利用千人基因组数据库查看SNP在不同地区、国家、洲的频率及个数
首先，进入千人基因组数据库的网站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/
如下图所示，在数据库的框框里输入我们感兴趣的SNP，比如rs608139
搜索后出现如下界面，黄色区域是我们感兴趣的SNP，红色框框是不同国家和地区在该SNP对应的频率和个数。
千人基因组数据库包括的国家和地区如下表所示。
|
国家 |
Continent |
Population (Abb) |
|
中国，北京 |
Asian |
CHB |
|
日本,东京 |
Asian |
JPT |
|
中国,南方 |
Asian |
CHS |
|
越南 |
Asian |
KHV |
|
来自英国的印度泰卢固语人 |
Asian |
ITU |
|
孟加拉 |
Asian |
BEB |
|
中国傣族，西双版纳 |
Asian |
CDX |
|
来自英国的斯里兰卡泰米尔人 |
Asian |
STU |
|
古吉拉特印度人，来自休斯敦，德克萨斯 |
Asian |
GIH |
|
巴基斯坦 |
Asian |
PJL |
|
秘鲁 |
South America |
PEL |
|
芬兰 |
Europe |
FIN |
|
美国洛杉矶人，墨西哥祖先 |
North America |
MXL |
|
犹他州(CEPH)，来自欧洲北部和西部的血统 |
North America （ Europe ancestry） |
CEU |
|
托斯卡尼 |
Europe |
TSI |
|
来自英国和苏格兰的英国人 |
Europe |
GBR |
|
来自麦德林的哥伦比亚人，哥伦比亚 |
South America |
CLM |
|
在西班牙的伊比利亚人 |
Europe |
IBS |
|
波多黎各 |
North America |
PUR |
|
非洲血统的美国人 |
North America(African Ancestry) |
ASW |
|
非洲加勒比地区 |
America |
ACB |
|
冈比亚人 |
Africa |
GWD |
|
埃桑人，尼日利亚 |
Africa |
ESN |
|
肯尼亚 |
Africa |
LWK |
|
在塞拉利昂（非洲）曼德人 |
Africa |
MSL |
|
约鲁巴人，尼日利亚 |
Africa |
YRI |
利用千人基因组数据库查看SNP在不同地区、国家、洲的频率及个数的更多相关文章
- 千人基因组计划数据库下载某段区域SNP
进入http://browser.1000genomes.org/index.html网站 假定要寻找“6:133098746-133108745”这段距离的SNP数据,“6”表示6号染色体,后面的数 ...
- 千人基因组（1000 Genomes）提取群体（population）或者样本（sample ID）信息
进入链接:http://www.internationalgenome.org/data-portal/sample 点击“filter by population”,在弹出的选择框里,选择想要下载的 ...
- 利用oneproxy部署mysql数据库的读写分离
实验系统:CentOS 6.6_x86_64 实验前提:防火墙和selinux都关闭 实验说明:本实验共有4台主机,IP分配如拓扑 实验软件:mariadb-10.0.20 oneproxy-rhel ...
- （转载）在Delphi中利用MSDASC来配置数据库链接
在Delphi中利用MSDASC来配置数据库链接 在运行期进行数据库的连接是一个问题,自己写一个窗体配置吧,数据库不一样,所用的参数也不一样,还有那讨厌的连接字符串,有时真不知该写什么好.那天无意中发 ...
- 利用EntityFramework获得双色球数据库
原文 利用EntityFramework获得双色球数据库 双色球想必大家都很熟悉了,尽管屡买屡不中,但还是会买.以前就想过利用双色球的走势图得到双色球的数据库,至于得到数据库干什么倒没想过,不过对以往 ...
- 利用RMAN恢复整个数据库
利用RMAN恢复整个数据库案例一 适合场合:恢复的目录一致,同时备份的过程中有归档日志 恢复的数据库目录和down机的数据库一致,还有一个就是RMAN备份的时候已经备份了归档日志. 备份脚本: run ...
- 开年巨制！千人千面回放技术让你“看到”Flutter用户侧问题
导语 发布app后,开发者最头疼的问题就是如何解决交付后的用户侧问题的还原和定位,是业界缺乏一整套系统的解决方案的空白领域,闲鱼技术团队结合自己业务痛点在flutter上提出一套全新的技术思路解决这个 ...
- 利用xtrabackup备份mysql数据库
利用xtrabackup备份mysql数据库 一.安装1.直接下载二进制文件wget http://www.percona.com/downloads/XtraBackup/XtraBackup-2. ...
- SQLServer2005利用维护计划自动备份数据库
经常性忘了给数据库备份,结果当数据库发生问题的时候,才发现备份是1个月以前的,那个后悔与懊恼还加惭愧啊,别提有对难受了.要认为的记住去备份比较难,每天事情又那么多,所以有了这个自动备份就不用愁了.先拷 ...
随机推荐
- Centos7.2下OpenVPN 环境完整部署记录
关于OpenVPN的有关介绍及为何使用OpenVPN在此就不做赘述了,下面直接记录Centos7.2系统下部署OpenVPN环境的操作过程: 1) 先将本机的yum换成阿里云的yum源 [root@t ...
- DRBD详细解说及配置过程记录
一.DRBD介绍 DRBD(Distributed ReplicatedBlock Device)是一种基于软件的,无共享,分布式块设备复制的存储解决方案,在服务器之间的对块设备(硬盘,分区,逻辑卷等 ...
- 保留最新N份备份目录脚本
如下所示,在/opt/backup下是备份目录,只需要保留最新的三份备份,在此之前的备份目录都要删除. [root@syslog-ng ~]# cd /opt/backup/ [root@syslog ...
- JackSon学习笔记(一)
概述 Jackson框架是基于Java平台的一套数据处理工具,被称为“最好的Java Json解析器”. Jackson框架包含了3个核心库:streaming,databind,annotation ...
- Echo团队便利记事本项目终审报告
一.团队成员简介 http://www.cnblogs.com/echo-buaa/p/3991968.html 二.团队项目的目标,预期的典型用户,预期的功能描述,预期的用户数量在哪里? 项目的目标 ...
- beta 答辩总结
评审表 编号 团队名称 项目名称 格式 内容 PPT 演讲 答辩 总分/100 1 天机组 指尖加密 14 13 13 13 13 66 2 PMS Your eyes 14 14 17 14 15 ...
- ASP.NET Forms验证
/// <summary> /// 执行用户登录操作 /// </summary> /// <param name="config">授权配置信 ...
- Expanded encryption and decryption signature algorithm SM2 & SM3
Expanded encryption and decryption signature algorithm supports multiple signature digest algorithms ...
- 安装wamp提示You dont't have permission to accesson on this server的解决方案
展示一下安装好的效果图 首先找到安装目录下的路径[wamp\bin\apache\Apache2.2.21\conf\] § 找到httpd.conf,用记事本打开httpd.conf,然后将 1. ...
- [书摘]图解HTTP 状态码
状态码类别: 1XX informational 信息性状态码 2XX Suess 成功状态码 3XX Redirection 重定向状态码 4XX Client error 客户端错误状态码 5 ...