文本比较算法Ⅱ——Needleman/Wunsch算法的C++实现【求最长公共子串(不需要连续)】
算法见:http://www.cnblogs.com/grenet/archive/2010/06/03/1750454.html
求最长公共子串(不需要连续)
#include <stdio.h>
#include <string>
#define N 100 int max(int a, int b, int c){
return (a>b?a:b)>c?(a>b?a:b):c;
} int needleman(char s1[], char s2[]){
int len1 = strlen(s1);
int len2 = strlen(s2);
int i,j;
int count[N][N];
for(i=;i<len1+;i++){
count[i][] = ;
}
for(i=;i<len2+;i++){
count[][i] = ;
}
for(i=;i<len1+;i++){
for(j=;j<len2+;j++){
if(s1[i] == s2[j]){
count[i][j] = count[i-][j-]+;
} else {
count[i][j] = max(count[i-][j-],count[i][j-],count[i-][j]);
}
}
}
return count[len1][len2];
} int main(){
char s1[N];
char s2[N];
while(scanf("%s%s",s1,s2)!=EOF){
int result = needleman(s1,s2);
printf("%d\n",result);
}
return ;
}
文本比较算法Ⅱ——Needleman/Wunsch算法的C++实现【求最长公共子串(不需要连续)】的更多相关文章
- 文本比较算法Ⅱ——Needleman/Wunsch算法
在"文本比较算法Ⅰ--LD算法"中介绍了基于编辑距离的文本比较算法--LD算法. 本文介绍基于最长公共子串的文本比较算法--Needleman/Wunsch算法. 还是以实例说明: ...
- 文本比较算法:Needleman/Wunsch算法
本文介绍基于最长公共子序列的文本比较算法——Needleman/Wunsch算法.还是以实例说明:字符串A=kitten,字符串B=sitting那他们的最长公共子序列为ittn(注:最长公共子序列不 ...
- 【实习记】2014-08-29算法学习Boyer-Moore和最长公共子串(LCS)
昨天的问题方案一:寻找hash函数,可行性极低.方案二:载入内存,维护成一个守护进程的服务.难度比较大.方案三:使用前5位来索引,由前3位增至前5位唯一性,理论上是分拆记录扩大100倍,但可以 ...
- 《算法导论》读书笔记之动态规划—最长公共子序列 & 最长公共子串(LCS)
From:http://my.oschina.net/leejun2005/blog/117167 1.先科普下最长公共子序列 & 最长公共子串的区别: 找两个字符串的最长公共子串,这个子串要 ...
- 利用Needleman–Wunsch算法进行DNA序列全局比对
生物信息学原理作业第二弹:利用Needleman–Wunsch算法进行DNA序列全局比对. 具体原理:https://en.wikipedia.org/wiki/Needleman%E2%80%93W ...
- 字符串与模式匹配算法(六):Needleman–Wunsch算法
一.Needleman-Wunsch 算法 尼德曼-翁施算法(英语:Needleman-Wunsch Algorithm)是基于生物信息学的知识来匹配蛋白序列或者DNA序列的算法.这是将动态算法应用于 ...
- 算法设计 - LCS 最长公共子序列&&最长公共子串 &&LIS 最长递增子序列
出处 http://segmentfault.com/blog/exploring/ 本章讲解:1. LCS(最长公共子序列)O(n^2)的时间复杂度,O(n^2)的空间复杂度:2. 与之类似但不同的 ...
- 算法复习周------“动态规划之‘最长公共子序列’”&&《计蒜课》---最长公共子串题解
问题描述: 这个问题其实很容易理解.就是给你两个序列X={x1,x2,x3......xm} Y={y1,y2,y3......ym},要求找出X和Y的一个最长的公共子序列. 例:Xi={A, B, ...
- 用python实现最长公共子序列算法(找到所有最长公共子串)
软件安全的一个小实验,正好复习一下LCS的写法. 实现LCS的算法和算法导论上的方式基本一致,都是先建好两个表,一个存储在(i,j)处当前最长公共子序列长度,另一个存储在(i,j)处的回溯方向. 相对 ...
随机推荐
- Excel单元格内容拆分、合并
例:如何将EXCEL单元格A1中的“1-2-1”,在B1.C1.D1单元格中分别显示”1“.”2“.”1“.方法一: 在B1中输入“=mid(A1,1,1)”在C1中输入“=mid(AI,3,1)”在 ...
- 注册带有Portal功能的DYN365_ENTERPRISE_PLAN1地址
使用官方进入的注册页面注册后试用,发现没有Portal功能. https://trials.dynamics.com/Dynamics365/Signup 使用以下的地址注册可以产生Portal ht ...
- OpenSSL 结构体
X509_STORE 头文件:x509_vfy.h 定义 typedef struct x509_store_st X509_STORE; struct x509_store_st { /* The ...
- SNP/单核苷酸多态性分析
SNP/单核苷酸多态性分析 SNP(Single Nucleotide Polymorphism),即单核苷酸多态性,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态.一般来说,一个SNP位点只有两种等位基因 ...
- tp5链接访问
方法名:admin/DayActive/statistic 访问:admin/day_active/statistic
- [Jenkins] 在Jenkins执行单个test suite
cd %WORKSPACE%cmd /c call "%READYAPI_PRO_190%\bin\testrunner.bat" -a -j -s"%TestSuite ...
- centos7 编译安装mysql
centos 7 安装mySql 1,准备mySql源码安装 #wget http://dev.mysql.com/get/Downloads/MySQL-5.6/mysql-5.6.23.tar ...
- oracle建存储过程
进入plsql命令行 [10:42:10 liuyi@localhost]/home/liuyi>sqlplus demo/demo@180.200.3.129/meboss 连接串格式:用户名 ...
- dbutils封装对象,单列,一行一列(用)
基本用法:查找并封装对象与对象集合 public User findUserByNamePassword(String name,String password){ QueryRunner runne ...
- 处理No CPU/ABI system image for target的方法
处理No CPU/ABI system image for target的方法 最近菩提搭建完成Android开发环境后,在创建安卓模拟器的时候遇到了问题.这个问题就是图片中显示的no CPU/ABI ...