利用bcftools软件将vcf格式生成gz格式和index格式,需要用到“-Oz”和“index”命令,具体如下:

/bcftools-1.8/bin/bcftools view ExAC.vcf -Oz -o ExAC.vcf.gz
/bcftools-1.8/bin/bcftools index ExAC.vcf.gz

bcftools将vcf生成bgzip和index格式的更多相关文章

  1. Android使用DOM生成和输出XML格式数据

    Android使用DOM生成和输出XML格式数据 本文主要简单解说怎样使用DOM生成和输出XML数据. 1. 生成和输出XML数据 代码及凝视例如以下: try { DocumentBuilderFa ...

  2. 根据日志来源的不同生成不同的index索引

    使用filebeat收集系统日志,不同应用的日志,然后把这些日志传输给Logstash,再然后交由elasticsearch处理,那么如何区分不同的日志来源呢? filebeat.yml配置文件中不启 ...

  3. [shiro学习笔记]第四节 使用源代码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源代码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源代码 shiro官网: http://shiro.ap ...

  4. [shiro学习笔记]第四节 使用源码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本号为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源码 shiro官网: http://shiro.apa ...

  5. bcftools 提取vcf(snp/indel)文件子集

    做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...

  6. ExtJs动态生成treepanel的Json格式

    在节点中加上"checked"属性,会自动生成checkbox. 获取选中节点 var nodeArray = ""; var nodesObj = mytre ...

  7. mysql格式化整数类型时间生成年月日时分秒格式(long或string接收)

    数据库格式: 数据库mysql语句: FROM_UNIXTIME( s.timemodified, '%Y-%m-%d %h:%i:%s' ) 生成结果: 测试sql为: SELECT *, FROM ...

  8. bcftools合并vcf文件

    见命令: bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz 参考链接:http://vcftools.sourceforge.ne ...

  9. PHP生成和获取XML格式数据

    在做数据接口时,我们通常要获取第三方数据接口或者给第三方提供数据接口,而这些数据格式通常是以XML或者JSON格式传输,本文将介绍如何使用PHP生成XML格式数据供第三方调用以及如何获取第三方提供的X ...

随机推荐

  1. B站弹幕姬(🐔)分析与开发(上篇)

    辞职之后 休息了一段时间,最近准备开始恢复去工作的状态了,所以搞点事情来练练手.由于沉迷b站女妆大佬想做个收集弹幕的然后根据弹幕自动回复一些弹幕的东西.网上搜了一下有个c#的版本,感觉还做得不错,于是 ...

  2. SSM+shiro及相关插件的整合maven所有依赖,详细注释版,自用,持续更新

    整合了SSM+shiro框架,slf4j+logback日志,及一些好用的插件PageHelper,mybatis-generator,Lombok,fastjson等等 <?xml versi ...

  3. MyBatis的XML中使用内部类的方式

    内部类需要使用$符号连接,而不是点.,如 com.pingan.job.openapi.model.SMSESBResult$ReceiveResult$ResultInfo 从CSDN论坛查到的. ...

  4. java 运行 .jar 文件乱码

    http://yang3wei.github.io/blog/2013/02/10/java-dfile-dot-encoding-equals-utf-8-gan-diao-luan-ma/ 启动时 ...

  5. 学习 Spring (九) 注解之 @Required, @Autowired, @Qualifier

    Spring入门篇 学习笔记 @Required @Required 注解适用于 bean 属性的 setter 方法 这个注解仅仅表示,受影响的 bean 属性必须在配置时被填充,通过在 bean ...

  6. Redux 学习(1) ----- Redux介绍

    Redux 有三个基本的原则: 1,单一状态树,redux 只使用一个javascript 对象来保存整个应用的状态. 状态树样式如下: const state = { count: 0 } 2,状态 ...

  7. java基础之Number

    1.Java是一个近乎纯洁的面向对象编程语言,但是为了编程的方便还是引入了基本数据类型,但是为了能够将这些基本数据类型当成对象操作,Java为每一个基本数据类型都引入了对应的包装类型(wrapper ...

  8. Codeforces Round #426 Div. 1

    A:考虑每个质因子,显然要求次数之和是3的倍数,且次数之差的两倍不小于较小的次数.对于第一个要求,乘起来看开三次方是否是整数即可.第二个取gcd,两个数分别除掉gcd,之后看两个数的剩余部分是否都能被 ...

  9. 洛谷P1057传球游戏题解

    题目 这个题表面上看并不像DP,但是当我们看到方案数时,我们可能会想到什么??? 对,分类加法原理,在每一轮中,每一个点的方案数都要加上这个点左边的方案与右边的方案. 因此我们可以枚举,设一个DP数组 ...

  10. 非阻赛IO模型

    实例一: 只能在waitdata 阶段找到IO的解决方案 from concurrent.futures import ThreadPoolExecutor import socket server ...