【python】文件处理行与行之间的内容
在处理文本文件时,很多时候需要我们处理跨行的数据,但是用for循环处理不是很方便,想了一个歪招来处理不是很大的数据。
核心思想就是将上一行的东西存在一个列表里,到下一行用完这个数据在循环体里将列表初始化,再将这行数据存到列表里,这样循环就可以把两行数据联系起来。
另外这样做的还有另外一个好处,就是可以初始化第一行,我们可以通过判断这个“传递列表”空与否来区分标题行的输入和其他循环体的输入情况。
from __future__ import division
from sys import argv
from itertools import islice
Mutation = open('DivFile_sort_chr' + argv[1] +'.txt',"r")
REC = open('GeneticMap_Chr' + argv[1],"r")
RECList = open('REC_Chr_' + argv[1], "a")
transList = []
SNPPosList = []
rholist = []
for lines in islice(Mutation, 1, None):
line = lines.strip('\n').split("\t")
POS = line[0]
SNPPosList.append(POS)
print "SNPPos done"
for lines in islice(REC, 1, None):
line = lines.strip('\n').split("\t")
if transList == []:
transList.append((line[0],line[1]))
RECList.write("position\trate\n")
RECList.write('%s\t%s\n' %(line[0],0))
print "headline"
else:
rho = (float(line[1]) - float(transList[0][1])) / (float(line[0]) - float(transList[0][0]))
for i in SNPPosList:
if int(i) < int(line[0]) and int(i) > int(transList[0][0]):
index = int(SNPPosList.index(i) - 1)
site_rho = (int(i) - int(SNPPosList[index])) * rho
RECList.write('%s\t%s\n' %(i,site_rho))
else:
continue
transList = []
transList.append((line[0],line[1],rho))
rholist.append(rho)
print rholist
for i in SNPPosList:
if i > int(transList[0][0]):
index = int(SNPPosList.index(i) - 1)
site_rho = (int(i) - int(SNPPosList[index])) * rho
RECList.write('%s\t%s\n' %(i,site_rho))
else:
continue
Mutation.close()
REC.close()
RECList.close()
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