[python][matlab]使用python调用matlab程序
问题引入
在做实验的时候,需要用到python和matlab工具来进行不同的处理,比如在run神经网络的时候,需要使用pytorch框架得到网络的各个参数,在得到参数后需要使用matlab进行聚类规划。之前的做法是用python脚本耦合其联系,两者通信的方式是通过文件。后来发现matlab有针对于python的api引擎,瞬间感觉打开了新世界的大门,只需要在python中调用相关的api,就可以完成matlab的工作,再也不用一个一个复制文件了。
解决思路
首先,我安装的是matlab R2015b,对应的python版本为3.4,本来一开始的版本是python36,但是由于matlab2015并不兼容py36,解决方法是,一方面可以通过重新安装高版本的matlab来解决,在高版本的matlab中已经使用了py36的接口。另一方面可以通过修改python版本来实现,通过anconda,可以很简便地安装一个新的py版本,具体的使用情况可以查看conda的帮助文档。
1. 安装matlab engine的py package
在matlab的官方帮助文档里:https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/matlab_external/install-the-matlab-engine-for-python.html,可以找到
cd "matlabroot/extern/engines/python"
python setup.py install
即切换到对应matlab的engines目录,然后运行安转脚本。需要注意的是,在安装之前需要切换py版本到3.4,否则默认是base的python,那样会出现错误。
2. 在py脚本里调用matlab engine
在matlab 文档 里https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/matlab_external/get-started-with-matlab-engine-for-python.html,声明了对应的matlab engine的启动和使用,其中包含了matlab数据和python数据类型的对应关系。
在文档https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/matlab_external/call-matlab-functions-from-python.html里,可以更详细地看到如何使用matlab engine:
import matlab.engine
eng = matlab.engine.start_matlab()
tf = eng.isprime(37)
print(tf) #True
上述的例子是调用了matlab'的判断素数的接口,首先需要在py文件里导入对应的matlab engine包,然后调用start_matlab()来启动引擎,然后使用引擎来得到返回值,需要注意的是,eng下的函数调用不会有提示,需要参照matlab的接口。
上述的是有返回值的调用,当函数具有多个返回值时,那么对应的调用方式如下:
import matlab.engine
eng = matlab.engine.start_matlab()
t = eng.gcd(100.0,80.0,nargout=3)
print(t)
注意当使用具有多个返回值函数的时候,会返回一个python cell,对于含有矩阵的数据,会转换成python的list数据。
当函数没有返回值时,需要使用以下的方式调用:
import matlab.engine
eng = matlab.engine.start_matlab()
eng.doc(nargout=0)
即要声明nargout=0,此时函数不会返回任何参数,如果不声明,就会报错。
3. 在python脚本里调用matlab脚本
该文档的帮助信息在https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/matlab_external/call-user-script-and-function-from-python.html,可以看到有两种方式的调用1.直接调用2.调用函数
如果是直接的脚本,比如在triarea.m里写下以下内容:
b = 5;
h = 3;
a = 0.5*(b.* h)
那么在python里就可以直接调用:
import matlab.engine
eng = matlab.engine.start_matlab()
eng.triarea(nargout=0)
就会得到py的打印输出,a=7.5000,这是因为虽然无返回值,但是matlab的输出仍然会显示在py里。当然更方便的方法是调用函数的形式,生成以下的文件:
function a = triarea(b,h)
a = 0.5*(b.* h);
在python中执行以下的调用:
ret = eng.triarea(1.0,5.0)
print(ret)
就会得到2.5,需要注意的是,该函数仅返回一个值,因此无需指定nargout的值。
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