Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank

全基因组的,基因环境分析,抑郁症和已经报道的终身创伤经历,UKBB

Depression is more frequently observed among individuals exposed to traumatic events. The relationship between trauma exposure and depression, including the role of genetic variation, is complex and poorly understood. The UK Biobank concurrently assessed depression and reported trauma exposure in 126,522 genotyped individuals of European ancestry. We compared the shared aetiology of depression and a range of phenotypes, contrasting individuals reporting trauma exposure with those who did not (final sample size range: 24,094- 92,957). Depression was heritable in participants reporting trauma exposure and in unexposed individuals, and the genetic correlation between the groups was substantial and not significantly different from 1. Genetic correlations between depression and psychiatric traits were strong regardless of reported trauma exposure, whereas genetic correlations between depression and body mass index (and related phenotypes) were observed only in trauma exposed individuals. The narrower range of genetic correlations in trauma unexposed depression and the lack of correlation with BMI echoes earlier ideas of endogenous depression.

抑郁症是遗传与环境综合作用的结果,创伤经历。我们的研究兴趣是这两者之间的关系,UKBB最近有很多数据。我们比较了抑郁症的共同病因和一系列表型,有无创伤经历。

抑郁症是可遗传的,遗传相关性是显著的,接近于1. (怎么算的?)抑郁症与精神病性状之间的遗传相关性都很强(什么意思?)

而抑郁症与体重指数(及相关表型)之间的遗传相关性仅在创伤暴露个体中观察到。(为什么在无创伤经历的人中观察不到?)

没有经历创伤的抑郁症的遗传相关性范围较窄,缺乏与BMI的相关性说明了早期的内源性抑郁症的观点。(什么叫endogenous?)

待续~

Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank的更多相关文章

  1. CRISPR/Cas9|InParanoid|orthoMCL|PanOCT|pan genome|meta genome|Core gene|CVTree3|

    生命组学: 泛基因组学:用于描述一个物种基因组,据细菌基因组动力学,因为细菌的基因漂移使得各个细菌之间的基因组差异很大,(单个细菌之间的基因组差异是以基因为单位的gain&loss,而人类基因 ...

  2. Google云平台使用方法 | Hail | GWAS | 分布式回归 | LASSO

    参考: Hail Hail - Tutorial  windows也可以安装:Spark在Windows下的环境搭建 spark-2.2.0-bin-hadoop2.7 - Hail依赖的平台,并行处 ...

  3. UK Biobank专题

    这个时代的生信,统计遗传,不懂或不会用这个数据库就说不过去了. 看看10年GWAS里是如何定位和评价UK biobank的: For the near future, the UK Biobank i ...

  4. maker 2008年发表在genome Res

    http://gmod.org/wiki/MAKER_Tutorial 简单好用 identify repeats, to align ESTs and proteins to the genome, ...

  5. Systematic LncRNA Classification

    Systematic LncRNA Classification From: http://www.arraystar.com/Services/Services_main.asp?ID=307 An ...

  6. 西安理工大学 李爱民 Xi'an University of Technology, Aimin Li

    李爱民-西安理工大学计算机科学与工程学院 ● 简介(Introduction)-> 李爱民(Aimin Li),男,湖北随州人,西安电子科学大学博士(PhD),中共党员.中国计算机学会会员,CS ...

  7. GWAS | 全基因组关联分析 | Linkage disequilibrium (LD)连锁不平衡 | 曼哈顿图 Manhattan_plot | QQ_plot | haplotype phasing

    现在GWAS已经属于比较古老的技术了,主要是碰到严重的瓶颈了,单纯的snp与表现的关联已经不够,需要具体的生物学解释,这些snp是如何具体导致疾病的发生的. 而且,大多数病找到的都不是个别显著的snp ...

  8. 全基因组关联分析学习资料(GWAS tutorial)

    前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐. 其实我个人觉得,做这个分析,先从跑流程开始,再去看原理. 为什么这么说呢,因为对于初学者来说,跑流程就像一个大黑洞,学习 ...

  9. GWAS 全基因组关联分析 | summary statistic 概括统计 | meta-analysis 综合分析

    有很多概念需要明确区分: 人有23对染色体,其中22对常染色体autosome,另外一对为性染色体sex chromosome,XX为女,XY为男. 染色体区带命名:在标示一特定的带时需要包括4项:① ...

随机推荐

  1. 如何利用好github的问题

    github对我来说真的是一个超好的平台,不过之前只是把它仓库来使用, 后来在大佬告诉我应该怎么使用github,今天就来总结下如何利用好github,让它发挥最大的威力. 1.把github当做百科 ...

  2. python---01.各类计算机语言,python历史,变量,常量,数据类型,if条件

    一.认识计算机 1.硬件组成: CPU(大脑)  + 内存(缓冲) + 主板(连接各部分) + 电源(心脏)      + 显示器 + 键盘 +鼠标+ 显卡 + 硬盘 2.操作系统 ①windows  ...

  3. Python3 tkinter基础 LabelFrame StringVar 单击按钮,Label中显示的文字更换

             Python : 3.7.0          OS : Ubuntu 18.04.1 LTS         IDE : PyCharm 2018.2.4       Conda ...

  4. 赞 ( 84 ) 微信好友 新浪微博 QQ空间 180 SSD故事会(14):怕TLC因为你不了解!【转】

    本文转载自:https://diy.pconline.com.cn/750/7501340.html [PConline 杂谈]从前,大家谈TLC色变:如今,TLC攻占SSD半壁江山.是的,这个世界就 ...

  5. linux内核中的linuxPPS是什么?

    答: linux每秒脉冲数(linux pulse per second),LinuxPPS 在系统中提供一个编程接口(API)去定义几个PPS源; 一个PPS源就是一个每秒能提供高精度信号的设备,以 ...

  6. Java中 System.arraycopy() 和 Arrays.copyOf()方法

    System.arraycopy() 和 Arrays.copyOf()方法 阅读源码的话,我们就会发现 ArrayList 中大量调用了这两个方法.比如:我们上面讲的扩容操作以及add(int in ...

  7. AtCoder Beginner Contest 117 解题报告

    果然abc都是手速场. 倒序开的qwq. D题因为忘记1e12二进制几位上界爆了一发. A - Entrance Examination 就是除一下就行了... 看样例猜题意系列. #include& ...

  8. BZOJ4455 小星星

    闲扯 看到多个限制条件的计数题目,就想到容斥原理 思路 题目要求两个条件 - 编号一一对应 - 树上存在的边,在图上映射到的点上也应该存在 考虑一个暴力的dp,设\(dp_{i,j}\)表示i点编号对 ...

  9. Twenty score

    1.上图中有两个人对读书的看法有较大的不同. There are two people in the cartoon who treat books in completely different w ...

  10. SQL语句执行的顺序机制

    From Where Group by Having Select 表达式 Distinct ORDER BY TOP/OFFSET-FETCH