在jupyter中调用R

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• 安装R
• 关联jupyter notebook

安装R

• 系统：Ubuntu:16.04

步骤1.添加镜像源

$ sudo echo "deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/" | sudo tee -a /etc/apt/sources.list

步骤2.下载公钥

$ gpg --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-key 51716619E084DAB9
$ gpg -a --export 51716619E084DAB9 | sudo apt-key add -

步骤3.安装r-base

$ sudo apt-get update
$ sudo apt-get install r-base r-base-dev

验证是否安装成功

$ R

如果能进入R命令行，则说明已安装成功。

关联 jupyter notebook

打开R命令行，执行以下命令，安装必要的包：

> install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))
> devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')

如果运行上述命令报错devtools安装错误，则需要退出R命令行先安装需要的依赖：

$ sudo apt-get install libcurl4-gnutls-dev
$ sudo apt-get install libxml2-dev

安装完上述依赖之后，重新执行R包安装脚本，完成之后执行以下代码（二选一）进行配置：

# 只在当前用户下安装
> IRkernel::installspec()
# 或者是在系统下安装
> IRkernel::installspec(user = FALSE)

等待执行完毕，打开jupyter就可以新建R的notebook了。

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参考资料

https://blog.csdn.net/ICERON/article/details/82743930

https://blog.csdn.net/sparkexpert/article/details/49121289

https://blog.csdn.net/duxu24/article/details/53611510

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