生命组学

DNA序列改变的分子基础

变异来源

据研究对象,可分为两类mutation:个体上的变异和群体上的变异,群体上的变异是关联研究,eg喝酒人群vs非喝酒人群相比。

造成mutation的三类机制:

1.DNA复制:DNA复制酶错误

DNA复制 instrinsic polymerase errors

Activities of error-prone polymerase:修复时跳过损伤

2.DNA损伤

Endogenously induced DNA damages。

Endogenously induced damages:植物比动物暴露在紫外线中时间更长,所以对于紫外线损伤十分强。

3.Repair mechanism:

Global repair:从复制起点开始修复。

Recombination:eg:Cluster 中掉入gene会被破坏

TCR repair:Translesion 是修复时跳过损伤

不同损伤类型:Base excision repair| mismatch|nucleotide excision repair

DNA损伤与修复之间的关系是损伤之后的行为:stop复制|不再复制|改变transport|repair。

不同损伤可导致不同修复:原因--损伤--修复

受精卵发育整个过程中的mutation,即De novo mutation,缩写DNM。

影响因素:parents age|a parent variety|both parental haplotype单倍体中存在|mosaicism嵌合体中存在|父系单倍体比母系单倍体mutation高。

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