最近处理数据的时候需要处理一些xml文件,但是xml文件的格式之前并不是很熟悉。幸好R有一些函数可以帮助快速处理xml文件。其中的xmlToList函数尤其方便,可以使你从陌生的XML迅速回到熟悉的R的数据结构。

library(XML)
url_experiment = "ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/dra/fastq/DRA001//DRA001860/DRA001860.experiment.xml"
xml_experiment_list = xmlToList(url_experiment) # 将XML文件转化为R的list
head(xml_experiment_list)
ChIPseq_Library = sapply(xml_experiment_list, function(x) x$TITLE)
#处理转化为list的data即可

R处理xml文件的更多相关文章

  1. 关于android开发添加菜单XML文件之后无法在R.java中生成ID的问题

    因为和同学分开做的android软件,现在想整合他做的界面部分,于是拷贝了res和src文件夹的文件,其中包括一个res.menu文件夹中的XML.但是每次将该文件导入到工程总无法自动在R.java中 ...

  2. 解决:eclipse导入android时工程下没有R文件的问题,以及style.xml文件报错

    解决:eclipse导入android时工程下没有R文件的问题,以及style.xml文件报错

  3. 编写xml文件不当时会出现R文件找不到情况

    1,先检查xml文件是否报错,报错的话直接找到报错行. 2,xml文件若不报错,可能是文本值得格式输入错误 比如android:text=“<0.5km”,此时的小于号就会引发错误,导致R文件找 ...

  4. 解决android中Layout文件下的xml文件配好后,R类中不能自动生成相应代码

    不能更新的原因: 1.在xml文件中代码错误或者格式错误 2.eclipse 编译器是老版本 3.布局文件的文件名有大写字母 4.含有相同文件名.格式的xml文件 解决方法: 1.找到出错的xml文件 ...

  5. eclipse android开发,文本编辑xml文件,给控件添加ID后,R.java,不自动的问题。

    直接编辑xml文件给控件添加id,不自动更新.原来的id写法:@id/et_tel 然后改写成这样:@+id/et_tel  然后就好了!操`1

  6. XML文件解析并利用SimpleAdapter将解析结果显示在Activity中

    首先创建一个实体类 Mp3Info用来存储解析的XML文件中的内容: public class Mp3Info implements Serializable{ private static fina ...

  7. .net中xml文件的导入使用(包括创建xml和导入xml)

    上次有说到.net 创建xml文件的方法(一种固定方式,一种动态方法),这次记录一下怎样导入xml文件 1.导入xml文件的方法 1)xml文件格式

  8. .net中创建xml文件的两种方法

    .net中创建xml文件的两种方法 方法1:根据xml结构一步一步构建xml文档,保存文件(动态方式) 方法2:直接加载xml结构,保存文件(固定方式) 方法1:动态创建xml文档 根据传递的值,构建 ...

  9. java解析XML文件

    dom4j是一个Java的XML API,类似于jdom,用来读写XML文件的.dom4j是一个非常非常优秀的Java XML API,具有性能优异.功能强大和极端易用使用的特点,同时它也是一个开放源 ...

随机推荐

  1. Matrix-Tree定理

    感觉又学到了一个利器! 感谢Vfleaking神犇,传送门 http://vfleaking.blog.163.com/blog/static/1748076342013112523651955/   ...

  2. HDU 4890 One to Four(2014 Multi-University Training Contest 3)

    题意:给定一个长方形网格,要把它切成完全相同4个部分(这里完全相同指可以旋转平移后能重叠).把4个重叠后每个网格对应有四个数字相加,得到一种方案,所有格子中和最小就是该种方案的值,在多种方案中,最后问 ...

  3. CentOS下编译安装MySQL 5.6.21

    一.编译安装MySQL前的准备工作 安装编译源码所需的工具和库 yum install gcc gcc-c++ ncurses-devel perl 安装cmake:http://www.cnblog ...

  4. Map学习

    1.Query Operations(查询操作) int size();boolean isEmpty(); boolean containsKey(Object key);boolean conta ...

  5. 读者写者问题(有bug 后续更改)

    与上一篇<秒杀多线程第十篇 生产者消费者问题>的生产者消费者问题一样,读者写者也是一个非常著名的同步问题.读者写者问题描述非常简单,有一个写者很多读者,多个读者可以同时读文件,但写者在写文 ...

  6. C++二叉查找树实现及转化为双向链表

    二叉树首先要有树节点 template<class T> class BinaryNode { public: T element; BinaryNode *left; BinaryNod ...

  7. [安卓]AndroidManifest.xml文件简介及结构

    1.AndroidManifest.xml文件简介: 每个应用程序在它的根目录中都必须要有一个AndroidManifest.xml(名字须精确一致)文件.这个清单把应用程序的基本信息提交给Andro ...

  8. [Windows驱动]驱动包(Driver Packages)

    在windows下安装一个驱动,我们你需要把所有需要的软件打包-称为驱动包.驱动包里包括系统提供的给所有设备类使用的一般安装工具,还包括了设备商提供的设备特定的组件.下面我们就来看看驱动包里具体需要哪 ...

  9. Android开发-开发前的配置

    一.JDK   (不用安装) JDK是 java 语言的软件开发工具,主要用于移动设备.嵌入式设备上的java应用程序. JDK是整个java开发的核心,它包含了JAVA的运行环境,JAVA工具和JA ...

  10. 读取properties中的key对应的value