### miRNA特点
  (1)广泛存在于真核生物中, 是一组不编码蛋白质的短序列RNA,它本身不具有开放阅读框架(ORF),并且由不同于mRNA的独立转录单位表达。
  (2)通常的长度为20~24 nt,但在3′端可以有1~2 个碱基的长度变化(对miRNA 的具体长度范围尚无统一标准)。
  (3)成熟的miRNA , 5′端有磷酸基团, 3′端为羟基,且具有独特的序列特征.它们可以和上游或下游的序列不完全配对形成茎环结构。
  (4)miRNA5′端第一个碱基对U有强烈的倾向性,而对G却有抗性,但第2-4个碱基缺乏U,一般来讲,除第4个碱基外,其他位置碱基通常都缺乏C。
  (5)保守性:已有实验证明约12 %的miRNA在线虫、果蝇、哺乳动物和植物中呈现保守性,而且序列比较发现,这些保守片段中的碱基差异仅为1~2 nt。
  (6)时序性和组织特异性: 即在生物发育的不同阶段里有不同的miRNA表达, 在不同组织中表达有不同类型的miRNA。

miRNA特点的更多相关文章

  1. 植物 miRNA 研究

    相比动物miRNA 而言, 植物miRNA 的研究相对较少. 植物miRNA 相比动物miRNA , 有以下特点: 1) 植物miRNA 的长度为 21 nt 左右, 动物miRNA 长度在 22 ~ ...

  2. PolymiRTS 数据库- miRNA SNP数据库

    背景: miRNA通过和mRNA的3'UTR区结合,导致mRNA讲解或者抑制mRNA翻译,从而实现转录后调控的作用: 如果在miRNA和 mRNA的结合区域,发生了snp,就可能会影响miRNA和mR ...

  3. 5、预测和鉴定miRNA的靶基因

    转载:http://www.oebiotech.com/Article/mirnabjyyc.html http://www.ebiotrade.com/newsf/2014-9/2014925941 ...

  4. miRNA

    MicroRNA (miRNA)  是一类内生的.长度约为20-24个核苷酸的小 RNA,其在细胞内具有多种重要的调节作用.每个 miRNA 可以有多个靶基因的表达,而几个 miRNA 也可以调节同一 ...

  5. miRNA|housekeeping|RNAi|siRNA|Oncomirs|miRBase|PMRD|TargetScan|miRDeep|miRNA target|seed regions|

    生物信息学-miRNA 转录组的分类: Noncoding RNA可分为负责Regulatory和housekeeping,housekeeping就是组织日常功能miRNA便是Regulatory ...

  6. miRNA预测工具miRDeep-P2

    之前讲过预测植物miRNA的一款软件miR-PREFER, 今天在介绍一款软件miRDeep-p2, 也叫miRDP2 安装 在此之前,应安装一下软件 Bowite, Bowtie2, Vienna ...

  7. miRNA分析--靶基因预测(三)

    miRNA分析--数据过滤(一) miRNA分析--比对(二) 根据miRNA Target Prediction in Plants, miRNA并非所有区域都要求严格匹配,其中第1位碱基和第14位 ...

  8. miRNA分析--比对(二)

    miRNA分析--数据过滤(一) 在比对之前为了减少比对时间,将每一个样本中的reads进行合并,得到fasta格式,其命名规则如下: 样本_r数子_x数字 r 中的数字表示reads序号: x 中的 ...

  9. miRNA分析--数据过滤(一)

    miRNA 数据过滤我使用cutadapt 1 cutadapt -a AGATCGGAAGAGCACACGTCT -m 15 -q 20 --discard-untrimmed -o outname ...

随机推荐

  1. 邓白氏码的申请-iOS公司开发者账号准备

    相比较个人开发者账号的申请,公司(or企业)的账号申请要稍显复杂,很关键的一点就是邓白氏码的申请,而在网上找了好久也没有找到相对系统的方法流程.因此, 用本文记录我在公司申请邓白氏码过程,以备之后不时 ...

  2. iOS 直播-实现后台录音并推流

    iOS 直播-实现后台录音并推流 从一个月前开始开始接收公司的直播类app.到今天为止测试都已接近尾声,但是产品哥哥加了一个要求,就是在app进入后台后也实时保证录音并且推流. 刚听到这个的时候我也是 ...

  3. Git 常见的命令操作

    克隆                git clone git地址 查看分支         git branch 查看git库状态  git status 切换分支         git  che ...

  4. iOS开发 解决UITapGestureRecognizer手势与UITableView的点击事件的冲突

    该篇文章摘自我的新浪博客,原文地址为: http://blog.sina.com.cn/s/blog_dcc636350102wavx.html UITableView 拥有属于自己的点击事件,在将一 ...

  5. ORA-01157 & ORA-01110

    测试服务器做了RMAN还原后,发现告警日志文件有如下错误信息ORA-01110: data file 206: '/u04/epps/oradata/temp02.dbf'   Errors in f ...

  6. ORACLE等待事件: log file parallel write

    log file parallel write概念介绍 log file parallel write 事件是LGWR进程专属的等待事件,发生在LGWR将日志缓冲区(log_buffer)中的重做日志 ...

  7. 《java JDK7 学习笔记》之继承与多态

    1.面向对象中,子类继承父类,避免重复的行为定义,不过并非为了避免重复定义行为就使用继承.应该正确判断使用继承的时机及继承之后灵活的运用多态,才是学习继承时的重点. 2.程序代码重复在程序设计上,就是 ...

  8. Oracle数据库迁移

    1 在数据迁移时,用户首先有权限修改数据库,并且进行表空间创建.删除等权利 例如: select * from dba_tab_privs where grantee='SCOT'; ---查看SCO ...

  9. ipv4理论知识2-分类编址、ip分类、网络标识、主机标识、地址类、地址块

    分类编址 ipv4的体系结构中有分类编址和无分类编址(后续会介绍到),在分类编址时,ipv4地址分为A.B.C.D.E这5类.每类占用的IP比例和个数如下图: ipv4分类识别 计算机以二进制方式存储 ...

  10. mysqld设置密码

    用root 进入mysql后 mysql>set password =password('你的密码'); mysql>flush privileges;   登录: mysql -u ro ...