Mutation|DNM|
生命组学
DNA序列改变的分子基础
变异来源
据研究对象,可分为两类mutation:个体上的变异和群体上的变异,群体上的变异是关联研究,eg喝酒人群vs非喝酒人群相比。
造成mutation的三类机制:


1.DNA复制:DNA复制酶错误
DNA复制 instrinsic polymerase errors
Activities of error-prone polymerase:修复时跳过损伤
2.DNA损伤
Endogenously induced DNA damages。
Endogenously induced damages:植物比动物暴露在紫外线中时间更长,所以对于紫外线损伤十分强。
3.Repair mechanism:
Global repair:从复制起点开始修复。
Recombination:eg:Cluster 中掉入gene会被破坏
TCR repair:Translesion 是修复时跳过损伤
不同损伤类型:Base excision repair| mismatch|nucleotide excision repair
DNA损伤与修复之间的关系是损伤之后的行为:stop复制|不再复制|改变transport|repair。
不同损伤可导致不同修复:原因--损伤--修复
受精卵发育整个过程中的mutation,即De novo mutation,缩写DNM。

影响因素:parents age|a parent variety|both parental haplotype单倍体中存在|mosaicism嵌合体中存在|父系单倍体比母系单倍体mutation高。
Mutation|DNM|的更多相关文章
- HTML5新特性之Mutation Observer
Mutation Observer(变动观察器)是监视DOM变动的接口.当DOM对象树发生任何变动时,Mutation Observer会得到通知. 要概念上,它很接近事件.可以理解为,当DOM发生变 ...
- 使用HTML5新特性Mutation Observer实现编辑器的撤销和撤销回退操作
MutationObserver介绍 MutationObserver给开发者们提供了一种能在某个范围内的DOM树发生变化时作出适当反应的能力.该API设计用来替换掉在DOM3事件规范中引入的Mut ...
- Leetcode: Minimum Genetic Mutation
A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...
- 转: HTML5新特性之Mutation Observer
转: HTML5新特性之Mutation Observer Mutation Observer是什么 Mutation Observer(变动观察器)是监视DOM变动的接口.当DOM对象树发生任何变动 ...
- Detailed Information for Outputted Files from Somatic Mutation Annotators(annovar 注释文件条目详细解释)
CONTENTS *_annoTable.txt (ANNOVAR) *_annoTable.txt (SnpEff) *_genelist.txt (ANNOVAR & SnpEff) db ...
- [LeetCode] Minimum Genetic Mutation 最小基因变化
A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...
- ASP.NET Core中使用GraphQL - 第七章 Mutation
ASP.NET Core中使用GraphQL - 目录 ASP.NET Core中使用GraphQL - 第一章 Hello World ASP.NET Core中使用GraphQL - 第二章 中间 ...
- [Swift]LeetCode433. 最小基因变化 | Minimum Genetic Mutation
A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", &qu ...
- 1244. Minimum Genetic Mutation
描述 A gene string can be represented by an 8-character long string, with choices from "A", ...
随机推荐
- EF Core的安装及入门
一.环境准备 1.开发环境:.NET Core 3.1 2.IDE工具:Visual Studio 2019 3.数据库:SQL Server 2012 二.EF Core的安装 1.新建一个项目,如 ...
- Linux 压缩解压操作
Linux 压缩解压操作 Linux解压文件到指定目录 tar在Linux上是常用的打包.压缩.加压缩工具,他的参数很多,折里仅仅列举常用的压缩与解压缩参数 参数:-c :create 建立压缩档案的 ...
- core_cm4.h(129): error: #35: #error directive: "Compiler generates FPU instructions for a device without an FPU (check __FPU_PRESENT)"
今天使用 systick 的时候,只使用了头文件 core_cm4.h,结果就报错了,原因是 __FPU_PRESENT 没有定义,这个定义其实在 stm32f4xx.h 里面.所以如果要解决这个错误 ...
- EXCEL排序(hdu 1862)
其实这个题吧,就是发出来玩玩,会用sort就很easy了,有一个小小的知识点:比较字符串字典序的大小用strcmp函数. strcmp(a,b)<0说明a的字典序小于b的字典序. 上题: Inp ...
- SpringCloud学习之手把手教你用IDEA搭建入门项目(二)
本篇博客是承接上一篇<手把手教你用IDEA搭建SpringCloud入门项目(一)>,不清楚的请到我的博客空间查看后再看本篇博客 1)先创建一个Eureka服务注册中心模块,用来作为服务的 ...
- JDBC,ResultSet对像多次使用后再关闭的问题
原文链接:https://yq.aliyun.com/wenzhang/show_111763 问题描述 //代码... ResultSet rs = this.conn.prepareStateme ...
- Django1.11模型类数据库操作
django模型类数据库操作 数据库操作 添加数据 1,创建类对象,属性赋值添加 book= BookInfo(name='jack',pub_date='2010-1-1') book.save() ...
- 关于debug模式下对象toString报空指针的问题。Method threw 'java.lang.NullPointerException' exception. Cannot evaluate cn.gooday.jsh.service.common.dto.RestControllerResult.toString()
这个如果debug的时候可以一步步走到正常return或者运行的时候有正确返回值.说明代码是没问题的. 出现这个的原因是dto对象里有一些字段查出来是空的,或者这个字段本来在dto里就是冗余字段. 因 ...
- uWSGI调整buffer-size
https://uwsgi-docs.readthedocs.io/en/latest/Options.html#buffer-size buffer-size argument: required_ ...
- Java线程——线程习题(二)生成者消费者
生产者消费者问题是线程模型中的经典问题:生产者和消费者在同一时间段内共用同一存储空间,生产者向空间里生产数据,而消费者取走数据. 这里实现如下情况的生产--消费模型: 生产者不断交替地生产两组数据“姓 ...