UMI标签学习【转载】
转自: https://club.1688.com/threadview/50123159.htm
简单介绍一下利用单分子标签(Unique Molecular Identifier,UMI)对残留噪音进行矫正或纠错的原理。
UMI矫正的原理有两个关键点:
第一,以单个DNA分子为测序样本,而不是传统胚系突变检测时所用的样本DNA整体。
第二,通过数量换质量,对标记后的单个DNA分子多次测序(也称为高深度测序),进一步提高单个分子的单碱基准确性。
流程下图所示,先将UMI标签添加至DNA分子(双端添加可用于区分正负链,进一步矫正),然后进行文库富集,这时候,不管是指数还是线性,单个分子都被复制成千万个带有相同标记的分子,然后再进行高通量测序。在测序数据中,通过单分子标记将他们重新聚集在一起统一分析,聚合酶错误和测序错误在高深度测序数据中是零散分布的,统计一致性序列后便得到了矫正后的精确序列,可用于对整个样本中的突变频率进行“绝对定量”。值得一提的是,单个UMI的效率,UMI自身的突变纠错以及不同UMI的均匀性等性能均需要在实际操作中进行优化,但这些都不影响该解决方案的实施。

//关键是通过对很多具有相同umi标签的序列进行 一致性统计,这样才能够确定真实序列信息吧。过滤掉测序错误的或者聚合酶错误的等等。
UMI标签学习【转载】的更多相关文章
- Java多线程学习(转载)
Java多线程学习(转载) 时间:2015-03-14 13:53:14 阅读:137413 评论:4 收藏:3 [点我收藏+] 转载 :http://blog ...
- java struts2入门学习--OGNL语言常用符号和常用标签学习
一.OGNL常用符号(接上一篇文章): 1.#号 1)<s:property value="#request.username"/> 作用于struts2的域对象,而不 ...
- 论文笔记:多标签学习综述(A review on multi-label learning algorithms)
2014 TKDE(IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering) 张敏灵,周志华 简单介绍 传统监督学习主要是单标签学习,而现实生活中目标样 ...
- HTML标签学习总结(2)
点我:HTLM标签学习总结(1) 11. 在网页制作过程过中,可以把一些独立的逻辑部分划分出来,放在一个<div>标签中,这个<div>标签的作用就相当于一个容器. 语法: & ...
- video标签学习使用
video标签学习使用 学习前的理解 video是HTML5中的新标签,可以用来播放视频.对于不同的浏览器支持的视频格式不一样,但是具体浏览器支持的类型并不清楚. 支持的类型 视频的格式分为编码格式和 ...
- HTML基础标签学习
HTML基础学习 前言 HTML基础学习会由HTML基础标签学习.HTML表单学习和一张思维导图总结HTML基础三篇文章构成,文章中博主会提取出重点常用的知识和经常出现的bug,提高学习的效率,后续会 ...
- git添加标签(转载)
From:http://git-scm.com/book/zh/v1/Git-%E5%9F%BA%E7%A1%80-%E6%89%93%E6%A0%87%E7%AD%BE 打标签 同大多数 VCS 一 ...
- html中的一些标签学习
今天看手册学习到了HTML5很多属性.现在总结如下 <body bgcolor="BED1A2" text="FFFFFF" link="yel ...
- (转)DEDECMS模板原理、模板标签学习 - .Little Hann
本文,小瀚想和大家一起来学习一下DEDECMS中目前所使用的模板技术的原理: 什么是编译式模板.解释式模板,它们的区别是什么? 模板标签有哪些种类,它们的区别是什么,都应用在哪些场景? 学习模板的机制 ...
随机推荐
- <转>特征工程(二)
出处: http://blog.csdn.net/longxinchen_ml/article/details/50493845, http://blog.csdn.net/han_xiaoyang/ ...
- Win8交互UX——键盘交互
设计用户可以通过硬件键盘.屏幕键盘或触摸键盘交互的 Windows 应用商店应用. 本主题介绍键盘交互的设计注意事项.有关实现键盘交互的信息,请参阅响应键盘输入. 键盘交互 键盘输入是 Windows ...
- 【Spring系列】Spring AOP面向切面编程
前言 接上一篇文章,在上午中使用了切面做防重复控制,本文着重介绍切面AOP. 在开发中,有一些功能行为是通用的,比如.日志管理.安全和事务,它们有一个共同点就是分布于应用中的多处,这种功能被称为横切关 ...
- 在ubuntu中安装rpm包
Ubuntu的软件包格式是deb,如果要安装rpm的包,则要先用alien把rpm转换成deb. sudo apt-get install alien #alien默认没有安装,所以首先要安装它 su ...
- 【BZOJ4355】Play with sequence 线段树
[BZOJ4355]Play with sequence Description 维护一个长度为N的序列a,现在有三种操作: 1)给出参数U,V,C,将a[U],a[U+1],...,a[V-1],a ...
- 开发工具-网络封包分析工具Charles
extends:http://blog.devtang.com/blog/2013/12/11/network-tool-charles-intr/ 简介 本文为InfoQ中文站特供稿件,首发地址为: ...
- Java虚拟机六 堆溢出的处理
在Java程序中,如果堆空间不足,有可能抛出内存溢出错误:Out Of Memory,简称OOM. Exception in thread "main" java.lang.Out ...
- React 属性和状态的一些总结
一.属性 1.第一种使用方法:键值对 <ClaaNameA name = “Tom” /> <ClaaNameA name = {Tom} /> <ClaaNameA n ...
- Transient修饰符的使用
如果一个类没有继承Serilizable接口,那么它就不能被序列化,写入文件的时候会报异常.如果一个类继承了Serilizable接口,那么这个类的所有属性和方法都可以自动被序列化,而现实中我们又希望 ...
- html 在一个超链接上面,鼠标移动上去时,也显示一串文字,如何实现
a标签的title属性,对title属性赋值即可.例如:<a href="http://www.baidu.com/" title="跳转到百度"> ...