UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图和注释信息,并提供一系列的网页分析工具。

  • 1.MySQL安装

本人使用的是Centos6.8系统,推荐使用yum安装。

$ yum install -y mysql mysql-devel mysql-server

  • 2.MySQLdb安装

MySQLdb是MySQL的一个线程兼容接口,提供了python数据库API,推荐yum安装。

$ yum install -y MySQL-python

$ python geneInfo.py brca1

【参考列表】

UCSC数据库

UCSC数据库表结构

HGNC

利用mysql客户端查询UCSC数据库的更多相关文章

  1. 使用MySQL客户端登录Ensemble数据库查询相关信息

    Ensemble公共MySQL数据库 对于大量数据和更详细的分析,Ensemble的MySQL服务器ensembldb.ensembl.org,useastdb.ensembl.org或asiadb. ...

  2. mysql联合查询更新数据库例子

    mysql联合查询更新数据库例子,用户表,部门表,把用户表中的部门属性更新为部门表的主键UPDATE user_table AS utINNER JOIN belongdept AS bd ON bd ...

  3. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小和单个库中所有表的大小的sql语句

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: ,),' MB') as data_size, concat(,),'MB') as index_size from information_schema ...

  4. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: 复制代码 代码如下:select TABLE_SCHEMA, concat(truncate(sum(data_length)/1024/1024,2), ...

  5. Python MySQL - 创建/查询/删除数据库

    #coding=utf-8 import mysql.connector import importlib import sys #连接数据库的信息 mydb = mysql.connector.co ...

  6. mysql客户端的导出数据库表和数据库数据等相关操作

    1.navicat for mysql 11.0.10客户端 导出数据库里所有表中的所有数据,方法如下,选中表,在横向导航栏里面找到“导出向导”,选中sql,点击下一步,点击全选,并且选中“应用相同目 ...

  7. Mysql 客户端查询结果如何保存到本地而不是服务端?

    应用场景:知道某台DB服务器的IP和账户,登录上去查询了10W条记录,需要把这些记录拉到本地做分析 方法1,远程连接到DB服务器执行OUTFILE命令,文件存储在DB机器上,只有mysql账户的情况下 ...

  8. 【MySQL】 查询某个数据库有多少张数据表

    SELECT COUNT(*) TABLES, table_schema FROM information_schema.TABLES WHERE table_schema = 'performanc ...

  9. 利用SQL语句查询一个数据库中的所有表

    SQL  :  select * from information_schema.tables ORACLE: select table_name from user_tables ACCESS: s ...

随机推荐

  1. java.lang.NoSuchMethodError: org.jboss.logging.Logger.getMessageLogger(Ljava/lang/Class;Ljava/lang/String;)Ljava/lang/Object;

    spring3_hibernate 集成报错信息 java.lang.NoSuchMethodError: org.jboss.logging.Logger.getMessageLogger(Ljav ...

  2. 九度OJ 1076:N的阶乘 (数字特性、大数运算)

    时间限制:3 秒 内存限制:128 兆 特殊判题:否 提交:6384 解决:2238 题目描述: 输入一个正整数N,输出N的阶乘. 输入: 正整数N(0<=N<=1000) 输出: 输入可 ...

  3. wimdows安装mongodb,开机启动

    > d: > cd D:\Program Files\MongoDB\Server\3.0\bin > .\mongod --logpath "D:\Program Fil ...

  4. pm2 的使用

    pm2.json 代码如下 [{ "name" : "dingtalk-mobile", "script" : "app.js&q ...

  5. redux和mobx比较(二)

    Redux Redux 是 JavaScript 状态容器,提供可预测化的状态管理. 三大核心 在 Redux 中,最为核心的概念就是 action .reducer.store 以及 state,那 ...

  6. Unix和Linux历史文化

    1.显示工作目录pwd   print working directory     print name of current/working directory 2.显示自己终端名称tty   pr ...

  7. Contiki Process概述

    本文涉及到的Protothread机制知识,在http://www.cnblogs.com/songdechiu/p/5793717.html 一.进程类型 进程类型主要有协同式(cooperativ ...

  8. 嵌入式选择与L1正则化

    http://blog.csdn.net/irene_loong/article/details/73741521

  9. Spark- Linux下安装Spark

    Spark- Linux下安装Spark 前期部署 1.JDK安装,配置PATH 可以参考之前配置hadoop等配置 2.下载spark-1.6.1-bin-hadoop2.6.tgz,并上传到服务器 ...

  10. 利用jsp技术实现用户注册

    利用jsp技术实现用户注册,包含register.html和register_check.jsp页面代码​1. [代码]J2EE实验    <!DOCTYPE html PUBLIC " ...