rosetta deep_analysis
此小程序可以分析backrub,enzdes类的聚类logo分析,详细路径是:
/home/wangq/Programs/rosetta_2018.09.60072_bundle/tools/protein_tools/scripts/deep_analysis
帮助文档:
design_analysis.py -h
rosetta deep_analysis的更多相关文章
- rosetta common sh: mpiCC command not found解决方法
在执行多线程编译rosetta时执行: python scons.py bin mode=release extras=mpi -j8 编译安装rosetta 会出现错误sh: mpiCC comma ...
- 酶设计软件rosetta安装
1.Rosetta uses SCons as a compile assistant. You will likely need to download and install this first ...
- 外语学习强烈推荐Rosetta Stone
外语学习强烈推荐Rosetta Stone 外语学习强烈推荐Rosetta Stone
- rosetta geometric constraint file(用于match和design)
cst(constraint file)文件示例: CST::BEGIN TEMPLATE:: ATOM_MAP: atom_name: C6 O4 O2 TEMPLATE:: ATOM_MAP: r ...
- ROSETTA使用技巧随笔--relax使用
Purpose: 主要说目的,relax的作用就是对一个给定的蛋白进行构象搜索,寻找与WT相似并能量低于WT的结构,既包含packer又包含minimizer.主要的应用在对一个结构构象进行取样,获得 ...
- ROSETTA使用技巧随笔--蛋白蛋白对接
先写简略版,以后再详细写. 1. 对输入结构进行预处理(refine) $> relax.default.linuxgccrelease -in:file:s input_files/from_ ...
- ROSETTA使用技巧随笔--PyMOL实时观测ROSETTA模拟过程中的结构变化
没有梦想的人,就是一只咸鱼,像我,就有一个梦想,就是让蛋白模拟过程变成动画,动起来! 虽然MD中有很多方法可以方模拟过程像动画一样播放出来,但是我一直想在ROSETTA中也找一个这样的功能,这不,我发 ...
- ROSETTA使用技巧随笔--控制Log输出等级
一般运行ROSETTA,屏幕上的Log很多,而且很复杂,让我们看着眼晕,现在我们可以通过控制Log等级来控制屏幕上输出的东西. Integer Level 0 Fatal 100 Error 200 ...
- ROSETTA使用技巧随笔--Full Atom Representation和Centroid Representation
Full Atom Representation vs Centroid Representation Full Atom Representation即全原子标识,氨基酸残基的所有相关原子,均原封不 ...
随机推荐
- ubuntu 使用旧式Gnome风格的菜单
sudo apt-add-repository ppa:diesch/testing sudo apt-get update sudo apt-get install classicmenu-indi ...
- PCL点云配准(3)
(1)关于点云的配准 1.首先给定源点云与目标点云. 2.提取特征确定对应点 3.估计匹配点对应的变换矩阵 4.应用变换矩阵到源点云到目标点云的变换 配准的流程图 通过特征点的匹配步骤 (1)计算源点 ...
- Ceph相关
Ceph基础知识和基础架构简介 http://www.xuxiaopang.com/2020/10/09/list/#more大话Ceph http://www.xuxiaopang.com/2016 ...
- Java中Comparable和Comparator区别
很好的一篇博客:http://blog.csdn.net/jq_ak47/article/details/61203817 http://www.cnblogs.com/cmxwt/p/6215253 ...
- 消息中间件系列一:入门、JMS规范、ActiveMQ使用
一.入门 1. 消息中间件的定义 没有标准定义,一般认为,采用消息传送机制/消息队列 的中间件技术,进行数据交流,用在分布式系统的集成 2. 为什么要用消息中间件 解决分布式系统之间消息的传递.电商场 ...
- HTTP Status 404(The requested resource is not available)的几种解决方案
1. 未部署Web应用 2.URL输入错误 排错方法:首先,查看URL的IP地址和端口号是否书写正确.其次,查看上下文路径是否正确 Project--------Properties--- ...
- chmod chown
chmod以及chown,其中可以用递归参数-R来实现更改所有子文件和子目录的权限. 1.利用chmod修改权限: 对Document/目录下的所有子文件与子目录执行相同的权限变更: chmod -R ...
- redis数据操作笔记
redis是key-value的数据结构,每条数据都是一个键值对键的类型是字符串 注意:键不能重复,值的类型分为五种:字符串string 哈希hash 列表list 集合set 有序集合zset 一. ...
- Relation Extraction中SVM分类样例unbalance data问题解决 -松弛变量与惩罚因子
转载自:http://blog.csdn.net/yangliuy/article/details/8152390 1.问题描述 做关系抽取就是要从产品评论中抽取出描述产品特征项的target短语以及 ...
- js 画布与图片的相互转化(canvas与img)
使用js将图片拷贝进画布 //将图片对象转化为画布,返回画布function ImageToCanvas(image) { var canvas = document.createElement(&q ...