rosetta deep_analysis
此小程序可以分析backrub,enzdes类的聚类logo分析,详细路径是:
/home/wangq/Programs/rosetta_2018.09.60072_bundle/tools/protein_tools/scripts/deep_analysis
帮助文档:
design_analysis.py -h
rosetta deep_analysis的更多相关文章
- rosetta common sh: mpiCC command not found解决方法
在执行多线程编译rosetta时执行: python scons.py bin mode=release extras=mpi -j8 编译安装rosetta 会出现错误sh: mpiCC comma ...
- 酶设计软件rosetta安装
1.Rosetta uses SCons as a compile assistant. You will likely need to download and install this first ...
- 外语学习强烈推荐Rosetta Stone
外语学习强烈推荐Rosetta Stone 外语学习强烈推荐Rosetta Stone
- rosetta geometric constraint file(用于match和design)
cst(constraint file)文件示例: CST::BEGIN TEMPLATE:: ATOM_MAP: atom_name: C6 O4 O2 TEMPLATE:: ATOM_MAP: r ...
- ROSETTA使用技巧随笔--relax使用
Purpose: 主要说目的,relax的作用就是对一个给定的蛋白进行构象搜索,寻找与WT相似并能量低于WT的结构,既包含packer又包含minimizer.主要的应用在对一个结构构象进行取样,获得 ...
- ROSETTA使用技巧随笔--蛋白蛋白对接
先写简略版,以后再详细写. 1. 对输入结构进行预处理(refine) $> relax.default.linuxgccrelease -in:file:s input_files/from_ ...
- ROSETTA使用技巧随笔--PyMOL实时观测ROSETTA模拟过程中的结构变化
没有梦想的人,就是一只咸鱼,像我,就有一个梦想,就是让蛋白模拟过程变成动画,动起来! 虽然MD中有很多方法可以方模拟过程像动画一样播放出来,但是我一直想在ROSETTA中也找一个这样的功能,这不,我发 ...
- ROSETTA使用技巧随笔--控制Log输出等级
一般运行ROSETTA,屏幕上的Log很多,而且很复杂,让我们看着眼晕,现在我们可以通过控制Log等级来控制屏幕上输出的东西. Integer Level 0 Fatal 100 Error 200 ...
- ROSETTA使用技巧随笔--Full Atom Representation和Centroid Representation
Full Atom Representation vs Centroid Representation Full Atom Representation即全原子标识,氨基酸残基的所有相关原子,均原封不 ...
随机推荐
- 每天学习一个命令:find 查找文件
查找的动作在平时使用的频率也还是很高的,所以知道并用好 find 这个命令也很重要.find 命令顾名思义,就是搜索特定文件夹内的文件. 基本使用 最基本的使用 find [path] [expres ...
- 【GMT43智能液晶模块】基于HAL库的SDRAM和LCD驱动例程(MDK工程&CubeMX工程)
说明: 1.该工程基于HAL库实现动态存储器SDRAM驱动以及液晶控制器LCD驱动. 2.工程通过STM32CubeMX(Version 4.22.0)配置生成,可直接打开进行配置. 3.KEIL M ...
- EL表达式具体解释
在 JSP 页面中,使用标签库取代传统的 Java 片段语言来实现页面的显示逻辑已经不是新技术了,然而.由自己定义标签非常easy造成反复定义和非标准的实现.鉴于此.出现了 JSTL ( JSP St ...
- Oracle_lhr_CentOS 7.3 ECS上搭建RAC 18c+单实例DG+EMCC+DG的FSFO快速故障转移配置
Oracle_lhr_CentOS 7.3 ECS上搭建RAC 18c+单实例DG+EMCC+DG的FSFO快速故障转移配置 [大型连续免费公开课]Oracle 18c rac+dg+13.3的em ...
- c++学习计划
我选择的课程是西北工业大学的<C++程序设计> 理由是:西北工业大学的计算机挺不错的,而且这门课程还有"国家精品"的认证,感觉应该挺不错的. 共48讲...有点多 从2 ...
- 18 南京 D
裸的最小球覆盖. 坐标范围大一些所以我们把初始的温度也设置的大一些. #include <bits/stdc++.h> using namespace std; typedef long ...
- .Net逆向初学习
前一段时间逆向一个程序时发现是.net的,然后用OD和IDA都调试不了,最后上网查了一下原来.net的逆向要用专门的工具.这里推荐大家一篇文章去了解一下逆向.net的一些工具简介:http://www ...
- Nestjs 接口验证
class-validator Nestjs yarn add class-transformer class-validator main.ts import { NestFactory } fro ...
- [Educational Round 3][Codeforces 609F. Frogs and mosquitoes]
这题拖了快一周_(:з」∠)_就把这货单独拿出来溜溜吧~ 本文归属:Educational Codeforces Round 3 题目链接:609F - Frogs and mosquitoes 题目 ...
- Eclipse的设置、调优、使用(解决启动卡顿等问题)----转
eclipse调优 一般在不对eclipse进行相关设置的时候,使用eclipse总是会觉得启动好慢,用起来好卡,其实只要对eclipse的相关参数进行一些配置,就会有很大的改善. 加快启动速度 1. ...