http://blog.163.com/bioinfor_cnu/blog/static/19446223720118205527863/
所有文章:http://blog.163.com/bioinfor_cnu/blog/#m=0
1. 成对HMM用于双序列比对的基本思想:

2. 状态转移矩阵:

3. 成对HMM的完整描述:

 

4. 成对HMM的Viterbi算法:

成对HMM(Pair HMMs)用于双序列比对--转载的更多相关文章

  1. 72. Edit Distance(困难,确实挺难的,但很经典,双序列DP问题)

    Given two words word1 and word2, find the minimum number of steps required to convert word1 to word2 ...

  2. python中的enumerate函数用于遍历序列中的元素以及它们的下标

    enumerate 函数用于遍历序列中的元素以及它们的下标: >>> for i,j in enumerate(('a','b','c')): print i,j 0 a1 b2 c ...

  3. sql把表格拼成字符串,多半使用于GROUP BY

    --假定要聚合的字段是id ,要统计的字段是tname --select a.tname from @T1 a for xml path('row') select id,REPLACE(replac ...

  4. Python 内建的filter()函数用于过滤序列。

    例如,在一个list中,删掉偶数,只保留奇数,可以这么写: def is_odd(n): return n % 2 == 1 list(filter(is_odd, [1, 2, 4, 5, 6, 9 ...

  5. 将HTML5封装成android应用APK文件的几种方法(转载)

    越来越多的开发者热衷于使用html5+JavaScript开发移动Web App.不过,HTML5 Web APP的出现能否在未来取代移动应用,就目前来说,还是个未知数.一方面,用户在使用习惯上,不喜 ...

  6. python3 基础数据类型

    一.基础数据类型分类 python的数据类型主要包括以下几种: 1.数字 2.字符串 3.列表 4.字典 5.元组 6.集合 1.数字 int 数字主要是用于计算用的,使用方法并不多 #bit_len ...

  7. 6专题总结-动态规划dynamic programming

    专题6--动态规划 1.动态规划基础知识 什么情况下可能是动态规划?满足下面三个条件之一:1. Maximum/Minimum -- 最大最小,最长,最短:写程序一般有max/min.2. Yes/N ...

  8. 隐马尔科夫模型HMM(四)维特比算法解码隐藏状态序列

    隐马尔科夫模型HMM(一)HMM模型 隐马尔科夫模型HMM(二)前向后向算法评估观察序列概率 隐马尔科夫模型HMM(三)鲍姆-韦尔奇算法求解HMM参数 隐马尔科夫模型HMM(四)维特比算法解码隐藏状态 ...

  9. HMM XSS检测

    HMM XSS检测 转自:http://www.freebuf.com/articles/web/133909.html 前言 上篇我们介绍了HMM的基本原理以及常见的基于参数的异常检测实现,这次我们 ...

随机推荐

  1. MySQL主从复制(Replication for Backup)

    环境:MySQL5.7,VMware-Workstation-12-Pro,Windows-10,CentOS-7.5,Xshell5 1. 基本概念和操作思路 主从复制能做什么 数据库的主从复制,是 ...

  2. PAT 1070 Mooncake[一般]

    1070 Mooncake (25)(25 分) Mooncake is a Chinese bakery product traditionally eaten during the Mid-Aut ...

  3. 安装selenium python

    https://pypi.org/project/selenium/#files selenium-3.13.0-py2.py3-none-any.whl 安装成功后才能用 from selenium ...

  4. AspxGridView点滴

    1:页码设置 1>: <SettingsPager Summary-Text="当前第 {0} 页 总共 {1} 页 ({2} 条记录)"></Settin ...

  5. Qt addStretch()详解

    addStretch函数,是在布局的时候用到. 函数原型: void QBoxLayout::addStretch ( int stretch = 0 ) 作用:平均分配Layout 比如: QVBo ...

  6. vmware tool安装

    https://www.vmware.com/support/ws55/doc/ws_newguest_tools_linux.html VMware Workstation 5.5 Features ...

  7. Linux服务器配置---ssh配置

    Ssh配置     通过配置文件,我们可以有效的管理ssh 1.空闲时间关闭连接 1)修改配置文件“/etc/ssh/sshd_config”,设置clientAliveInterval和client ...

  8. java android 环境变量配置备忘录

    java android 环境变量配置备忘录,全新重装系统要用到,备忘下来; JAVA_HOME D:\Java\jdk1.6.0_07 CLASSPATH  .;%JAVA_HOME%\lib\dt ...

  9. python3.4学习笔记(十一) 列表、数组实例

    python3.4学习笔记(十一) 列表.数组实例 #python列表,数组类型要相同,python不需要指定数据类型,可以把各种类型打包进去#python列表可以包含整数,浮点数,字符串,对象#创建 ...

  10. Maven的scope的值

    Maven的依赖范围 在pom.xml文件中,有个元素是scope,用来表示依赖的范围.之所以会有依赖范围,是因为Maven在编译.测试和运行项目时会各自使用一套classpath,依赖范围就是用来控 ...