UCSC Genome Browser是由University of California Santa Cruz (UCSC) 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图和注释信息,并提供一系列的网页分析工具。

  • 1.MySQL安装

本人使用的是Centos6.8系统,推荐使用yum安装。

$ yum install -y mysql mysql-devel mysql-server

  • 2.MySQLdb安装

MySQLdb是MySQL的一个线程兼容接口,提供了python数据库API,推荐yum安装。

$ yum install -y MySQL-python

$ python geneInfo.py brca1

【参考列表】

UCSC数据库

UCSC数据库表结构

HGNC

利用mysql客户端查询UCSC数据库的更多相关文章

  1. 使用MySQL客户端登录Ensemble数据库查询相关信息

    Ensemble公共MySQL数据库 对于大量数据和更详细的分析,Ensemble的MySQL服务器ensembldb.ensembl.org,useastdb.ensembl.org或asiadb. ...

  2. mysql联合查询更新数据库例子

    mysql联合查询更新数据库例子,用户表,部门表,把用户表中的部门属性更新为部门表的主键UPDATE user_table AS utINNER JOIN belongdept AS bd ON bd ...

  3. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小和单个库中所有表的大小的sql语句

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: ,),' MB') as data_size, concat(,),'MB') as index_size from information_schema ...

  4. MySQL中查询所有数据库占用磁盘空间大小

    查询所有数据库占用磁盘空间大小的SQL语句: 复制代码 代码如下:select TABLE_SCHEMA, concat(truncate(sum(data_length)/1024/1024,2), ...

  5. Python MySQL - 创建/查询/删除数据库

    #coding=utf-8 import mysql.connector import importlib import sys #连接数据库的信息 mydb = mysql.connector.co ...

  6. mysql客户端的导出数据库表和数据库数据等相关操作

    1.navicat for mysql 11.0.10客户端 导出数据库里所有表中的所有数据,方法如下,选中表,在横向导航栏里面找到“导出向导”,选中sql,点击下一步,点击全选,并且选中“应用相同目 ...

  7. Mysql 客户端查询结果如何保存到本地而不是服务端?

    应用场景:知道某台DB服务器的IP和账户,登录上去查询了10W条记录,需要把这些记录拉到本地做分析 方法1,远程连接到DB服务器执行OUTFILE命令,文件存储在DB机器上,只有mysql账户的情况下 ...

  8. 【MySQL】 查询某个数据库有多少张数据表

    SELECT COUNT(*) TABLES, table_schema FROM information_schema.TABLES WHERE table_schema = 'performanc ...

  9. 利用SQL语句查询一个数据库中的所有表

    SQL  :  select * from information_schema.tables ORACLE: select table_name from user_tables ACCESS: s ...

随机推荐

  1. wmiprvse.exe 进程占CPU过高 问题解决

    wmiprvse.exe是一个系统服务的进程,你可以结束任务,进程自然消失. 禁用Windows Management Instrumentation Driver Extensions服务或者改为手 ...

  2. myeclipse中disable maven nature怎么恢复

    eclipse更新maven的时候,不小心手一抖,点上了Disable Maven Nature,然后工程右键菜单中的Maven栏就不见了! 其实这是把maven工程转换成了一般工程,再转回来就好了. ...

  3. 4276: [ONTAK2015]Bajtman i Okrągły Robin

    4276: [ONTAK2015]Bajtman i Okrągły Robin Time Limit: 40 Sec  Memory Limit: 256 MBSubmit: 345  Solved ...

  4. 【BZOJ3771】Triple 生成函数+FFT

    [BZOJ3771]Triple Description 我们讲一个悲伤的故事. 从前有一个贫穷的樵夫在河边砍柴. 这时候河里出现了一个水神,夺过了他的斧头,说: “这把斧头,是不是你的?” 樵夫一看 ...

  5. Darwin做直播时对ReflectorSession引用数的控制

    在之前的博客中,我们提到了如何用Darwin&live555实现直播过程,那么更进一步,当直播结束时,我们需要关闭所有正在收看的客户端,并且delete转发会话ReflectorSession ...

  6. [转]C#中的结构体与类的区别

    C#中的结构体与类的区别   经常听到有朋友在讨论C#中的结构与类有什么区别.正好这几日闲来无事,自己总结一下,希望大家指点. 1. 首先是语法定义上的区别啦,这个就不用多说了.定义类使用关键字cla ...

  7. opencv的x64库的版本和vs的版本的对应关系

    1 关于vs的版本 visual studio是一个集成开发环境,而vc++是一个c++的compiler,vc++有一个版本和一个版本号,vs也有一个版本,它们的对应关系如下: MSVC++ 4.x ...

  8. 取得微信用户OpenID

    公司需要微信这个平台和用户交流,于是开始研究微信公众平台.微信公众平台分为两种模式,其一是编辑模式,比如用户发什么内容,你可以响应什么内容.另外一种便是开发模式,这个模式功能丰富,不仅仅可以获取到用户 ...

  9. 采集练习(十一) php 获得电视节目预告---数据来自电视猫

    昨天写了个采集搜视网的电视节目预告,刚好今天有心情,想采下其他网站提供的节目预告,发现  电视猫wap版 的提供的节目预告也蛮好采(需要正则)....感谢移动互联网! 电视猫的 wap版地址是 htt ...

  10. 详解使用EM算法的半监督学习方法应用于朴素贝叶斯文本分类

    1.前言 对大量需要分类的文本数据进行标记是一项繁琐.耗时的任务,而真实世界中,如互联网上存在大量的未标注的数据,获取这些是容易和廉价的.在下面的内容中,我们介绍使用半监督学习和EM算法,充分结合大量 ...