Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank
Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank
全基因组的,基因环境分析,抑郁症和已经报道的终身创伤经历,UKBB
Depression is more frequently observed among individuals exposed to traumatic events. The relationship between trauma exposure and depression, including the role of genetic variation, is complex and poorly understood. The UK Biobank concurrently assessed depression and reported trauma exposure in 126,522 genotyped individuals of European ancestry. We compared the shared aetiology of depression and a range of phenotypes, contrasting individuals reporting trauma exposure with those who did not (final sample size range: 24,094- 92,957). Depression was heritable in participants reporting trauma exposure and in unexposed individuals, and the genetic correlation between the groups was substantial and not significantly different from 1. Genetic correlations between depression and psychiatric traits were strong regardless of reported trauma exposure, whereas genetic correlations between depression and body mass index (and related phenotypes) were observed only in trauma exposed individuals. The narrower range of genetic correlations in trauma unexposed depression and the lack of correlation with BMI echoes earlier ideas of endogenous depression.
抑郁症是遗传与环境综合作用的结果,创伤经历。我们的研究兴趣是这两者之间的关系,UKBB最近有很多数据。我们比较了抑郁症的共同病因和一系列表型,有无创伤经历。
抑郁症是可遗传的,遗传相关性是显著的,接近于1. (怎么算的?)抑郁症与精神病性状之间的遗传相关性都很强(什么意思?)
而抑郁症与体重指数(及相关表型)之间的遗传相关性仅在创伤暴露个体中观察到。(为什么在无创伤经历的人中观察不到?)
没有经历创伤的抑郁症的遗传相关性范围较窄,缺乏与BMI的相关性说明了早期的内源性抑郁症的观点。(什么叫endogenous?)
待续~
Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank的更多相关文章
- CRISPR/Cas9|InParanoid|orthoMCL|PanOCT|pan genome|meta genome|Core gene|CVTree3|
生命组学: 泛基因组学:用于描述一个物种基因组,据细菌基因组动力学,因为细菌的基因漂移使得各个细菌之间的基因组差异很大,(单个细菌之间的基因组差异是以基因为单位的gain&loss,而人类基因 ...
- Google云平台使用方法 | Hail | GWAS | 分布式回归 | LASSO
参考: Hail Hail - Tutorial windows也可以安装:Spark在Windows下的环境搭建 spark-2.2.0-bin-hadoop2.7 - Hail依赖的平台,并行处 ...
- UK Biobank专题
这个时代的生信,统计遗传,不懂或不会用这个数据库就说不过去了. 看看10年GWAS里是如何定位和评价UK biobank的: For the near future, the UK Biobank i ...
- maker 2008年发表在genome Res
http://gmod.org/wiki/MAKER_Tutorial 简单好用 identify repeats, to align ESTs and proteins to the genome, ...
- Systematic LncRNA Classification
Systematic LncRNA Classification From: http://www.arraystar.com/Services/Services_main.asp?ID=307 An ...
- 西安理工大学 李爱民 Xi'an University of Technology, Aimin Li
李爱民-西安理工大学计算机科学与工程学院 ● 简介(Introduction)-> 李爱民(Aimin Li),男,湖北随州人,西安电子科学大学博士(PhD),中共党员.中国计算机学会会员,CS ...
- GWAS | 全基因组关联分析 | Linkage disequilibrium (LD)连锁不平衡 | 曼哈顿图 Manhattan_plot | QQ_plot | haplotype phasing
现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp ...
- 全基因组关联分析学习资料(GWAS tutorial)
前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐. 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑流程开始,再去看原理. 为什么这么说呢,因为对于初学者来说,跑流程就像一个大黑洞,学习 ...
- GWAS 全基因组关联分析 | summary statistic 概括统计 | meta-analysis 综合分析
有很多概念需要明确区分: 人有23对染色体,其中22对常染色体autosome,另外一对为性染色体sex chromosome,XX为女,XY为男. 染色体区带命名:在标示一特定的带时需要包括4项:① ...
随机推荐
- Codeforces Round 500 (Div 2) Solution
从这里开始 题目地址 瞎扯 Problem A Piles With Stones Problem B And Problem C Photo of The Sky Problem D Chemica ...
- NOIP 车站分级 (luogu 1983 & codevs 3294 & vijos 1851) - 拓扑排序 - bitset
描述 一条单向的铁路线上,依次有编号为 1, 2, ..., n 的 n 个火车站.每个火车站都有一个级别,最低为 1 级.现有若干趟车次在这条线路上行驶,每一趟都满足如下要求:如果这趟车次停靠了火车 ...
- Delphi xe5 编译报environment.proj错误的解决
Delphi xe5 在Win64位下编译报 environment.proj 错误,网上有说明: http://hi.baidu.com/fly_king1228/item/9c85fccd8db4 ...
- Bootstrap3基础 btn-xs/sm... 按钮的四种大小
内容 参数 OS Windows 10 x64 browser Firefox 65.0.2 framework Bootstrap 3.3.7 editor ...
- 《AngularJS开发下一代Web应用》读书笔记与感想
该书一共130页打算四天读完,边读边记录. 1. 2.学习MogoDB 3. 4. 5. 创建标识符的一段简单伪码模板: var myModule = angular.module(...); myM ...
- noip模拟【noname】
noname [问题描述] 给定一个长度为n的正整数序列,你的任务就是求出至少需要修改序列中的多少个数才能使得该数列成为一个严格(即不允许相等)单调递增的正整数序列,对序列中的任意一个数,你都可以将其 ...
- 什么是pear的channel?
从pear看程序的组成: 可执行命令文件: /usr/bin/pear, pearcmd peardev等; 实现功能的库,函数等文件: /var/lib/pear 等... 程序的资源目录, 主要是 ...
- swagger 基础入门
目录 Swagger简介 4 安装 4 一. Node.js 安装 4 二. node中http-server安装 4 三. 下载swagger-editor 4 四. 启动 swagger-edit ...
- JAVA JDBC 增删改查简单例子
1.数据库配置文件jdbc.properties driver=com.mysql.jdbc.Driver url=jdbc:mysql://localhost:3306/test username= ...
- p3396 哈希冲突(暴力)
想了好久,没想到优秀的解法,结果是个暴力大吃一静.jpg 分类讨论,预处理\(p\le \sqrt{n}\) 的情况,其他直接暴力,复杂度\(O(n \sqrt{n} )\) #include < ...