# 读取fasta
# 解析每条序列的长度
chr1_seq = 'ATATATATAT'
chr2_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCG'
chr3_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT'
chr4_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG'
chr5_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT'
# 求和
total_len = len(chr1_seq) + len(chr2_seq) + len(chr3_seq) + len(chr4_seq) + len(chr5_seq)
# 输出结果
print(total_len)

python学习——读取染色体长度(二、向前一步:通过染色体序列获得长度信息)的更多相关文章

  1. 《Python学习手册》(二)

    <Python学习手册>(二) --类型和运算 数字 十六进制 八进制 二进制 0x 0o 0b hex() oct() bin() >>>int('10',2) 2 & ...

  2. python学习——读取染色体长度(七:读取fasta文件)

    读取fasta文件genome_test.fa,并计算染色体总长,同时输出最长染色体编号.序列以及长度 fasta文件genom_test.fa的内容如下: >chr1ATATATATAT> ...

  3. python学习——读取染色体长度(三、用循环或者函数求总长并获取最长染色体长度)

    # 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = [10,20,30,40,50] # 求和 # 方法一:通过循环 total_len = 0 #定义total_len的初始长度 for ...

  4. python学习——读取染色体长度(四:获取最长染色体的编号)

    # 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = {'chr1':10,'chr2':20,'chr3':30,'chr4':40,'chr5':15} # 求和 total_len = ...

  5. python学习——读取染色体长度(一、简化问题)

    # 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_len = 10 chr2_len = 20 chr3_len = 30 chr4_len = 40 chr5_len = 50 # 求和 tot ...

  6. Python学习笔记第十二周

    目录: 数据库介绍 mysql 数据库安装使用 mysql管理 mysql 数据类型 常用mysql命令事务 索引 创建数据库 外键 增删改查表 权限 python 操作mysql  ORM sqla ...

  7. python学习——读取染色体长度(五:从命令行输入染色体长度)

    # 传递命令行参数 # 导入sys模块 import sys print(sys.argv)   命令行操作 python argv.py 10 20 30 40 50 回车输出 ['argv.py' ...

  8. python学习——读取染色体长度(六:读取含有染色体长度的文件)

    含有染色体长的文件chr_len.txt chr1 10chr2 20chr3 30chr4 40chr5 50 python脚本 #传递命令行参数 import sys # 导入模块 # 从命令行获 ...

  9. Python学习【第十二篇】模块(2)

    序列化 1.什么是python序列化? 把变量从内存中变成可存储或传输的过程称之为序列化,在Python中叫pickling 序列化就是将python的数据类型转换成字符串 反序列化就是将字符串转换成 ...

随机推荐

  1. Java8与传统的日期和时间类详解

    一.传统的日期时间类(Date和Calendar) 1. Date类 这里的Date是位于java.util包下的类,而不是java.sql包下的date类,Date对象即包含日期也包含时间,从JDK ...

  2. 百度APP移动端网络深度优化实践分享(一):DNS优化篇

    本文由百度技术团队“蔡锐”原创发表于“百度App技术”公众号,原题为<百度App网络深度优化系列<一>DNS优化>,感谢原作者的无私分享. 一.前言 网络优化是客户端几大技术方 ...

  3. 深入理解Java虚拟机-第1章-走进Java-读书笔记

    第 1 章 走近 Java 前言 Java 的技术体系主要是由支撑 Java 程序运行的虚拟机.为各开发领域提供接口支持的 Java API.Java 编程语言及许许多多的第三方 Java 框架(如 ...

  4. C# 三种打印方式含代码

    一:C#代码直接打印pdf文件(打印质保书pdf文件) 引用: 代码注释很详细了. private void btn_pdf_Click(object sender, RoutedEventArgs ...

  5. 【源码学习】redux-thunk

    阅读 redux 源码之后,想要加深一下对中间件的理解,于是选择 redux-thunk(2.3.0)这个源码只有十几行的中间件. 之前 redux 的学习笔记 https://www.cnblogs ...

  6. EscapeAndUnescapeUtil【java模拟js的escape和unescape函数】

    版权声明:本文为HaiyuKing原创文章,转载请注明出处! 前言 在这里做一个记录,基本代码同参考资料<java模拟js的escape和unescape函数>一样. 效果图     代码 ...

  7. docker~yml里使用现有网络

    回到目录 我们在进行docker swarm部署高可用集群时,在yml文件里可能要配置一些服务,而这些服务可能要使用一些公用的数据库,这些数据库可能已经运行在某个容器里,而这些容器有自己的网络,doc ...

  8. 【Python3爬虫】百度一下,坑死你?

    一.写在前面 这个标题是借用的路人甲大佬的一篇文章的标题(百度一下,坑死你),而且这次的爬虫也是看了这篇文章后才写出来的,感兴趣的可以先看下这篇文章. 前段时间有篇文章<搜索引擎百度已死> ...

  9. .NET ClrProfiler ILRewrite 商业级APM原理

    Demo:https://github.com/caozhiyuan/ClrProfiler.Trace 背景 为了实现自动.无依赖地跟踪分析应用程序性能(达到商业级APM效果),作者希望能动态修改应 ...

  10. sql字符串分割扩展方法

    可编程性—表值函数 SET ANSI_NULLS ON GO SET QUOTED_IDENTIFIER ON GO CREATE FUNCTION [dbo].[Split] ( @RowData ...