只有这个算法思想比较对,其他 的都没有一开始的remove: 原网址:http://www.shahuwang.com/?p=1021

Canopy Clustering 这个算法是2000年提出来的,此后与Hadoop配合,已经成为一个比较流行的算法了。确切的说,这个算法获得的并不是最终结果,它是为其他算法服务的,比如k-means算法。它能有效地降低k-means算法中计算点之间距离的复杂度。Mahout中已经实现了这个算法,不知道其他的机器学习类库和工具中,有多少是实现了这个算法的。感觉上这个算法要实现不难,难在和Hadoop如何结合上。Hadoop完全不懂,这里我就不说那么多了。

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首先,我觉得很有必要看一个图先,这个图很好得展示了Canopy聚类的过程。图来自http://picksesame.blogspot.com/2011/05/canopy-clustering.html 可能要FQ。

图中有一个T1,一个T2,我们称之为距离阀值,显然T1>T2,这两个值有什么用呢?我们先确定了一个中心,然后计算其他点到这个中心间的距离,当距离大于T1时,小于T1大于T2时,小于T2时,对这个点的处理都是不一样的。http://micahlabrams.blogspot.com/2011/10/canopy-clustering.html 这篇文章提供了一个很好的伪代码,我觉得看完之后,加上我稍加的解释,就能明白canopy聚类的实现过程了:

while D is not empty





      select element d from D to initialize canopy c





      remove d from D





      Loop through remaining elements in D





           if distance between d_i and c < T1 : add element to the canopy c





           if distance between d_i and c < T2 : remove element from D





      end





      add canopy c to the list of canopies C





end

这里有几点要说明的:D指代一组数据,d_i表示D中的各个数据。

是不是还不够明白?下面用中文进行说明:

1:给我一组存放在数组里面的数据D

2:给我两个距离阈值T1,T2,且T1>T2

3:随机取D中的一个数据d作为中心,并将d从D中移除

4:计算D中所有点到d的距离distance

5:将所有distance<T1的点都归如到d为中心的canopy1类中(注意哦,小于T2的也是小于T1的,所以也是归入到canopy1中的哦)

6:将所有distance<T2的点,都从D中移除。(这一步很关键的,你回去看上面那个图,就明白了)

7:重复步骤4到6,直到D为空,形成多个canopy类

通过上面的描述,能理解T1和T2的作用了否?当与中心的距离大于T1时,这些点就不会被归入到中心所在的这个canopy类中。然当距离小于T1大于T2时,这些点会被归入到该中心所在的canopy中,但是它们并不会从D中被移除,也就是说,它们将会参与到下一轮的聚类过程中,成为新的canopy类的中心或者成员。亦即,两个Canopy类中有些成员是重叠的。这是canopy比较关键和高明的地方了,当然内在的高明之处我也讲不出来,水平不够。而当距离小于T2的时候,这些点就会被归入到该中心的canopy类中,而且会从D中被移除,也就是不会参加下一次的聚类过程了。

不知道现在能明白了否?

如果需要用Python利用Hadoop实现canopy的话,可以参考这篇文章http://atbrox.com/2010/02/08/parallel-machine-learning-for-hadoopmapreduce-a-python-example/ 暂时我是理解不了这篇文章先。如果你会,希望能教一下我。

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