[noi1760]SAM

1 #include<bits/stdc++.h>
2 using namespace std;
3 #define N 2000005
4 #define L (k<<1)
5 #define R (L+1)
6 #define mid (l+r>>1)
7 vector<int>v[N];
8 int V,las,n,nex[N],len[N],mn[N],ch[N][2],f[N<<2];
9 char s[N];
10 void add(int c){
11 int p=las,np=las=++V;
12 len[np]=len[p]+1;
13 while ((p)&&(!ch[p][c])){
14 ch[p][c]=np;
15 p=nex[p];
16 }
17 if (!p)nex[np]=1;
18 else{
19 int q=ch[p][c];
20 if (len[q]==len[p]+1)nex[np]=q;
21 else{
22 int nq=++V;
23 len[nq]=len[p]+1;
24 nex[nq]=nex[q];
25 nex[q]=nex[np]=nq;
26 memcpy(ch[nq],ch[q],sizeof(ch[q]));
27 while ((p)&&(ch[p][c]==q)){
28 ch[p][c]=nq;
29 p=nex[p];
30 }
31 }
32 }
33 }
34 void dfs(int k){
35 for(int i=0;i<v[k].size();i++){
36 dfs(v[k][i]);
37 mn[k]=min(mn[k],mn[v[k][i]]);
38 }
39 }
40 void down(int k){
41 f[L]=min(f[L],f[k]);
42 f[R]=min(f[R],f[k]);
43 }
44 void update(int k,int l,int r,int x,int y,int z){
45 if ((l>y)||(x>r))return;
46 if ((x<=l)&&(r<=y)){
47 f[k]=min(f[k],z);
48 return;
49 }
50 update(L,l,mid,x,y,z);
51 update(R,mid+1,r,x,y,z);
52 }
53 void query(int k,int l,int r){
54 if (l==r){
55 printf("%d\n",max(l-f[k],0));
56 return;
57 }
58 down(k);
59 query(L,l,mid);
60 query(R,mid+1,r);
61 }
62 int main(){
63 scanf("%s",s);
64 n=strlen(s);
65 V=las=1;
66 memset(mn,0x3f,sizeof(mn));
67 for(int i=0;i<n;i++){
68 add(s[i]-'0');
69 mn[las]=i;
70 }
71 for(int i=2;i<=V;i++)v[nex[i]].push_back(i);
72 dfs(1);
73 memset(f,0x3f,sizeof(f));
74 for(int i=0,j=0,k=1;i<n;j=max(j,++i)){
75 for(;(j<n)&&(mn[ch[k][s[j]-'0']]<i);k=ch[k][s[j++]-'0']);
76 if (i<j)update(1,1,n,i+1,j,i);
77 if ((k>1)&&(j-i-1<=len[nex[k]]))k=nex[k];
78 }
79 query(1,1,n);
80 }
[noi1760]SAM的更多相关文章
- SAM初探
SAM,即Suffix Automaton,后缀自动机. 关于字符串有很多玩法,有很多算法都是围绕字符串展开的.为什么?我的理解是:相较于数字组成的序列,字母组成的序列中每个单位上元素的个数是有限的. ...
- bzoj4199:NOI2015D2T2品酒大会(SAM版)
SAM感觉写起来比SA更直观(?) #include <iostream> #include <cstdio> #include <cstring> #includ ...
- SAM/BAM文件处理
当测序得到的fastq文件map到基因组之后,我们通常会得到一个sam或者bam为扩展名的文件.SAM的全称是sequence alignment/map format.而BAM就是SAM的二进制文件 ...
- hihocoder SAM基础概念
后缀自动机一·基本概念 时间限制:10000ms 单点时限:1000ms 内存限制:256MB 描述 小Hi:今天我们来学习一个强大的字符串处理工具:后缀自动机(Suffix Automaton,简称 ...
- bam/sam格式说明
在SAM输出的结果中每一行都包括十二项通过Tab分隔,从左到右分别是: 1 序列的名字(Read的名字) 2 概括出一个合适的标记,各个数字分别代表 1 序列是一对序列中的一个 2 比 ...
