# 读取fasta
# 解析每条序列的长度
chr1_seq = 'ATATATATAT'
chr2_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCG'
chr3_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT'
chr4_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCG'
chr5_seq = 'ATATATATATCGCGCGCGCGATATATATATCGCGCGCGCGATATATATAT'
# 求和
total_len = len(chr1_seq) + len(chr2_seq) + len(chr3_seq) + len(chr4_seq) + len(chr5_seq)
# 输出结果
print(total_len)

python学习——读取染色体长度(二、向前一步:通过染色体序列获得长度信息)的更多相关文章

  1. 《Python学习手册》(二)

    <Python学习手册>(二) --类型和运算 数字 十六进制 八进制 二进制 0x 0o 0b hex() oct() bin() >>>int('10',2) 2 & ...

  2. python学习——读取染色体长度(七:读取fasta文件)

    读取fasta文件genome_test.fa,并计算染色体总长,同时输出最长染色体编号.序列以及长度 fasta文件genom_test.fa的内容如下: >chr1ATATATATAT> ...

  3. python学习——读取染色体长度(三、用循环或者函数求总长并获取最长染色体长度)

    # 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = [10,20,30,40,50] # 求和 # 方法一:通过循环 total_len = 0 #定义total_len的初始长度 for ...

  4. python学习——读取染色体长度(四:获取最长染色体的编号)

    # 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr_len = {'chr1':10,'chr2':20,'chr3':30,'chr4':40,'chr5':15} # 求和 total_len = ...

  5. python学习——读取染色体长度(一、简化问题)

    # 读取fasta # 解析每条序列的长度 chr1_len = 10 chr2_len = 20 chr3_len = 30 chr4_len = 40 chr5_len = 50 # 求和 tot ...

  6. Python学习笔记第十二周

    目录: 数据库介绍 mysql 数据库安装使用 mysql管理 mysql 数据类型 常用mysql命令事务 索引 创建数据库 外键 增删改查表 权限 python 操作mysql  ORM sqla ...

  7. python学习——读取染色体长度(五:从命令行输入染色体长度)

    # 传递命令行参数 # 导入sys模块 import sys print(sys.argv)   命令行操作 python argv.py 10 20 30 40 50 回车输出 ['argv.py' ...

  8. python学习——读取染色体长度(六:读取含有染色体长度的文件)

    含有染色体长的文件chr_len.txt chr1 10chr2 20chr3 30chr4 40chr5 50 python脚本 #传递命令行参数 import sys # 导入模块 # 从命令行获 ...

  9. Python学习【第十二篇】模块(2)

    序列化 1.什么是python序列化? 把变量从内存中变成可存储或传输的过程称之为序列化,在Python中叫pickling 序列化就是将python的数据类型转换成字符串 反序列化就是将字符串转换成 ...

随机推荐

  1. 如何配置Open Live Writer程序以便更好的为博客服务

    Open Live Writer的前身是Windows live Writer 即(WLW)是一个免费的桌面应用程序,您可以使用它轻松发布丰富的内容到您的网络日志.WLW最终版为Windows Liv ...

  2. 将HTML字符转换为DOM节点并动态添加到文档中

    将HTML字符转换为DOM节点并动态添加到文档中 将字符串动态转换为DOM节点,在开发中经常遇到,尤其在模板引擎中更是不可或缺的技术. 字符串转换为DOM节点本身并不难,本篇文章主要涉及两个主题: 1 ...

  3. linux-Navicat 连接数据库 报错10060 & Navicat连接报错1146

    1.mysql数据库设置远程连接权限 GRANT ALL PRIVILEGES ON *.* TO 'root'@'%' IDENTIFIED BY '密码' WITH GRANT OPTION;[回 ...

  4. 为什么从前那些.NET开发者都不写单元测试呢?

    楔子 四年前我虽然也写了很多年代码,由于公司虽然规模不小,却并非一家规范化的软件公司,因此在项目中严格意义上来说并没有架构设计.也不写单元测试,后来有幸加入了一家公司,这家公司虽然也是一家小公司,但是 ...

  5. IDLE打开Python报错 api-ms-win-crt-runtimel1-1-0.dll缺失的解决方案

    1.此方法转载至 http://blog.csdn.net/lt_java13/article/details/78814676 2.把C:\Windows\SysWOW64的api-ms-win-c ...

  6. 死磕 java集合之LinkedHashSet源码分析

    问题 (1)LinkedHashSet的底层使用什么存储元素? (2)LinkedHashSet与HashSet有什么不同? (3)LinkedHashSet是有序的吗? (4)LinkedHashS ...

  7. okhttputils【 Android 一个改善的okHttp封装库】使用(二)

    版权声明:本文为HaiyuKing原创文章,转载请注明出处! 上一篇讲了如何在项目中导入OKHttputils库的操作,这一篇主要讲常见请求的写法. get请求 public String getPe ...

  8. PhotoPickerDemo【PhotoPicker0.9.8的个性化修改以及使用(内部glide版本号是3.7.0)】

    版权声明:本文为HaiyuKing原创文章,转载请注明出处! 前言 本Demo使用的是PhotoPicker 0.9.8版本,属于比较旧的版本,里面集成的glide版本号是3.7.0.本篇文章主要是留 ...

  9. Linux相关学习笔记-文件系统

    在Linux的文件系统中, 相应的文件都按其作用分门别类地放在相关的目录中 以下是最近整理学习的一些, linux中的文件存放 /bin 二进制可执行命令 /dev 设备特殊文件  // 外部设备文件 ...

  10. [翻译] 介绍EF Core

    Entity Framework Core in Action Entityframework Core in action是 Jon P smith 所著的关于Entityframework Cor ...