;
}

h1 {
font-size: 28px;
color: #000;
}

h2 {
font-size: 24px;
border-bottom: 1px solid #ccc;
color: #000;
}

h3 {
font-size: 18px;
}

h4 {
font-size: 16px;
}

h5 {
font-size: 14px;
}

h6 {
color: #777;
font-size: 14px;
}

body>h2:first-child, body>h1:first-child, body>h1:first-child+h2, body>h3:first-child, body>h4:first-child, body>h5:first-child, body>h6:first-child {
margin-top: 0;
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}

a:first-child h1, a:first-child h2, a:first-child h3, a:first-child h4, a:first-child h5, a:first-child h6 {
margin-top: 0;
padding-top: 0;
}

h1+p, h2+p, h3+p, h4+p, h5+p, h6+p {
margin-top: 10px;
}

/* LINKS
=============================================================================*/

a {
color: #4183C4;
text-decoration: none;
}

a:hover {
text-decoration: underline;
}

/* LISTS
=============================================================================*/

ul, ol {
padding-left: 30px;
}

ul li > :first-child,
ol li > :first-child,
ul li ul:first-of-type,
ol li ol:first-of-type,
ul li ol:first-of-type,
ol li ul:first-of-type {
margin-top: 0px;
}

ul ul, ul ol, ol ol, ol ul {
margin-bottom: 0;
}

dl {
padding: 0;
}

dl dt {
font-size: 14px;
font-weight: bold;
font-style: italic;
padding: 0;
margin: 15px 0 5px;
}

dl dt:first-child {
padding: 0;
}

dl dt>:first-child {
margin-top: 0px;
}

dl dt>:last-child {
margin-bottom: 0px;
}

dl dd {
margin: 0 0 15px;
padding: 0 15px;
}

dl dd>:first-child {
margin-top: 0px;
}

dl dd>:last-child {
margin-bottom: 0px;
}

/* CODE
=============================================================================*/

pre, code, tt {
font-size: 12px;
font-family: Consolas, "Liberation Mono", Courier, monospace;
}

code, tt {
margin: 0 0px;
padding: 0px 0px;
white-space: nowrap;
border: 1px solid #eaeaea;
background-color: #f8f8f8;
border-radius: 3px;
}

pre>code {
margin: 0;
padding: 0;
white-space: pre;
border: none;
background: transparent;
}

pre {
background-color: #f8f8f8;
border: 1px solid #ccc;
font-size: 13px;
line-height: 19px;
overflow: auto;
padding: 6px 10px;
border-radius: 3px;
}

pre code, pre tt {
background-color: transparent;
border: none;
}

kbd {
-moz-border-bottom-colors: none;
-moz-border-left-colors: none;
-moz-border-right-colors: none;
-moz-border-top-colors: none;
background-color: #DDDDDD;
background-image: linear-gradient(#F1F1F1, #DDDDDD);
background-repeat: repeat-x;
border-color: #DDDDDD #CCCCCC #CCCCCC #DDDDDD;
border-image: none;
border-radius: 2px 2px 2px 2px;
border-style: solid;
border-width: 1px;
font-family: "Helvetica Neue",Helvetica,Arial,sans-serif;
line-height: 10px;
padding: 1px 4px;
}

/* QUOTES
=============================================================================*/

blockquote {
border-left: 4px solid #DDD;
padding: 0 15px;
color: #777;
}

blockquote>:first-child {
margin-top: 0px;
}

blockquote>:last-child {
margin-bottom: 0px;
}

/* HORIZONTAL RULES
=============================================================================*/

hr {
clear: both;
margin: 15px 0;
height: 0px;
overflow: hidden;
border: none;
background: transparent;
border-bottom: 4px solid #ddd;
padding: 0;
}

