利用bcftools软件将vcf格式生成gz格式和index格式，需要用到“-Oz”和“index”命令，具体如下：

/bcftools-1.8/bin/bcftools view ExAC.vcf -Oz -o ExAC.vcf.gz

/bcftools-1.8/bin/bcftools index ExAC.vcf.gz

bcftools将vcf生成bgzip和index格式的更多相关文章

  1. Android使用DOM生成和输出XML格式数据

    Android使用DOM生成和输出XML格式数据 本文主要简单解说怎样使用DOM生成和输出XML数据. 1. 生成和输出XML数据 代码及凝视例如以下: try { DocumentBuilderFa ...

  2. 根据日志来源的不同生成不同的index索引

    使用filebeat收集系统日志,不同应用的日志,然后把这些日志传输给Logstash,再然后交由elasticsearch处理,那么如何区分不同的日志来源呢? filebeat.yml配置文件中不启 ...

  3. [shiro学习笔记]第四节 使用源代码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源代码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源代码 shiro官网: http://shiro.ap ...

  4. [shiro学习笔记]第四节 使用源码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本号为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源码 shiro官网: http://shiro.apa ...

  5. bcftools 提取vcf（snp/indel）文件子集

    做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...

  6. ExtJs动态生成treepanel的Json格式

    在节点中加上"checked"属性,会自动生成checkbox. 获取选中节点 var nodeArray = ""; var nodesObj = mytre ...

  7. mysql格式化整数类型时间生成年月日时分秒格式(long或string接收)

    数据库格式: 数据库mysql语句: FROM_UNIXTIME( s.timemodified, '%Y-%m-%d %h:%i:%s' ) 生成结果: 测试sql为: SELECT *, FROM ...

  8. bcftools合并vcf文件

    见命令: bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz 参考链接:http://vcftools.sourceforge.ne ...

  9. PHP生成和获取XML格式数据

    在做数据接口时,我们通常要获取第三方数据接口或者给第三方提供数据接口,而这些数据格式通常是以XML或者JSON格式传输,本文将介绍如何使用PHP生成XML格式数据供第三方调用以及如何获取第三方提供的X ...

随机推荐

  1. 从Oracle数据库中查询前几个月数据时需要注意的一些问题

    在最近的一个项目中,有一个需求就是要查询数据库中前几个月的历史数据,但是由于自己考虑不全面造成了程序的bug,现在将这一块好好作一个总结,希望以后不再犯这种很低级的错误,首先贴出查询中用到的一个子函数 ...

  2. epoch、 iteration和batchsize区别

    转自: https://blog.csdn.net/qq_27923041/article/details/74927398 深度学习中经常看到epoch. iteration和batchsize,下 ...

  3. XCTF 4th-WHCTF-2017 creakme

    exe文件 运行一下 随便输一下 ps.这个曹操身边的故事挺有意思的 但是没啥卵用....... 查一下壳无壳 ida载入 发现找不到main函数 直接看start感觉逻辑乱乱的(萌新求不喷..... ...

  4. Python——Button参数

    anchor:   指定按钮上文本的位置:  background(bg): 指定按钮的背景色:  bitmap:指定按钮上显示的位图:  borderwidth(bd): 指定按钮边框的宽度:  c ...

  5. Python——进程队列

    队列 先进先出 from multiprocessing import Queue q = Queue(5) #队列的大小 q.put(1) #放入内容 q.put(2) #放入内容 q.put(3) ...

  6. How to remove ROM in MAME

    /usr/share/games/mame/roms/ /usr/local/share/games/mame/roms/ sudo rm /usr/local/share/games/mame/ro ...

  7. sun.misc.BASE64Encoder----》找不到jar包的解决方法

    1.右键项目->属性->java bulid path->jre System Library->access rules->resolution选择accessible ...

  8. codeforces722B

    Verse Pattern CodeForces - 722B You are given a text consisting of n lines. Each line contains some ...

  9. 重写Distinct

    添加类并继承`IEqualityComparer`,重写方法 public class DistinctComparer : IEqualityComparer<ActionInfo> { ...

  10. BZOJ4653 [NOI2016] 区间 【线段树】

    题目分析: 首先思考一个二分答案的做法.我们可以注意到答案具有单调性,所以可以二分答案. 假设当前二分的答案是$ k $.那么按照大小顺序插入每个区间,同时在末端删除会对答案产生影响的区间.这里不妨用 ...