UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图和注释信息,并提供一系列的网页分析工具。

  • 1.MySQL安装

本人使用的是Centos6.8系统,推荐使用yum安装。

$ yum install -y mysql mysql-devel mysql-server

  • 2.MySQLdb安装

MySQLdb是MySQL的一个线程兼容接口,提供了python数据库API,推荐yum安装。

$ yum install -y MySQL-python

$ python geneInfo.py brca1

【参考列表】

UCSC数据库

UCSC数据库表结构

HGNC

利用mysql客户端查询UCSC数据库的更多相关文章

  1. 使用MySQL客户端登录Ensemble数据库查询相关信息

    Ensemble公共MySQL数据库 对于大量数据和更详细的分析,Ensemble的MySQL服务器ensembldb.ensembl.org,useastdb.ensembl.org或asiadb. ...

  2. mysql联合查询更新数据库例子

    mysql联合查询更新数据库例子,用户表,部门表,把用户表中的部门属性更新为部门表的主键UPDATE user_table AS utINNER JOIN belongdept AS bd ON bd ...

  3. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小和单个库中所有表的大小的sql语句

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: ,),' MB') as data_size, concat(,),'MB') as index_size from information_schema ...

  4. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: 复制代码 代码如下:select TABLE_SCHEMA, concat(truncate(sum(data_length)/1024/1024,2), ...

  5. Python MySQL - 创建/查询/删除数据库

    #coding=utf-8 import mysql.connector import importlib import sys #连接数据库的信息 mydb = mysql.connector.co ...

  6. mysql客户端的导出数据库表和数据库数据等相关操作

    1.navicat for mysql 11.0.10客户端 导出数据库里所有表中的所有数据,方法如下,选中表,在横向导航栏里面找到“导出向导”,选中sql,点击下一步,点击全选,并且选中“应用相同目 ...

  7. Mysql 客户端查询结果如何保存到本地而不是服务端?

    应用场景:知道某台DB服务器的IP和账户,登录上去查询了10W条记录,需要把这些记录拉到本地做分析 方法1,远程连接到DB服务器执行OUTFILE命令,文件存储在DB机器上,只有mysql账户的情况下 ...

  8. 【MySQL】 查询某个数据库有多少张数据表

    SELECT COUNT(*) TABLES, table_schema FROM information_schema.TABLES WHERE table_schema = 'performanc ...

  9. 利用SQL语句查询一个数据库中的所有表

    SQL  :  select * from information_schema.tables ORACLE: select table_name from user_tables ACCESS: s ...

随机推荐

  1. vue如何做分页?

    原创作品转载请注明出处 先来看一下效果图:    功能描述: 1. 点击页面序号跳转到相应页面: 2. 点击单左/单右,向后/向前跳转一个页面: 3. 点击双左/双右,直接跳转到最后一页/第一页: 3 ...

  2. Dijkstra的堆优化

    先附上一个例题:P3371 [模板]单源最短路径 一眼扫去,最短路... spfa可行,但是今天的主题是Dijkstra: #include<iostream> #include<a ...

  3. Python爬虫一些操作headers与cookies的便捷工具

    本篇文章主要是爬虫中常用的便捷处理方法整理,转载请注明出处 #!/usr/bin/env python # -*- coding: utf-8 -*- # @Date : 2018-08-14 13: ...

  4. Google IO 2019 Android 太长不看版

    Google I/O 2019, 这里有个playlist是所有Android开发相关的session视频合集: Android & Play at Google I/O 2019 当然啦每个 ...

  5. 打开Vs2010时,卡在加载工具箱内容 不动了

    我是直接打开Visual Studio 2010,而不是以打开解决方案的方式打开.然后就在左下角显示“正在从包‘Microsoft.VisualStudio.IDE.ToolboxControlsIn ...

  6. C语言“快速排序”函数写法

    代码是:C语言中快速排的写法,要加入头文件   <stdlib.h> qsort(数组名, 长度, 数据类型大小,比较算子 ): #include <stdio.h> #inc ...

  7. 修改ubuntu14.04命令行启动

    方法1: 原来要想默认不进入xwindows,只需编辑文件”/etc/default/grub”, 把 GRUB_CMDLINE_LINUX_DEFAULT=”quiet splash” 改成GRUB ...

  8. 分享知识-快乐自己:Struts2框架 工作原理及执行流程图(拦截器的使用)

    Struts2 架构图: 1):提交请求 客户端通过 HttpServletRequest 向 Servlet (即Tomcat)提交一个请求. 请求经过一系列的过滤器,例如图中的 ActionCon ...

  9. tf.stack和tf.unstack

    import tensorflow as tf a = tf.constant([1,2,3]) b = tf.constant([4,5,6]) c1 = tf.stack([a,b],axis=0 ...

  10. Maven-将jar包安装到本地仓库

    因为项目需要,使用的是sqlserver数据库,但是却找不到其对应的pom依赖,所以需要将本地jar包安装到本地仓库,定义pom依赖.以此为例,其他jar包均可参考该方式 cmd命令语句: mvn i ...