# Multi-class (Nonlinear) SVM Example
#
# This function wll illustrate how to
# implement the gaussian kernel with
# multiple classes on the iris dataset.
#
# Gaussian Kernel:
# K(x1, x2) = exp(-gamma * abs(x1 - x2)^2)
#
# X : (Sepal Length, Petal Width)
# Y: (I. setosa, I. virginica, I. versicolor) (3 classes)
#
# Basic idea: introduce an extra dimension to do
# one vs all classification.
#
# The prediction of a point will be the category with
# the largest margin or distance to boundary. import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
import tensorflow as tf
from sklearn import datasets
from tensorflow.python.framework import ops
ops.reset_default_graph() # Create graph
sess = tf.Session() # Load the data
# iris.data = [(Sepal Length, Sepal Width, Petal Length, Petal Width)]
iris = datasets.load_iris()
x_vals = np.array([[x[0], x[3]] for x in iris.data])
y_vals1 = np.array([1 if y == 0 else -1 for y in iris.target])
y_vals2 = np.array([1 if y == 1 else -1 for y in iris.target])
y_vals3 = np.array([1 if y == 2 else -1 for y in iris.target])
y_vals = np.array([y_vals1, y_vals2, y_vals3])
class1_x = [x[0] for i, x in enumerate(x_vals) if iris.target[i] == 0]
class1_y = [x[1] for i, x in enumerate(x_vals) if iris.target[i] == 0]
class2_x = [x[0] for i, x in enumerate(x_vals) if iris.target[i] == 1]
class2_y = [x[1] for i, x in enumerate(x_vals) if iris.target[i] == 1]
class3_x = [x[0] for i, x in enumerate(x_vals) if iris.target[i] == 2]
class3_y = [x[1] for i, x in enumerate(x_vals) if iris.target[i] == 2] # Declare batch size
batch_size = 50 # Initialize placeholders
x_data = tf.placeholder(shape=[None, 2], dtype=tf.float32)
y_target = tf.placeholder(shape=[3, None], dtype=tf.float32)
prediction_grid = tf.placeholder(shape=[None, 2], dtype=tf.float32) # Create variables for svm
b = tf.Variable(tf.random_normal(shape=[3, batch_size])) # Gaussian (RBF) kernel
gamma = tf.constant(-10.0)
dist = tf.reduce_sum(tf.square(x_data), 1)
dist = tf.reshape(dist, [-1, 1])
sq_dists = tf.multiply(2., tf.matmul(x_data, tf.transpose(x_data)))
my_kernel = tf.exp(tf.multiply(gamma, tf.abs(sq_dists))) # Declare function to do reshape/batch multiplication
def reshape_matmul(mat, _size):
v1 = tf.expand_dims(mat, 1)
v2 = tf.reshape(v1, [3, _size, 1])
return tf.matmul(v2, v1) # Compute SVM Model
first_term = tf.reduce_sum(b)
b_vec_cross = tf.matmul(tf.transpose(b), b)
y_target_cross = reshape_matmul(y_target, batch_size) second_term = tf.reduce_sum(tf.multiply(my_kernel, tf.multiply(b_vec_cross, y_target_cross)), [1, 2])
loss = tf.reduce_sum(tf.negative(tf.subtract(first_term, second_term))) # Gaussian (RBF) prediction kernel
rA = tf.reshape(tf.reduce_sum(tf.square(x_data), 1), [-1, 1])
rB = tf.reshape(tf.reduce_sum(tf.square(prediction_grid), 1), [-1, 1])
pred_sq_dist = tf.add(tf.subtract(rA, tf.multiply(2., tf.matmul(x_data, tf.transpose(prediction_grid)))), tf.transpose(rB))
pred_kernel = tf.exp(tf.multiply(gamma, tf.abs(pred_sq_dist))) prediction_output = tf.matmul(tf.multiply(y_target, b), pred_kernel)
prediction = tf.argmax(prediction_output - tf.expand_dims(tf.reduce_mean(prediction_output, 1), 1), 0)
accuracy = tf.reduce_mean(tf.cast(tf.equal(prediction, tf.argmax(y_target, 0)), tf.float32)) # Declare optimizer
my_opt = tf.train.GradientDescentOptimizer(0.01)
train_step = my_opt.minimize(loss) # Initialize variables
init = tf.global_variables_initializer()
sess.run(init) # Training loop
loss_vec = []
batch_accuracy = []
for i in range(100):
rand_index = np.random.choice(len(x_vals), size=batch_size)
rand_x = x_vals[rand_index]
rand_y = y_vals[:, rand_index]
sess.run(train_step, feed_dict={x_data: rand_x, y_target: rand_y}) temp_loss = sess.run(loss, feed_dict={x_data: rand_x, y_target: rand_y})
loss_vec.append(temp_loss) acc_temp = sess.run(accuracy, feed_dict={x_data: rand_x,
y_target: rand_y,
prediction_grid: rand_x})
batch_accuracy.append(acc_temp) if (i + 1) % 25 == 0:
print('Step #' + str(i+1))
print('Loss = ' + str(temp_loss)) # Create a mesh to plot points in
x_min, x_max = x_vals[:, 0].min() - 1, x_vals[:, 0].max() + 1
y_min, y_max = x_vals[:, 1].min() - 1, x_vals[:, 1].max() + 1
xx, yy = np.meshgrid(np.arange(x_min, x_max, 0.02),
np.arange(y_min, y_max, 0.02))
grid_points = np.c_[xx.ravel(), yy.ravel()]
grid_predictions = sess.run(prediction, feed_dict={x_data: rand_x,
y_target: rand_y,
prediction_grid: grid_points})
grid_predictions = grid_predictions.reshape(xx.shape) # Plot points and grid
plt.contourf(xx, yy, grid_predictions, cmap=plt.cm.Paired, alpha=0.8)
plt.plot(class1_x, class1_y, 'ro', label='I. setosa')
plt.plot(class2_x, class2_y, 'kx', label='I. versicolor')
plt.plot(class3_x, class3_y, 'gv', label='I. virginica')
plt.title('Gaussian SVM Results on Iris Data')
plt.xlabel('Pedal Length')
plt.ylabel('Sepal Width')
plt.legend(loc='lower right')
plt.ylim([-0.5, 3.0])
plt.xlim([3.5, 8.5])
plt.show() # Plot batch accuracy
plt.plot(batch_accuracy, 'k-', label='Accuracy')
plt.title('Batch Accuracy')
plt.xlabel('Generation')
plt.ylabel('Accuracy')
plt.legend(loc='lower right')
plt.show() # Plot loss over time
plt.plot(loss_vec, 'k-')
plt.title('Loss per Generation')
plt.xlabel('Generation')
plt.ylabel('Loss')
plt.show() # Evaluations on new/unseen data

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