使用 conda 和 Jupyter 创建你的自定义 R 包，转换笔记为幻灯片

创建你的自定义 R 包

出于用户使用方便考虑，Anaconda 已经在 “R Essentials” 中打包了一些最常用的数据科学 R 包。使用 conda metapackage 命令创建您自己的 R 软件包以便与同行共享也非常容易。例如，提供一个只包含在我们前一篇示例笔记本中使用的库，名字为 custom-r-bundle 的下载程序，只需创建 metapackage 即可：

conda metapackage custom-r-bundle 0.1.0 --dependencies r-irkernel jupyter r-ggplot2 r-dplyr --summary "My custom R bundle"

把我们自定义的 R 包上传到 Anaconda.org 与同事分享：

conda install anaconda-client
anaconda login
anaconda upload path/to/custom-r-bundle-0.1.0-0.tar.bz2

现在，任何人都可以通过运行下面的命令来获取所有这些包和依赖关系：

conda install -c <your anaconda.org username> custom-r-bundle

转换笔记为幻灯片

Jupyter 可以把笔记转换为在线幻灯片，供讲座和教程使用。

要将笔记本转换为 reveal.js 演示文稿，请将“单元格工具栏(Cell Toolbar)”设置为“幻灯片放映(Slideshow”)”：

将单元格(cells)组织成幻灯片(slides)和副幻灯片(subslides)：

执行转化命令：

jupyter nbconvert my_r_notebook.ipynb --to slides --post serve

最后，打开浏览器展示幻灯片：

ok，关于 conda 和 jupyter 就介绍这么多了，更深入的知识还需要大家在日常使用中多多去实践和发掘体验。

本文分享自微信公众号 - 生信科技爱好者（bioitee）。
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