SRA|GEO|Taxonomy|Pubmed|MeSH|EBI|Uniprot|Human project|Ensembl|UCSC

生物医学大数据：

SRA：Sequence Read Archive (SRA) makes biological sequence data available to the research community to enhance reproducibility and allow for new discoveries by comparing data sets.

其中的reads是短reads，下机后得到的初级数据，是一次数据库，起到store的作用，该数据库最重要的是反应深度测序的reads counts，通过对reads count的检查可以得知高表达序列是哪些。

GEO：GEO is a public functional genomics data repository supporting MIAME-compliant data submissions. Array- and sequence-based data are accepted. Tools are provided to help users query and download experiments and curated gene expression profiles.

起到对蛋白质表达注释情况的整合作用。

Taxonomy：Taxonomy (general) is the practice and science of classification of things or concepts, including the principles that underlie such classification.

常见搜索Human：txid9606[orgn]

Pubmed：医学文献检索

MeSH：存的是分类的term，这些term用于文献检索

My NCBI

美国数据库更倾向于机器注释，欧洲倾向于人注释。

EBI：欧洲的数据库

Uniprot：提供protein的功能和结构信息，这些注释信息是先自动注释，后手工注释。

Human project：它的巨大作用是提供一个Reference genome，这个参考并不需要在物理上是确凿无误的真正意义上的极点值，它的作用是作为其它基因组的参照系，提供其它基因组可以使用的相对位置。

Ensembl：综合了个体基因的不同实验测得的数据，并且根据一定的生物学原则进行整合和修正。

UCSC：综合了个体基因的不同实验测得的数据，但是只是客观的陈述出来，并不做任何判断。