# 读取fasta
# 解析每条序列的长度
chr1_seq = 'ATATATATAT'
chr2_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCG'
chr3_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT'
chr4_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG'
chr5_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT'
# 求和
total_len = len(chr1_seq) + len(chr2_seq) + len(chr3_seq) + len(chr4_seq) + len(chr5_seq)
# 输出结果
print(total_len)

python学习——读取染色体长度(二、向前一步:通过染色体序列获得长度信息)的更多相关文章

  1. 《Python学习手册》(二)

    <Python学习手册>(二) --类型和运算 数字 十六进制 八进制 二进制 0x 0o 0b hex() oct() bin() >>>int('10',2) 2 & ...

  2. python学习——读取染色体长度(七:读取fasta文件)

    读取fasta文件genome_test.fa,并计算染色体总长,同时输出最长染色体编号.序列以及长度 fasta文件genom_test.fa的内容如下: >chr1ATATATATAT> ...

  3. python学习——读取染色体长度(三、用循环或者函数求总长并获取最长染色体长度)

    # 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = [10,20,30,40,50] # 求和 # 方法一:通过循环 total_len = 0 #定义total_len的初始长度 for ...

  4. python学习——读取染色体长度(四:获取最长染色体的编号)

    # 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = {'chr1':10,'chr2':20,'chr3':30,'chr4':40,'chr5':15} # 求和 total_len = ...

  5. python学习——读取染色体长度(一、简化问题)

    # 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_len = 10 chr2_len = 20 chr3_len = 30 chr4_len = 40 chr5_len = 50 # 求和 tot ...

  6. Python学习笔记第十二周

    目录: 数据库介绍 mysql 数据库安装使用 mysql管理 mysql 数据类型 常用mysql命令事务 索引 创建数据库 外键 增删改查表 权限 python 操作mysql  ORM sqla ...

  7. python学习——读取染色体长度(五:从命令行输入染色体长度)

    # 传递命令行参数 # 导入sys模块 import sys print(sys.argv)   命令行操作 python argv.py 10 20 30 40 50 回车输出 ['argv.py' ...

  8. python学习——读取染色体长度(六:读取含有染色体长度的文件)

    含有染色体长的文件chr_len.txt chr1 10chr2 20chr3 30chr4 40chr5 50 python脚本 #传递命令行参数 import sys # 导入模块 # 从命令行获 ...

  9. Python学习【第十二篇】模块(2)

    序列化 1.什么是python序列化? 把变量从内存中变成可存储或传输的过程称之为序列化,在Python中叫pickling 序列化就是将python的数据类型转换成字符串 反序列化就是将字符串转换成 ...

随机推荐

  1. pgsql sql 统计整理

    字符字段转整型查询: SELECT mon_id as staTime,SUM (CAST ( index_value AS INT )) AS totalCount FROM aidata.rep_ ...

  2. softmax函数详解

    答案来自专栏:机器学习算法与自然语言处理 详解softmax函数以及相关求导过程 这几天学习了一下softmax激活函数,以及它的梯度求导过程,整理一下便于分享和交流. softmax函数 softm ...

  3. 两篇文章带你走入.NET Core 世界:Kestrel+Nginx+Supervisor 部署上云服务器(二)

    背景: 上一篇:两篇文章带你走入.NET Core 世界:CentOS+Kestrel+Ngnix 虚拟机先走一遍(一) 已经交待了背景,这篇就省下背景了,这是第二篇文章了,看完就木有下篇了. 直接进 ...

  4. .NET Core TDD 前传: 编写易于测试的代码 -- 单一职责

    第1篇: 讲述了如何创造"缝".  "缝"(seam)是需要知道的概念. 第2篇, 避免在构建对象时写出不易测试的代码. 第3篇, 依赖项和迪米特法则. 第4篇 ...

  5. android学习笔记--检测是否为wifi环境

    ConnectivityManager cm = (ConnectivityManager) getSystemService(Context.CONNECTIVITY_SERVICE); // 获取 ...

  6. mac 下常用命令备忘录

    1.查看端口号 lsof -i: 2.杀死进程 kill 41321 3.查看文件夹文件 ls ls -l //看到文件及文件夹更多的内容 ls -a //隐藏的文件 ls -la //上面的组合 4 ...

  7. 【Android Studio安装部署系列】六、在模拟器上运行项目

    版权声明:本文为HaiyuKing原创文章,转载请注明出处! 概述 在模拟器上运行项目的步骤.不过在实际开发中,一般不采用这种方式,因为影响电脑的运行,所以一般使用真机运行项目. 运行项目 创建模拟器 ...

  8. RecyclerSwipeAdapterDemo【使用AndroidSwipeLayout用于列表项侧滑功能】

    版权声明:本文为HaiyuKing原创文章,转载请注明出处! 前言 记录AndroidSwipeLayout搭配Recyclerview实现列表项侧滑功能. 效果图 代码分析 适配器类中设置Swipe ...

  9. KnockoutJS-快速入门

    虽然在WPF中接触过MVVM模式,可是刚开始在Web中接触到Knockout.JS让我大吃一惊,简化了好多工作量,原来可能需要一大堆的JS脚本完成的工作量,被释放许多.接触KnockoutJS一年多了 ...

  10. Asp.Net Core 轻松学-HttpClient的演进和避坑

    前言     在 Asp.Net Core 1.0 时代,由于设计上的问题, HttpClient 给开发者带来了无尽的困扰,用 Asp.Net Core 开发团队的话来说就是:我们注意到,HttpC ...