UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的，该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图和注释信息，并提供一系列的网页分析工具。

  • 1.MySQL安装

本人使用的是Centos6.8系统，推荐使用yum安装。

$ yum install -y mysql mysql-devel mysql-server

  • 2.MySQLdb安装

MySQLdb是MySQL的一个线程兼容接口，提供了python数据库API，推荐yum安装。

$ yum install -y MySQL-python

$ python geneInfo.py brca1

【参考列表】

UCSC数据库

UCSC数据库表结构

HGNC

利用mysql客户端查询UCSC数据库的更多相关文章

  1. 使用MySQL客户端登录Ensemble数据库查询相关信息

    Ensemble公共MySQL数据库 对于大量数据和更详细的分析,Ensemble的MySQL服务器ensembldb.ensembl.org,useastdb.ensembl.org或asiadb. ...

  2. mysql联合查询更新数据库例子

    mysql联合查询更新数据库例子,用户表,部门表,把用户表中的部门属性更新为部门表的主键UPDATE user_table AS utINNER JOIN belongdept AS bd ON bd ...

  3. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小和单个库中所有表的大小的sql语句

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: ,),' MB') as data_size, concat(,),'MB') as index_size from information_schema ...

  4. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: 复制代码 代码如下:select TABLE_SCHEMA, concat(truncate(sum(data_length)/1024/1024,2), ...

  5. Python MySQL - 创建/查询/删除数据库

    #coding=utf-8 import mysql.connector import importlib import sys #连接数据库的信息 mydb = mysql.connector.co ...

  6. mysql客户端的导出数据库表和数据库数据等相关操作

    1.navicat for mysql 11.0.10客户端 导出数据库里所有表中的所有数据,方法如下,选中表,在横向导航栏里面找到“导出向导”,选中sql,点击下一步,点击全选,并且选中“应用相同目 ...

  7. Mysql 客户端查询结果如何保存到本地而不是服务端？

    应用场景:知道某台DB服务器的IP和账户,登录上去查询了10W条记录,需要把这些记录拉到本地做分析 方法1,远程连接到DB服务器执行OUTFILE命令,文件存储在DB机器上,只有mysql账户的情况下 ...

  8. 【MySQL】 查询某个数据库有多少张数据表

    SELECT COUNT(*) TABLES, table_schema FROM information_schema.TABLES WHERE table_schema = 'performanc ...

  9. 利用SQL语句查询一个数据库中的所有表

    SQL  :  select * from information_schema.tables ORACLE: select table_name from user_tables ACCESS: s ...

随机推荐

  1. Android 关于软键盘

    一..弹出的时候显示Editext框 添加布局replay_input <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?> ...

  2. python 基础 2.3 for 循环

    #/usr/bin/python #coding=utf-8 #@Time   :2017/10/16 10:05 #@Auther :liuzhenchuan #@File   :for 循环.py ...

  3. EasyNVR RTSP摄像机转HLS直播服务器中使用Onvif协议控制预置位

    EasyNVR支持预置位控制,包括转到指定预置位,设置指定预置位,删除指定预置位 预置位在安防领域有较为普遍的应用,可以进行很多既定位置的跳转,很方便 之前我们说过如何用Onvif协议进行设备的发现, ...

  4. Complete space 完备空间与柯西序列 巴拿赫空间与完备空间 完备空间与和希尔伯特空间 封闭closed与完备性complete

    http://www.gatsby.ucl.ac.uk/~gretton/coursefiles/RKHS2013_slides1.pdf RKHS: a function space with a ...

  5. 解决MAC Appium设备连不上IOS的的问题'idevice_id' program is not installed

    解决MAC Appium设备连不上IOS的的问题 错误的: [XCUITest] The 'idevice_id' program is not installed. If you are runni ...

  6. Android Weekly Notes Issue #275

    Android Weekly Issue #275 September 17, 2017 Android Weekly Issue #275 本期内容包括给Google Map实现一个Marker A ...

  7. Linux （ubuntu和redhat） 常用命令及细节

    1.关闭防火墙(Ubuntu) sudo ufw disable 2.vi 拷贝   参考http://blog.sina.com.cn/s/blog_601331150100ecfr.html 一) ...

  8. POJ3581 Sequence —— 后缀数组

    题目链接:https://vjudge.net/problem/POJ-3581 Sequence Time Limit: 5000MS   Memory Limit: 65536K Total Su ...

  9. android使用mina需要注意的问题

    1.第三方jar包的使用       如果在Java Build Path中使用Add External JARs这种方式,运行时会有找不到类的错误(我的上面有,如果你没出现,恭喜你),上网查了几种方 ...

  10. sublime 相关配置和快捷键

    1.安装package control  点击sublime的菜单栏 view->show console :现在打开了控制台, 这个控制台有上下两栏, 上面一栏会实时显示sublime执行了什 ...