python处理nii格式文件
网上已经有很多代码了,但是注释的都不全,看起来很费解,我自己加了一些注释,重新发出来,尽可能的通俗易懂
读取前需要先安装库
pip install nibabel
pip install matplotlib
from nibabel.viewers import OrthoSlicer3D
from nibabel import nifti1
import nibabel as nib
from matplotlib import pylab as plt
import matplotlib
# matplotlib.use('TkAgg')
# 文件名,nii或nii.gz
example_filename = 'xxxx'
img = nib.load(example_filename)
# 打印文件信息
print(img)
print(img.dataobj.shape)
#shape不一定只有三个参数,打印出来看一下
width, height, queue = img.dataobj.shape
# 显示3D图像
OrthoSlicer3D(img.dataobj).show()
# 计算看需要多少个位置来放切片图
x = int((queue/10) ** 0.5) + 1
num = 1
# 按照10的步长,切片,显示2D图像
for i in range(0, queue, 10):
img_arr = img.dataobj[:, :, i]
plt.subplot(x, x, num)
plt.imshow(img_arr, cmap='gray')
num += 1
plt.show()
其他操作,后续再补充
python处理nii格式文件的更多相关文章
- python 生成json格式文件,并存储到手机上
上代码 #!/usr/bin/env python # -*- encoding: utf-8 -*- import json import os import random "" ...
- 用python将SQL格式文件改成自己想要的格式
INSERT INTO TTT (NSAME, ID, AGE) VALUES ('AAA', '201023210816', '22'); 将上面的SQL格式改成以下的格式 AAA|20102321 ...
- 如何用python读写CSV 格式文件
工作中经常会碰到读写CSV文件的情况.记录下,方便自己以后查询并与大家一起分享: 写CSV文件方法一: import csv #导入CSV with open("D:\eg ...
- 纯Python给ulaw wav文件加头
最近在处理wav相关文件,碰见一工具产生的ualw文件不带header,顺手用python给wav格式文件加头处理,让普通播放器也能播放. (原文:http://www.cnblogs.com/ryh ...
- 针对格式文件,Python读取一定大小的文件内容
由数据库导出的数据是格式化数据,如下所示,每两个<REC>之间的数据是一个记录的所有字段数据,如<TITLE>.<ABSTRACT>.<SUBJECT_COD ...
- 如何用python在Windows系统下,生成UNIX格式文件
平时测试工作中,少不了制造测试数据.最近一个项目,我就需要制造一批可在UNIX下正确读取的文件.为确保这批文件能从FTP下载成功,开发叮嘱我:“文件中凡是遇到换行,换行符必须是UNIX下的LF,而不是 ...
- Python处理json格式的数据文件(一些坑、一些疑惑)
这里主要说最近遇到的一个问题,不过目前只是换了一种思路先解决了,脑子里仍然有疑惑,只能怪自己太菜. 最近要把以前爬的数据用一下了,先简单的过滤一下,以前用scrapy存数据的时候为了省事也为了用一下它 ...
- Python数据写入csv格式文件
(只是传递,基础知识也是根基) Python读取数据,并存入Excel打开的CSV格式文件内! 这里需要用到bs4,csv,codecs,os模块. 废话不多说,直接写代码!该重要的内容都已经注释了, ...
- python读取与写入csv,txt格式文件
python读取与写入csv,txt格式文件 在数据分析中经常需要从csv格式的文件中存取数据以及将数据写书到csv文件中.将csv文件中的数据直接读取为dict类型和DataFrame是非常方便也很 ...
随机推荐
- [题解] LuoguP4389 付公主的背包
这个题太神辣- 暴力背包就能获得\(30\)分的好成绩...... \(60\)分不知道咋搞..... 所以直接看\(100\)分吧\(QwQ\) 用一点生成函数的套路,对于一个体积为\(v\)的物品 ...
- SQL约束攻击
本文转载自https://blog.csdn.net/kkr3584/article/details/69223010 目前值得高兴的是,开发者在建立网站时,已经开始关注安全问题了--几乎每个开发者都 ...
- nested exception is java.lang.IllegalArgumentException: warning no match for this type name: res [Xlint:invalidAbsoluteTypeName]
注:内有单词(sping)写错,请忽略,不影响程序运行 运行时报错: Exception in thread "main" org.springframework.beans.fa ...
- HashMap核心功能源码浅析
1.引子 "HashMap"由“hash”和“map"两个单词组成,这里的”map"表示“映射”而不是“地图”的意思,两个单词连起来就是“哈希映射表”.Map是 ...
- 读写锁ReentrantReadWriteLock源代码浅析
1.简介 并发中常用的ReentrantLock,是一种典型的排他锁,这类锁在同一时刻只允许一个线程进行访问,实际上将并行操作变成了串行操作.在并发量大的业务中,其整体效率.吞吐量不能满足实现的需要. ...
- BUUCTF-[HCTF 2018]WarmUp
php中可以使用strpos函数与mb_strpos函数获取指定的字符串在别一个字符串中首次出现的位置,也可以使用它们判断一串字符串中是否包含别一个字符串. PHP strpos() 函数 查找 &q ...
- php 常用编译参数
安装依赖 yum install -y gcc gcc-c++ make zlib zlib-devel pcre pcre-devel libjpeg libjpeg-devel libpng li ...
- win10编译zlib
zlib是一个数据压缩库,官网的解释很酷: A Massively Spiffy Yet Delicately Unobtrusive Compression Library(Also Free, N ...
- hdu 6581 Vacation【思维】
原题链接: http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=6581 VacationTime Limit: 10000/5000 MS (Java/Others) ...
- python中的单元测试模块unittest
unittest的属性: 该文以思维导图的形式描述unittest的重要属性. 其中前四个是unittest最核心的三个属性. testcase:测试用例: testsuite:测试套件,多个测试用例 ...