生命组学

DNA序列改变的分子基础

变异来源

据研究对象,可分为两类mutation:个体上的变异和群体上的变异,群体上的变异是关联研究,eg喝酒人群vs非喝酒人群相比。

造成mutation的三类机制:

1.DNA复制:DNA复制酶错误

DNA复制 instrinsic polymerase errors

Activities of error-prone polymerase:修复时跳过损伤

2.DNA损伤

Endogenously induced DNA damages。

Endogenously induced damages:植物比动物暴露在紫外线中时间更长,所以对于紫外线损伤十分强。

3.Repair mechanism:

Global repair:从复制起点开始修复。

Recombination:eg:Cluster 中掉入gene会被破坏

TCR repair:Translesion 是修复时跳过损伤

不同损伤类型:Base excision repair| mismatch|nucleotide excision repair

DNA损伤与修复之间的关系是损伤之后的行为:stop复制|不再复制|改变transport|repair。

不同损伤可导致不同修复:原因--损伤--修复

受精卵发育整个过程中的mutation,即De novo mutation,缩写DNM。

影响因素:parents age|a parent variety|both parental haplotype单倍体中存在|mosaicism嵌合体中存在|父系单倍体比母系单倍体mutation高。

Mutation|DNM|的更多相关文章

  1. HTML5新特性之Mutation Observer

    Mutation Observer(变动观察器)是监视DOM变动的接口.当DOM对象树发生任何变动时,Mutation Observer会得到通知. 要概念上,它很接近事件.可以理解为,当DOM发生变 ...

  2. 使用HTML5新特性Mutation Observer实现编辑器的撤销和撤销回退操作

     MutationObserver介绍 MutationObserver给开发者们提供了一种能在某个范围内的DOM树发生变化时作出适当反应的能力.该API设计用来替换掉在DOM3事件规范中引入的Mut ...

  3. Leetcode: Minimum Genetic Mutation

    A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...

  4. 转: HTML5新特性之Mutation Observer

    转: HTML5新特性之Mutation Observer Mutation Observer是什么 Mutation Observer(变动观察器)是监视DOM变动的接口.当DOM对象树发生任何变动 ...

  5. Detailed Information for Outputted Files from Somatic Mutation Annotators(annovar 注释文件条目详细解释)

    CONTENTS *_annoTable.txt (ANNOVAR) *_annoTable.txt (SnpEff) *_genelist.txt (ANNOVAR & SnpEff) db ...

  6. [LeetCode] Minimum Genetic Mutation 最小基因变化

    A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...

  7. ASP.NET Core中使用GraphQL - 第七章 Mutation

    ASP.NET Core中使用GraphQL - 目录 ASP.NET Core中使用GraphQL - 第一章 Hello World ASP.NET Core中使用GraphQL - 第二章 中间 ...

  8. [Swift]LeetCode433. 最小基因变化 | Minimum Genetic Mutation

    A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...

  9. 1244. Minimum Genetic Mutation

    描述 A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", ...

随机推荐

  1. 《新标准C++程序设计》3.1.1-3.1.3(C++学习笔记5)

    构造函数 1.构造函数的概念和作用 (1)概念 构造函数就是一类特殊的成员函数,其名字和类一样,不写返回值类型(void也不可以写),可以有参数,可以重载. 如果定义类时没写构造函数,则编译器生成一个 ...

  2. Essay写作“短路”怎么办?

    有些留学生在完成essay写作过程中可能会短路,写着写着不知道自己在写什么,或者是直接动不了笔了,这种情况下应该怎么办呢?下面Australiaway小编就跟同学们分享一些比较有用的方法,希望可以帮到 ...

  3. 吴裕雄--天生自然 PHP开发学习:PHP编程基础知识

    <?php $x=5; $y=6; $z=$x+$y; echo $z; ?> <?php $txt="Hello world!"; $x=5; $y=10.5; ...

  4. spring boot输入数据校验(validation)

    Spring Boot 集成教程 Spring Boot 介绍 Spring Boot 开发环境搭建(Eclipse) Spring Boot Hello World (restful接口)例子 sp ...

  5. [极客大挑战 2019]FinalSQL

    0x00 知识点 盲注 0x01 解题 根据题目提示盲注,随便点几下找到注入点 发现我们输入^符号成功跳转页面,证明存在注入 1^(ord(substr((select(group_concat(sc ...

  6. 建立更可靠的OOP程序-类和成员的访问控制

    1. public 成员(公共成员) (1)使用this 关键字的类的成员允许在任何地方被访问. (2)使用 prototype 定义的属性和方法都是公共成员. 这些属性和方法可以在外面任何地方被访问 ...

  7. 51nod 1421:最大MOD值

    1421 最大MOD值 题目来源: CodeForces 基准时间限制:1 秒 空间限制:131072 KB 分值: 80 难度:5级算法题 有一个a数组,里面有n个整数.现在要从中找到两个数字(可以 ...

  8. kube-proxy详解

    KUBE_LOGTOSTDERR="--logtostderr=true"KUBE_LOG_LEVEL="--v=4"NODE_HOSTNAME="- ...

  9. 14. react 基础 redux 的编写 TodoList 功能

    1. 安装 redux 监听工具 ( 需要翻墙 ) 打开 谷歌商店 搜索 redux devtool 安装第一个即可 2. 安装 redux yarn add redux 3. 创建 一个 store ...

  10. CTF -攻防世界-web高手区-mfw

    ---恢复内容开始--- 昂,我很菜这是网上大神的教程. https://blog.csdn.net/silence1_/article/details/89741733 ---恢复内容结束---