UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的，该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图和注释信息，并提供一系列的网页分析工具。

  • 1.MySQL安装

本人使用的是Centos6.8系统，推荐使用yum安装。

$ yum install -y mysql mysql-devel mysql-server

  • 2.MySQLdb安装

MySQLdb是MySQL的一个线程兼容接口，提供了python数据库API，推荐yum安装。

$ yum install -y MySQL-python

$ python geneInfo.py brca1

【参考列表】

UCSC数据库

UCSC数据库表结构

HGNC

利用mysql客户端查询UCSC数据库的更多相关文章

  1. 使用MySQL客户端登录Ensemble数据库查询相关信息

    Ensemble公共MySQL数据库 对于大量数据和更详细的分析,Ensemble的MySQL服务器ensembldb.ensembl.org,useastdb.ensembl.org或asiadb. ...

  2. mysql联合查询更新数据库例子

    mysql联合查询更新数据库例子,用户表,部门表,把用户表中的部门属性更新为部门表的主键UPDATE user_table AS utINNER JOIN belongdept AS bd ON bd ...

  3. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小和单个库中所有表的大小的sql语句

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: ,),' MB') as data_size, concat(,),'MB') as index_size from information_schema ...

  4. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: 复制代码 代码如下:select TABLE_SCHEMA, concat(truncate(sum(data_length)/1024/1024,2), ...

  5. Python MySQL - 创建/查询/删除数据库

    #coding=utf-8 import mysql.connector import importlib import sys #连接数据库的信息 mydb = mysql.connector.co ...

  6. mysql客户端的导出数据库表和数据库数据等相关操作

    1.navicat for mysql 11.0.10客户端 导出数据库里所有表中的所有数据,方法如下,选中表,在横向导航栏里面找到“导出向导”,选中sql,点击下一步,点击全选,并且选中“应用相同目 ...

  7. Mysql 客户端查询结果如何保存到本地而不是服务端？

    应用场景:知道某台DB服务器的IP和账户,登录上去查询了10W条记录,需要把这些记录拉到本地做分析 方法1,远程连接到DB服务器执行OUTFILE命令,文件存储在DB机器上,只有mysql账户的情况下 ...

  8. 【MySQL】 查询某个数据库有多少张数据表

    SELECT COUNT(*) TABLES, table_schema FROM information_schema.TABLES WHERE table_schema = 'performanc ...

  9. 利用SQL语句查询一个数据库中的所有表

    SQL  :  select * from information_schema.tables ORACLE: select table_name from user_tables ACCESS: s ...

随机推荐

  1. yum 安装 mysql5.5 mysql 5.6 mysql5.7

      一. yum 安装mysql5.6 1. 安装仓库 要使用yum 安装mysql,需要使用mysql的yum 仓库,先从官网下载适合你的系统仓库 http://dev.mysql.com/down ...

  2. 我的Java开发学习之旅------>使用循环递归算法把数组里数据数组合全部列出

    面试题如下:把一个数组里的数组合全部列出,比如1和2列出来为1,2,12,21. (面试题出自<Java程序员面试宝典>) 代码如下: import java.util.Arrays; i ...

  3. abap 数字移动小游戏

    [转自 http://blog.csdn.net/forever_crazy/article/details/6542507] report ...... selection-screen pushb ...

  4. Java基础之Comparable接口, Collections类，Iterator接口，泛型(Generic)

    一.Comparable接口, Collections类 List的常用算法: sort(List); 排序,如果需要对自定义的类进行排序, 那就必须要让其实现Comparable接口, 实现比较两个 ...

  5. LeetCode：二叉树剪枝【814】

    LeetCode:二叉树剪枝[814] 题目描述 给定二叉树根结点 root ,此外树的每个结点的值要么是 0,要么是 1. 返回移除了所有不包含 1 的子树的原二叉树. ( 节点 X 的子树为 X ...

  6. git 生成patch和应用patch【转】

    本文转载自:http://www.jianshu.com/p/814fb6606734 1.在git源码目录下执行 1.1.两个commit间的修改(包含两个commit) git format-pa ...

  7. PYTHON 爬虫笔记五:BeautifulSoup库基础用法

    知识点一:BeautifulSoup库详解及其基本使用方法 什么是BeautifulSoup 灵活又方便的网页解析库,处理高效,支持多种解析器.利用它不用编写正则表达式即可方便实现网页信息的提取库. ...

  8. socket，获取html,webservice等，支持chunked，gzip,deflate

    1. [代码][C#]代码using System;using System.Collections.Generic;using System.Linq;using System.Net.Socket ...

  9. html5--1.4元素的属性

    html5--1.4元素的属性 学习要点: 1.了解HTML元素属性2.学习两个属性:align和bgcolor 属性的作用就是就为元素提供更多的信息,大多数元素都可以拥有属性 属性的语法:<标 ...

  10. RAC环境下控制文件损坏重建过程

    处理过程参考了: https://blogs.oracle.com/Database4CN/entry/%E5%A6%82%E4%BD%95%E9%87%8D%E5%BB%BArac%E7%9A%84 ...