转自: https://club.1688.com/threadview/50123159.htm

简单介绍一下利用单分子标签(Unique Molecular Identifier,UMI)对残留噪音进行矫正或纠错的原理。

UMI矫正的原理有两个关键点:

第一,以单个DNA分子为测序样本,而不是传统胚系突变检测时所用的样本DNA整体。

第二,通过数量换质量,对标记后的单个DNA分子多次测序(也称为高深度测序),进一步提高单个分子的单碱基准确性。

流程下图所示,先将UMI标签添加至DNA分子(双端添加可用于区分正负链,进一步矫正),然后进行文库富集,这时候,不管是指数还是线性,单个分子都被复制成千万个带有相同标记的分子,然后再进行高通量测序。在测序数据中,通过单分子标记将他们重新聚集在一起统一分析,聚合酶错误和测序错误在高深度测序数据中是零散分布的,统计一致性序列后便得到了矫正后的精确序列,可用于对整个样本中的突变频率进行“绝对定量”。值得一提的是,单个UMI的效率,UMI自身的突变纠错以及不同UMI的均匀性等性能均需要在实际操作中进行优化,但这些都不影响该解决方案的实施。

//关键是通过对很多具有相同umi标签的序列进行 一致性统计,这样才能够确定真实序列信息吧。过滤掉测序错误的或者聚合酶错误的等等。

UMI标签学习【转载】的更多相关文章

  1. Java多线程学习(转载)

    Java多线程学习(转载) 时间:2015-03-14 13:53:14      阅读:137413      评论:4      收藏:3      [点我收藏+] 转载 :http://blog ...

  2. java struts2入门学习--OGNL语言常用符号和常用标签学习

    一.OGNL常用符号(接上一篇文章): 1.#号 1)<s:property value="#request.username"/> 作用于struts2的域对象,而不 ...

  3. 论文笔记:多标签学习综述(A review on multi-label learning algorithms)

    2014 TKDE(IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering) 张敏灵,周志华 简单介绍 传统监督学习主要是单标签学习,而现实生活中目标样 ...

  4. HTML标签学习总结(2)

    点我:HTLM标签学习总结(1) 11. 在网页制作过程过中,可以把一些独立的逻辑部分划分出来,放在一个<div>标签中,这个<div>标签的作用就相当于一个容器. 语法: & ...

  5. video标签学习使用

    video标签学习使用 学习前的理解 video是HTML5中的新标签,可以用来播放视频.对于不同的浏览器支持的视频格式不一样,但是具体浏览器支持的类型并不清楚. 支持的类型 视频的格式分为编码格式和 ...

  6. HTML基础标签学习

    HTML基础学习 前言 HTML基础学习会由HTML基础标签学习.HTML表单学习和一张思维导图总结HTML基础三篇文章构成,文章中博主会提取出重点常用的知识和经常出现的bug,提高学习的效率,后续会 ...

  7. git添加标签(转载)

    From:http://git-scm.com/book/zh/v1/Git-%E5%9F%BA%E7%A1%80-%E6%89%93%E6%A0%87%E7%AD%BE 打标签 同大多数 VCS 一 ...

  8. html中的一些标签学习

    今天看手册学习到了HTML5很多属性.现在总结如下 <body bgcolor="BED1A2" text="FFFFFF" link="yel ...

  9. (转)DEDECMS模板原理、模板标签学习 - .Little Hann

    本文,小瀚想和大家一起来学习一下DEDECMS中目前所使用的模板技术的原理: 什么是编译式模板.解释式模板,它们的区别是什么? 模板标签有哪些种类,它们的区别是什么,都应用在哪些场景? 学习模板的机制 ...

随机推荐

  1. Church 整数前驱的推导

    Church 整数前驱的推导比其后继复杂得多,wiki中一个前驱的定义据王垠的博客里说,是他一个数学系的同学花一星期时间推导出来的, 其定义确实比其它介绍lambda的文章中用pair来实现(据说是图 ...

  2. nginx upstream 实现负载均衡

    如果Nginx没有仅仅只能代理一台服务器的话,那它也不可能像今天这么火,Nginx可以配置代理多台服务器,当一台服务器宕机之后,仍能保持系统可用.具体配置过程如下: 1. 在http节点下,添加ups ...

  3. Python并行编程的几个要点

    一.基于线程的并行编程 如何使用Python的线程模块 如何定义一个线程 如何探测一个线程 如何在一个子类中使用线程 Lock和RLock实现线程同步 信号实现线程同步 条件(condition)实现 ...

  4. 23种设计模式之代理模式(Proxy)

    代理模式是一种对象结构型模式,可为某个对象提供一个代理,并由代理对象控制对原对象的引用.代理模式能够协调调用者和被调用者,能够在一定程度上降低系统的耦合度,其缺点是请求的处理速度会变慢,并且实现代理模 ...

  5. IOS开发 REST请求 ASIHTTPRequest用法

    ASIHTTPRequest类库简介和使用说明 官方网站: http://allseeing-i.com/ASIHTTPRequest/ .可以从上面下载到最新源码,以及获取到相关的资料. 使用iOS ...

  6. iOS自带分享

    NSArray *activityItems; if (self.sharingImage != nil) { activityItems = @[self.sharingText, self.sha ...

  7. 搭建本地DNS解析

    一.安装Dnsmasq yum install -y dnsmasq 二.安装dig yum install dnsmasq -y 三.编辑配置文件 vim /etc/dnsmasq.conf res ...

  8. 每日定时收集MySQL日志并发送邮件

    本次脚本系统版本 MySQL日常运行产生的慢查询日志收集并且发送邮件 vim mysql-slow-log.sh # 这是一个收集慢查询的脚本,每天收集MySQL慢查询日志并且发送邮件#!/bin/b ...

  9. hdu 6395Sequence【矩阵快速幂】【分块】

    Sequence Time Limit: 4000/2000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 262144/262144 K (Java/Others) Total ...

  10. IntelliJ IDEA学习记录

    一.下载 地址:官网下载地址 二.安装 运行安装程序,一路下一步.注意选择安装路径. 三.基本概念 project:相当于donet中的解决方案(solution),eclipse中的工作空间(wor ...