vcf-query:

通过 vcf-query 提取DP (reads depth).

~/zengs/Tools/vcftools/perl/vcf-query -f '%CHROM\t%POS\t%REF\t%ALT\t%INFO/DP\n' my.vcf | awk '{if($1==1) print  $1"\t"$2"\t"$3"\t"$4"\t"$5 }'  > my.vcf.DP

　　

vcf-tools 笔记的更多相关文章

  1. Tools - 笔记记录方法Markdown

    Markdown 简介 轻量级标记语言,使用易读易写的纯文本格式和类似HTML的标记语法来编写具有一定的格式的文档. 语法简洁直观,易学易用,可以使用任何喜爱的文本编辑器来阅读和写作. 可精- 确控制 ...

  2. Learning ROS for Robotics Programming Second Edition学习笔记(二) indigo tools

    中文译著已经出版,详情请参考:http://blog.csdn.net/ZhangRelay/article/category/6506865 Learning ROS for Robotics Pr ...

  3. VMware workstation运维实践系列博客导航

    第一章:VMware workstation虚拟化1.1 VMware workstation计算网络存储介绍1.2 VMware workstation其他功能特性介绍1.3 VMware work ...

  4. ROCKETMQ源码分析笔记1：tools

    rocketmq源码解析笔记 大家好,先安利一下自己,本人男,35岁,已婚.目前就职于小资生活(北京),职位是开发总监. 姓名DaneBrown 好了.我保证本文绝不会太监!转载时请附上以上安利信息. ...

  5. Chrome development tools学习笔记(5)

    调试JavaScript 随着如今JavaScript应用的越来越广泛,在面对前端工作的时候,开发人员须要强大的调试工具来高速有效地解决这个问题.我们文章的主角,Chrome DevTools就提供了 ...

  6. Chrome development tools学习笔记(3)

    (上次DOM的部分做了些补充,欢迎查看Chrome development tools学习笔记(2)) 利用DevTools Elements工具来调试页面样式 CSS(Cascading Style ...

  7. Tools - 为知笔记

    为知笔记 Homepage Web登陆 帮助支持 功能 特色功能 发布到blog 便携版制作 模板 如何建立模板 下载为知笔记模版 Markdown http://www.wiz.cn/markdow ...

  8. 【Tools】Pro Git 一二章读书笔记

    记得知乎以前有个问题说:如果用一天的时间学习一门技能,选什么好?里面有个说学会Git是个很不错选择,今天就抽时间感受下Git的魅力吧.   Pro Git (Scott Chacon) 读书笔记:   ...

  9. 【转】树莓派学习笔记——I2C Tools 学习笔记

    原文网址:http://blog.csdn.net/xukai871105/article/details/15029843 1.安装     I2C驱动载入和速率修改请查看博文[树莓派学习笔记——I ...

  10. RH033读书笔记(9)-Lab 10 Understanding the Configuration Tools

    Lab 10 Understanding the Configuration Tools Sequence 1: Configuring the Network with system-config- ...

随机推荐

  1. springMVC文件上传大小超过限制的问题

    [转自]https://my.oschina.net/ironwill/blog/646762 springMVC是一个非常方便的web层框架,我们使用它的文件上传也非常的方便. 我们通过下面的配置来 ...

  2. UVa 753 - A Plug for UNIX（最大流）

    链接: https://uva.onlinejudge.org/index.php?option=com_onlinejudge&Itemid=8&page=show_problem& ...

  3. BZOJ2822:[AHOI2012]树屋阶梯(卡特兰数,高精度)

    Description 暑假期间,小龙报名了一个模拟野外生存作战训练班来锻炼体魄,训练的第一个晚上,教官就给他们出了个难题.由于地上露营湿气重,必须选择在高处的树屋露营.小龙分配的树屋建立在一颗高度为 ...

  4. wampserver的安装与配置

    一.安装:wamp的安装很简单,只需要按照提示并根据自己的需求操作即可,这里不再赘述. 二.配置:wamp安装完后,需进行如下配置才能正常工作. 1.修改MySQL的登录密码 (1)启动WampSer ...

  5. es6的解构赋值

    分类:数组.对象.字符串.布尔值.函数参数.数值解构赋值

  6. 手工检测SQL注入（安全性测试）

    手动你的ASP站可否注入: http://127.0.0.1/xx?id=11 and 1=1 (正常页面) http://127.0.0.1/xx?id=11 and 1=2 (出错页面) 检测表段 ...

  7. HDU 1789 Doing Homework again（非常经典的贪心）

    Doing Homework again Time Limit: 1000/1000 MS (Java/Others)    Memory Limit: 32768/32768 K (Java/Oth ...

  8. java文件系统中的的NIO与IO

    java从jdk1.4后就引入了java NIO机制: NIO的显著特点就是通道(channel).缓冲(buffer).选择器(selector),NIO机制中添加了传统I/O机制中没有的非阻塞调用 ...

  9. iOS之改变UIAlertViewController字体的颜色

    NSString *message = @"请确认信息是否正确?"; NSString *title = @"提示"; UIAlertController *a ...

  10. GPUImage源码解读之GPUImageContext

    GPUImageContext类,提供OpenGL ES基本上下文,GPUImage相关处理线程,GLProgram缓存.帧缓存.由于是上下文对象,因此该模块提供的更多是存取.设置相关的方法. 属性列 ...