关于3D Slicer的下载、安装及模块安装在上一篇博客中以及介绍过，以下将专注于使用3D Slicer进行颅骨去除

准备

此次，我们需要安装SwissSkullStripper模块，安装后需要重启软件才能使用该模块

使用SwissSkullStripper模块，如图划线部分，点击Help，会出现蓝色链接，点击可进入官网

在官网界面，我们可以看到两个下载链接，这两个图谱文件（atlas image、atlas brain mask）是我们进行接下来操作需要使用的

下载下来之后把它们保存在无中文名字的文件夹内待用，并修改文件名分别为Atlas.mha和AtlasMask-label.mha（atlas image.mha -> Atlas.mha，atlas brain mask -> AtlasMask-label.mha）

使用

在3D Slicer中分别载入需要进行颅骨去除的文件和刚刚下载的两个备用文件

点击File，点击Add Data即可出现下面载入文件的界面，将上述文件导入即可

最后一次在选择Input, Output 和 Atlas，最后点击Apply，即可生成去除颅骨的图像

注意Output最好选择Create new Volume，这样生成的文件不会覆盖我们之前导入的文件。Altas部分就是导入我们之前在官网下载的两个图谱文件

效果

使用3D Slicer进行颅骨去除的更多相关文章

  1. 3D Slicer中文教程（七）—图像中值滤波

    1.中值滤波概念 中值滤波是对一个滑动窗口内的诸像素灰度值排序,用其中值代替窗口中心象素的原来灰度值,它是一种非线性的图像平滑法,它对脉冲干扰级椒盐噪声的抑制效果好,在抑制随机噪声的同时能有效保护边缘 ...

  2. 3D Slicer中文教程（五）—三维视图颜色改变

    3D Slicer在分割后三维重建的图像,效果很好,但是存在一定的不足,默认的颜色并不是很合适,这时手动设置三维视图下的需要的颜色就很有必要了.如下图所示,默认的三维重建后的颜色. 这样的颜色显然不是 ...

  3. 3D Slicer中文教程（八）—导出STL文件

    一.STL文件简介 STL(立体平版印刷术的缩写)是由3D Systems创建的立体平版印刷CAD软件原生的文件格式STL有“标准三角语言”和“标准镶嵌语言”等几个事后回溯.这种文件格式是由许多其他软 ...

  4. 3D Slicer中文教程（六）—调用matlab函数（MatlabBridge使用方法）

    1.安装MatlabBridge插件 (1)在工具栏找到Extension,点击进入Extension Manager (2)找到MatlabBridge,安装 2.配置MATLAB环境 (1)在模块 ...

  5. 3D Slicer中文教程（四）—图像分割

    1.数据获取 (1)下载3D Slicer自带的样本数据 (2)选择自由的数据 (3)网上数据库等其他方式下载数据 2.分割工具 Segment Editor是一个用于分割的模块.细分(也称为轮廓)描 ...

  6. 3D Slicer中文教程（三）—数据加载及保存方式

    1.打开数据与保存数据 (1)打开数据 ——可以将数据拖拽到3D Slicer应用窗口或者从菜单栏工具栏打开. ——多种方式加载大量数据. 有关DICOM数据,请参阅DICOM模块文档. 对于几乎所有 ...

  7. 3D Slicer中文教程（一）—下载及安装方法

    3D Slicer是用于医学图像信息学,图像处理和三维可视化的开源软件平台. 通过国家卫生研究院和全球开发人员社区的支持,二十多年来,Slicer为医生,研究人员和公众提供了免费,强大的跨平台加工工具 ...

  8. 3D Slicer Hide 3D Cube and Axis Labels Programmatically 使用代码隐藏三维视图中的方框和坐标轴标签

    在3D Slicer中,我们如果想在自己写的插件中来修改三维视图中的默认设置的话,那么首先就需要获得三维视图的结点,其类型为vtkMRMLViewNode,获得了这个结点后,我们就可以用代码来修改一系 ...

  9. 使用3D Slicer对图像进行配准

    在进行深度学习之前,我们需要图像进行一些预处理操作,其中配准是很重要的一环,以下将介绍使用软件3D Slicer来进行图像配准 3D Slicer是(1)一个软件平台,用以图像分析(包括配准和实时编辑 ...

随机推荐

  1. SEO常用命令大全

    SEO常用单个命令如下: link: 指某个特定网站的外部链接,这是一个主要获取排名和权重的主要因素. site: 呵呵,这个是经常用到的了,它是指某个特定网站收录情况. 用法:site: www.  ...

  2. C#实现简单的RPC

    demo地址:https://pan.baidu.com/s/1PeTdV2V9DF87jZTHdz4CyA 提取码:n2qm 参考地址:https://github.com/neuecc/Magic ...

  3. PHP PDO预定义常量

    以下常量由本扩展模块定义,因此只有在本扩展的模块被编译到PHP中,或者在运行时被动态加载后才有效. 注意: PDO使用类常量自PHP 5.1.以前的版本使用的全局常量形式PDO_PARAM_BOOL中 ...

  4. python insert所用 插入到自定的位置

    a = list(range(50)) b = list(range(50)) c = [] for x in a: c.insert(x, [a[x], b[x]]) print(c)

  5. 只要一行代码求一串字符中某字符（串）出现次数，c#

    这里只要一行代码就行. static void Main(string[] args) { string str = "qwerwqr;sfdsfds;fdfdsf;dfsdfsdf;dsf ...

  6. 急速安装lnmp 编译版本-wiki-shell脚本实现一键部署

    shell脚本lnmp.sh 环境:centos 6.5 .64位 #!/bin/bash yum install -y nano vim wget wget http://www.atomicorp ...

  7. Slot使用

    1.组件中有单个或多个未命名slot标签时,如下:<Child><span style=”color:red;”>hello world</span></Ch ...

  8. R_展示变量之间关系的图形

    #绘制普通矩阵散点图 plot(dataframe) #绘制带有拟合直线,最佳拟合曲线和直方图的矩阵散点图 library(car) attach(dataframe) scatterplotMatr ...

  9. lua-01

    ctrl + shift + L 多行编辑 ctrl + D 继续向下选中下一个相同的文本 Alt + F3 选中所有相同所选中德文本 =>Lua的快捷键 回调代码: function fact ...

  10. 微信小程序-自定义下拉刷新

    最近给别个公司做技术支持,要实现微信小程序上拉刷新与下拉加载更多 微信给出的接口不怎么友好,最终想实现效果类似QQ手机版 ,一共3种下拉刷新状态变化,文字+图片+背景颜色 最终实现后的效果(这里提示有 ...