- mismatch位置(MD tag)- sam/bam格式解读进阶
这算是第二讲了,前面一讲是:Edit Distance编辑距离(NM tag)- sam/bam格式解读进阶 MD是mismatch位置的字符串的表示形式,貌似在call SNP和indel的时候会用 ...
- Edit Distance编辑距离(NM tag)- sam/bam格式解读进阶
sam格式很精炼,几乎包含了比对的所有信息,我们平常用到的信息很少,但特殊情况下,我们会用到一些较为生僻的信息,关于这些信息sam官方文档的介绍比较精简,直接看估计很难看懂. 今天要介绍的是如何通过b ...
- pysam - 多种格式基因组数据(sam/bam/vcf/bcf/cram/…)读写与处理模块(python)
在开发基因组相关流程或工具时,经常需要读取.处理和创建bam.vcf.bcf文件.目前已经有一些主流的处理此类格式文件的工具,如samtools.picard.vcftools.bcftools,但此 ...
- SAM格式 及 比对工具之 samtools 使用方法
参考资料: SAMtools(官网) SAM Spec v1.4 (SAM格式 说明书) (重要) samtools-1.3.1 使用手册 (SAMtools软件说明书) samtools常用命令详解 ...
随机推荐
- asp.net core使用identity+jwt保护你的webapi(三)——refresh token
前言 上一篇已经介绍了identity的注册,登录,获取jwt token,本篇来完成refresh token. 开始 开始之前先说明一下为什么需要refresh token. 虽然jwt toke ...
- LeetCode352 将数据流变为多个不相交区间
LeetCode352 将数据流变为多个不相交区间 1 题目 给你一个由非负整数 a1, a2, ..., an 组成的数据流输入,请你将到目前为止看到的数字总结为不相交的区间列表. 实现 Summa ...
- Min_25筛 学习小记
前言 为什么叫学习小记呢?因为暂时除了模板题就没有做其他的东西了.(雾 这个东西折磨了我一整天,看得我身不如死,只好结合代码理解题解,差点死在机房.(话说半天综合半天竞赛真是害人不浅) 为了以后忘了再 ...
- 【java】关键字this怎么用?
摘至:https://www.php.cn/java/guide/462643.html java中this关键字的用法:1.当成员变量和局部变量重名时,在方法中使用this时,表示的是该方法所在类中 ...
- 什么是Spring,SpringMVC,SpringBoot,SpringCloud?通俗易懂
Spring是一个轻量级的控制反转(IoC)和面向切面(AOP)的容器框架.Spring使你能够编写更干净.更可管理.并且更易于测试的代码. Spring MVC是Spring的一个模块,一个web框 ...
- 在 Windows 10 上安装 Coq 库 Mathematical Components
初学 Coq 时看的是 Mathematical Components 这本书,它自带了一个 Coq 的库,这是它的安装教程 这个库的安装要用到 OCaml Package Manager (OPAM ...
- DDL_Killer Alpha版本 Bug集中反馈处
本博客用于DDL_Killer Alpha版本的Bug集中反馈. 您可以在本博客的下方评论区处留言,反馈您在使用DDl_Killer的过程中遇到的问题,以帮助我们更好的改进本产品. 我们会尽快修复找到 ...
- python +spatialite + window 解决方案(https://www.jianshu.com/p/5bc7d8b7b429)
运行环境在windows 10 64bit.先将python安装完成.然后,到 spatilite官网 找到MS(即Microsoft)版本,下载64位的mod_spatialite,将其先解压到目标 ...
- 计算机网络之传输层(传输层提供的服务及功能概述、端口、套接字--Socket、无连接UDP和面向连接TCP服务)
文章转自:https://blog.csdn.net/weixin_43914604/article/details/105451022 学习课程:<2019王道考研计算机网络> 学习目的 ...
- Celery Task(定时任务)及参数
celery beat 是一个调度器:它以常规的时间间隔开启任务,任务将会在集群中的可用节点上运行. 默认情况下,入口项是从 beat_schedule 设置中获取,但是自定义的存储也可以使用,例如在 ...