/* TABLES
=============================================================================*/

table th {
font-weight: bold;
}

table th, table td {
border: 1px solid #ccc;
padding: 6px 13px;
}

table tr {
border-top: 1px solid #ccc;
background-color: #fff;
}

table tr:nth-child(2n) {
background-color: #f8f8f8;
}

/* IMAGES
=============================================================================*/

img {
max-width: 100%
}

Mendeley 是一款免费的跨平台文献管理软件，同时也是一个在线的学术社交网络平台。Mendeley 对 PDF、Bibtex 的支持非常好，可以直接导出 Bibtex 格式，还可以直接导入zotero数据库，决定了其兼容性不错。Mendeley 可一键抓取网页上的文献信息添加到个人的 library 中，插件可以完美和浏览器、word整合。此外还免费提供各2GB的文献存储和100MB的共享空间。当然缺点是对中文文献支持很差，网速太慢等。Mendeley 和其他文献管理软件的比较参见维基百科。

我们通过一个简单的例子来了解一下此款软件的功能。假设现在要写毕业论文，大方向是“区块链”，那么在开题前就需要检索、阅读、管理大量的文献。在谷歌上搜索“blockchain”，找到自己所需要的PDF文件下载（只是个“栗子”，实际操作中当然不能只找这么一点文献啦）：

看到这是不是有点崩溃，这些文件名都是啥意思，如果想找“BlockChain Technology: Beyond Bitcoin” 这篇文章，难道要一个一个打开找？行，就算你有耐力遍历去找，那如果有上百的文献呢？有些小伙伴不用文献管理软件，采取文件夹套文件夹的方式，一层又一层，对于涉及话题较多，维度多，信息量大的文献，花在分类文献上的时间比阅读文献的时间还要长。那接下来我们就用 Mendeley 来看看是如何提高文献管理的效率的。

1.添加文献

第一种方法

如果你已经将PDF文档下载到电脑上了，那就单击左上方 Add 按钮，添加 PDF 到 Mendeley（Add Files 添加单个文档，Add Folder 添加文件夹里所以文档），或者直接将 PDF 拖到内容窗格。Watch Folder 为监视文件夹，在其中存入 PDF，这些 PDF 文档会被自动添加到 Mendeley。监视文件夹功能使得一次添加多个文档更为简单，并且不需要改变文档在计算机中的存储位置。

Mendeley 自动提取文件信息，自动识别Titile, Author, Publication, Year… 看一下添加后的效果吧：

是不是很直观地看到作者、文章标题、年份等信息了？右侧框框里是详细信息，可以进行修改。添加文献后注意文献的类型，每种类型的基本信息不同。注意将缺失的信息补充完整，将错误的信息改正，便于日后引用：

Mendeley 会将不能确定其详细信息的文档添加到 Needs Review 部分以便人工核对。可使用ArXiv（收集物理学、数学、计算机科学与生物学论文预印本）、DOI(全称是“digital object identifier”，数字对象唯一标识，被喻为“互联网上的条形码”）、PMID（PubMed 唯一标识码，是 PubMed 搜索引擎中收录的生命科学和医学等领域的文献编号）等查找文档详细信息。在Details选项卡各自的域中填入对应文档ID，然后点击域旁边的放大镜图标，就可以在线获取文献的准确信息：

还可以导入Endnote™（需转成XML）、BibTEX和RIS的库。这里提一下BibTex，文件后缀为.bib，这里在谷歌学术中找一个BibTex看一看它的真面目：

大概都是由这些标签组成，每个表示一个文献。把它粘贴到文档里，将文档拖拽到 Mendeley 中即可显示文献信息啦，大家试一试把！

第二种方法

如果在浏览网页时顺手把文献保存到library中，可以通过点击菜单栏 Tools → Install Web Importer 实现 Web 网页导入。首先把 Save to Mendeley 拖到浏览器导航栏位置：

完成上述步骤后，当我们打开一页面，点击浏览器导航栏上的 Save to 就可有下图中右方的显示，再点击 Save 就可保存到 library 中：

不能确定其详细信息的文档添加到 Needs Review 部分以便人工核对。单击 search 将尝试从Google Scholar补全文档缺失信息:

