http://blog.163.com/bioinfor_cnu/blog/static/19446223720118205527863/
所有文章:http://blog.163.com/bioinfor_cnu/blog/#m=0
1. 成对HMM用于双序列比对的基本思想:

2. 状态转移矩阵:

3. 成对HMM的完整描述:

 

4. 成对HMM的Viterbi算法:

成对HMM(Pair HMMs)用于双序列比对--转载的更多相关文章

  1. 72. Edit Distance(困难,确实挺难的,但很经典,双序列DP问题)

    Given two words word1 and word2, find the minimum number of steps required to convert word1 to word2 ...

  2. python中的enumerate函数用于遍历序列中的元素以及它们的下标

    enumerate 函数用于遍历序列中的元素以及它们的下标: >>> for i,j in enumerate(('a','b','c')): print i,j 0 a1 b2 c ...

  3. sql把表格拼成字符串,多半使用于GROUP BY

    --假定要聚合的字段是id ,要统计的字段是tname --select a.tname from @T1 a for xml path('row') select id,REPLACE(replac ...

  4. Python 内建的filter()函数用于过滤序列。

    例如,在一个list中,删掉偶数,只保留奇数,可以这么写: def is_odd(n): return n % 2 == 1 list(filter(is_odd, [1, 2, 4, 5, 6, 9 ...

  5. 将HTML5封装成android应用APK文件的几种方法(转载)

    越来越多的开发者热衷于使用html5+JavaScript开发移动Web App.不过,HTML5 Web APP的出现能否在未来取代移动应用,就目前来说,还是个未知数.一方面,用户在使用习惯上,不喜 ...

  6. python3 基础数据类型

    一.基础数据类型分类 python的数据类型主要包括以下几种: 1.数字 2.字符串 3.列表 4.字典 5.元组 6.集合 1.数字 int 数字主要是用于计算用的,使用方法并不多 #bit_len ...

  7. 6专题总结-动态规划dynamic programming

    专题6--动态规划 1.动态规划基础知识 什么情况下可能是动态规划?满足下面三个条件之一:1. Maximum/Minimum -- 最大最小,最长,最短:写程序一般有max/min.2. Yes/N ...

  8. 隐马尔科夫模型HMM(四)维特比算法解码隐藏状态序列

    隐马尔科夫模型HMM(一)HMM模型 隐马尔科夫模型HMM(二)前向后向算法评估观察序列概率 隐马尔科夫模型HMM(三)鲍姆-韦尔奇算法求解HMM参数 隐马尔科夫模型HMM(四)维特比算法解码隐藏状态 ...

  9. HMM XSS检测

    HMM XSS检测 转自:http://www.freebuf.com/articles/web/133909.html 前言 上篇我们介绍了HMM的基本原理以及常见的基于参数的异常检测实现,这次我们 ...

随机推荐

  1. 你知道Windows和WordPress上帝模式吗?

    一.Windows 上帝模式 这个玩意出来很久很久了,估计不用多说,知道的同学还是挺多的,不知道的也只要百度一下,你就知道了. 方法很简单,在 Windows 系统任何地方新建一个文件夹,如下命名即可 ...

  2. Spark DataFrame vector 类型存储到Hive表

    1. 软件版本 软件 版本 Spark 1.6.0 Hive 1.2.1 2. 场景描述 在使用Spark时,有时需要存储DataFrame数据到Hive表中,一般的存储方式如下: // 注册临时表 ...

  3. docker搭建本地仓库并制作自己的镜像

    原文地址https://blog.csdn.net/junmoxi/article/details/80004796 1. 搭建本地仓库1.1 下载仓库镜像1.2 启动仓库容器2. 在CentOS容器 ...

  4. Java读取Excel数据

    Java读取Excel数据,解析文本并格式化输出 Java读取Excel数据,解析文本并格式化输出 Java读取Excel数据,解析文本并格式化输出 下图是excel文件的路径和文件名 下图是exce ...

  5. Windows2008 IIS配置FTP站点

    视频教程:http://vodcdn.video.taobao.com/player/ugc/tb_ugc_pieces_core_player_loader.swf?version=1.0.2015 ...

  6. smali过滤特定字符串

    过滤插入代码: const-string/jumbo v0, "aaaaaaa" invoke-static {v0}, Lcom/bihu/insurancerobot/util ...

  7. tfs使用流程

    1.用邮箱注册个微软账号,如zhangsan@outlook.com等邮箱 2.管理员会添加此用户zhangsan@outlook.com 3.打开vs,team-tfs-connect to ser ...

  8. bzoj2733: [HNOI2012]永无乡 启发式合并

    地址:http://www.lydsy.com/JudgeOnline/problem.php?id=2733 题目: 2733: [HNOI2012]永无乡 Time Limit: 10 Sec   ...

  9. python 有道翻译

    import requests import time import random import hashlib i = str(int(time.time()*1000)+random.randin ...

  10. 第八篇:支持向量机 (SVM)分类器原理分析与基本应用

    前言 支持向量机,也即SVM,号称分类算法,甚至机器学习界老大哥.其理论优美,发展相对完善,是非常受到推崇的算法. 本文将讲解的SVM基于一种最流行的实现 - 序列最小优化,也即SMO. 另外还将讲解 ...