UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的，该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图和注释信息，并提供一系列的网页分析工具。

  • 1.MySQL安装

本人使用的是Centos6.8系统，推荐使用yum安装。

$ yum install -y mysql mysql-devel mysql-server

  • 2.MySQLdb安装

MySQLdb是MySQL的一个线程兼容接口，提供了python数据库API，推荐yum安装。

$ yum install -y MySQL-python

$ python geneInfo.py brca1

【参考列表】

UCSC数据库

UCSC数据库表结构

HGNC

利用mysql客户端查询UCSC数据库的更多相关文章

  1. 使用MySQL客户端登录Ensemble数据库查询相关信息

    Ensemble公共MySQL数据库 对于大量数据和更详细的分析,Ensemble的MySQL服务器ensembldb.ensembl.org,useastdb.ensembl.org或asiadb. ...

  2. mysql联合查询更新数据库例子

    mysql联合查询更新数据库例子,用户表,部门表,把用户表中的部门属性更新为部门表的主键UPDATE user_table AS utINNER JOIN belongdept AS bd ON bd ...

  3. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小和单个库中所有表的大小的sql语句

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: ,),' MB') as data_size, concat(,),'MB') as index_size from information_schema ...

  4. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: 复制代码 代码如下:select TABLE_SCHEMA, concat(truncate(sum(data_length)/1024/1024,2), ...

  5. Python MySQL - 创建/查询/删除数据库

    #coding=utf-8 import mysql.connector import importlib import sys #连接数据库的信息 mydb = mysql.connector.co ...

  6. mysql客户端的导出数据库表和数据库数据等相关操作

    1.navicat for mysql 11.0.10客户端 导出数据库里所有表中的所有数据,方法如下,选中表,在横向导航栏里面找到“导出向导”,选中sql,点击下一步,点击全选,并且选中“应用相同目 ...

  7. Mysql 客户端查询结果如何保存到本地而不是服务端？

    应用场景:知道某台DB服务器的IP和账户,登录上去查询了10W条记录,需要把这些记录拉到本地做分析 方法1,远程连接到DB服务器执行OUTFILE命令,文件存储在DB机器上,只有mysql账户的情况下 ...

  8. 【MySQL】 查询某个数据库有多少张数据表

    SELECT COUNT(*) TABLES, table_schema FROM information_schema.TABLES WHERE table_schema = 'performanc ...

  9. 利用SQL语句查询一个数据库中的所有表

    SQL  :  select * from information_schema.tables ORACLE: select table_name from user_tables ACCESS: s ...

随机推荐

  1. 成长型思维模式Not yet

    当做一件事失败了,要告诉他 暂未成功,暂时没有成功,继续努力,下次就有可能成功. 不及格,暂未及格  是两种思维模式,成长性的思维方式得到的是一个是努力型的人格

  2. spring AOP(切面) 表达式介绍

    在 spring AOP(切面) 例子基础上对表达式进行介绍 1.添加接口删除方法 2.接口实现类 UserDaoServer 添加实现接口删除方法 3.测试类调用delUser方法 4. 输出结果截 ...

  3. apache vhosts 虚拟主机设置

    编辑vhosts文件:/alidata/server/httpd-2.4.10/conf/extra/httpd-vhosts.conf <VirtualHost *:80> <Lo ...

  4. 如何查看apache配置文件路径

    我是用https://lamp.sh/安装的,apache配置文件位置在:/usr/local/apache/conf/httpd.conf如果是直接安装的apache,配置文件应该在:/etc/ht ...

  5. [IR课程笔记]Query Refinement and Relevance Feedback

    相关反馈的两种类型: “真实”的相关反馈: 1. 系统返回结果 2. 用户提供一些反馈 3. 系统根据这些反馈,返回一些不同的,更好的结果 “假定”的相关反馈 1. 系统得到结果但是并不返回结果 2. ...

  6. Java for LeetCode 101 Symmetric Tree

    Given a binary tree, check whether it is a mirror of itself (ie, symmetric around its center). For e ...

  7. JS的事件流概念*******

    事件的概念 HTML中与javascript交互是通过事件驱动来实现的,例如鼠标点击事件.页面的滚动事件onscroll等等,可以向文档或者文档中的元素添加事件侦听器来预订事件. 事件流 事件流描述的 ...

  8. Data Structure Binary Tree: Check for Children Sum Property in a Binary Tree

    http://www.geeksforgeeks.org/check-for-children-sum-property-in-a-binary-tree/ #include <iostream ...

  9. Dubbo之生产者

    环境步骤: 安装Zookeepr启动 创建Maven项目搭建生产者和消费者 安装DubboAdmin平台,实现监控 Dubbo注册中心采用的是Zookeeper.为什么采用Zookeeper呢? Zo ...

  10. latex 技巧汇总

    最近打算详细的学习一下latex,所以在学习的过程中遇到了一些问题.随时出问题,随时记录更新. 我是萌萌的Latex, x_0. 再写具体的技巧之前,先说一个关于打公式的小技巧.有时候你不知道怎么设置 ...