第三种方法

Mendeley 本身也提供 Literature Search 功能，输入你想查找的 key words 即可查找，右侧点击 Save Reference 保存到Mendeley：

2.管理文献

绿点表明文档未读，点击绿点切换已读和未读。可以将喜欢的或希望保持跟踪的文档用星形图标标记，Favorites 中会显示所有被标记的文档：

左上侧可以在 My library 中创建文件夹进行分类，将刚才找到的文档放到 blockchain 文件夹下：

左下侧中可以从中选择，根据作者关键字、作者、笔记和出版杂志对所有文献或分组内文献进行筛选。标签可批量编辑，可以为多个文献条目一次添加或删除标签，也可以批量重命名多个文献的标签名：

Mendeley 自带 PDF 阅读器，双击即可打开文档。菜单栏中 Highlight 有 Highlight Text （一行为基准）和 Highlight Rectangle （任意一块区域）两个选项实现高亮显示文字，Note 按钮添加注释。两项功能均可用选中区域后单击右键的方法来实现。Ctrl+Z 可撤销操作。

选中这篇文献，就可以看到所做的笔记（注：这些注解并不存储在PDF文档中，而是存储在 Mendeley 帐户中。若想创建一个新的包含这些注释的PDF文档，可以 File → Export with Annotations）：

在 search 中输入需要搜索的信息，即可在文档中找到对应的位置：

选中此文，单击 Related 可以查看相关文献：

还记得一开始下载的PDF文件名是一串数字和字母吗？如果每次都手动重命名会累死人的！Mendeley的文档管理工具可以自动重命名PDF文档并将它们归入具有清晰结构的文件夹当中，方便在Mendeley之外对文档的查找。点击 Tools → Options → File Organize。

Organize my files：将所有文档复制到一个文件夹中
Sort files into subfolders：创建一个基于所选文档信息的文件夹组织结构
Rename document files：将文档名更改为可包含作者姓名、期刊名、年份和文档标题的更有意义的文档名

可以看到文件名相对于之前已变得易读：

3.引用文献

单击菜单栏 Tools → Install MS Word Plugin 安装 word 插件，word 中就会出现相应的工具栏按钮，方便引用文献、生成题录或手动编辑其它条目。打开 word，点击引用 → Insert Citation

此时会弹出一个对话框，可以通过作者姓名，文档标题或发表年份搜索文献，同时引用多篇文献用分号将其分开，找到想引用的文献后，单击OK按钮即可：

Style 中选择引文格式：

Insert Bibliography 生成引文：

也可以在 Mendeley 中选择欲引用的文献，单击 Edit → Copy As(三种格式，如果选择 Formatted Citation 即是直接的引文格式)，然后将其粘贴到所编辑的文档中，或者简单粗暴地直接拖拽到所编辑的文档中。

4.导出与同步

一般来说，Mendeley 网上同步的时候不会选择 PDF 文件同步，毕竟空间有限(All Documents → Edit Settings → 取消Synchronize attached files)：

菜单栏 File → Export 导出有三种格式，选择所需要的：

如果要导出整个library，可以 Ctrl+A 全选文献然后 Export，也可以Tools → Options，然后在 BibTeX 选项卡中勾选Enable BibTeX syncing，并点亮 Create one BibTeX file for me whole library，在Path文本框中选择合适路径保存（生成一个 library.bib 文件）。在重装系统或重装 Mendeley 之后可选择 library.bib 进行恢复。

Mendeley原本有一项Reference功能，可以便捷导入文献中的文献，但从Mendeley Desktop的0.9.7版开始，Reference功能被取消了，来自官方的解释是这个功能占用了服务器太多资源，并且其价值不大。不过官方有打算在后续版本中以改进的方式重新引入Reference功能，敬请期待吧！