bcftools将vcf生成bgzip和index格式
利用bcftools软件将vcf格式生成gz格式和index格式,需要用到“-Oz”和“index”命令,具体如下:
/bcftools-1.8/bin/bcftools view ExAC.vcf -Oz -o ExAC.vcf.gz
/bcftools-1.8/bin/bcftools index ExAC.vcf.gz
bcftools将vcf生成bgzip和index格式的更多相关文章
- Android使用DOM生成和输出XML格式数据
Android使用DOM生成和输出XML格式数据 本文主要简单解说怎样使用DOM生成和输出XML数据. 1. 生成和输出XML数据 代码及凝视例如以下: try { DocumentBuilderFa ...
- 根据日志来源的不同生成不同的index索引
使用filebeat收集系统日志,不同应用的日志,然后把这些日志传输给Logstash,再然后交由elasticsearch处理,那么如何区分不同的日志来源呢? filebeat.yml配置文件中不启 ...
- [shiro学习笔记]第四节 使用源代码生成Shiro的CHM格式的API文档
版本为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源代码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源代码 shiro官网: http://shiro.ap ...
- [shiro学习笔记]第四节 使用源码生成Shiro的CHM格式的API文档
版本号为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源码 shiro官网: http://shiro.apa ...
- bcftools 提取vcf(snp/indel)文件子集
做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...
- ExtJs动态生成treepanel的Json格式
在节点中加上"checked"属性,会自动生成checkbox. 获取选中节点 var nodeArray = ""; var nodesObj = mytre ...
- mysql格式化整数类型时间生成年月日时分秒格式(long或string接收)
数据库格式: 数据库mysql语句: FROM_UNIXTIME( s.timemodified, '%Y-%m-%d %h:%i:%s' ) 生成结果: 测试sql为: SELECT *, FROM ...
- bcftools合并vcf文件
见命令: bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz 参考链接:http://vcftools.sourceforge.ne ...
- PHP生成和获取XML格式数据
在做数据接口时,我们通常要获取第三方数据接口或者给第三方提供数据接口,而这些数据格式通常是以XML或者JSON格式传输,本文将介绍如何使用PHP生成XML格式数据供第三方调用以及如何获取第三方提供的X ...
随机推荐
- Django--CRM-客户列表展示, 分页
一 . 客户列表展示 为了插入数据方便,我们可以用django里面的admin插入数据 创建超级用户 把语言改成中文 结果: 列表展示 展示不同字段的方式: # 有需要的可以写 def__str__( ...
- RuntimeError: cryptography requires setuptools 18.5 or newer, please upgrade to a newer version of setuptool
setuptool 太老了,更新下: pip install --upgrade setuptools
- vue 響應接口
全局方式: 增加屬性和set()和get(): vue.set(targname,key,vaule) targname:對象名或者數組名 key:字符串 value:任何值 刪除屬性和set()和g ...
- LoadRunner Vuser接口测试脚本 Post举例
发送内容为JSON的POST请求需要加入"EncType=application/json",表单参数不需要.(JAVA API) // POST接口调用 web.custom_r ...
- nodejs zip 安装配置
1.下载 下载地址:https://nodejs.org/zh-cn/download/ 选择相应的版本下载 2.解压缩 将文件解压到要安装的位置,并新建两个目录 node-global :npm全局 ...
- [开源 .NET 跨平台 Crawler 数据采集 爬虫框架: DotnetSpider] [一] 初衷与架构设计
[DotnetSpider 系列目录] 一.初衷与架构设计 二.基本使用 三.配置式爬虫 四.JSON数据解析与配置系统 五.如何做全站采集 为什么要造轮子 同学们可以去各大招聘网站查看一下爬虫工程师 ...
- python--使用pymyslq操作数据库
1.安装pymysql 在命令行内输入 pip install pymysql : 2.pycharm连接mysql 在进行本文以下内容之前需要注意: 你有一个MySQL数据库,并且已经启动. 你有可 ...
- SpringBoot部署jar与war
jar部署与启动/关闭 1.打包 clean 清理已有target目录 package 重新打包 获取打包路径,通过 scp命令发送到服务器端,scp -P ${port} ${.jar} ${use ...
- 查询SQLSERVER中系统所有表
SQL 查询所有表名: SELECT NAME FROM SYSOBJECTS WHERE TYPE='U' SELECT * FROM INFORMATION_SCHEMA.TABLES 查询表的所 ...
- Tarjan求强连通分量,缩点,割点
Tarjan算法是由美国著名计算机专家发明的,其主要特点就是可以求强连通分量和缩点·割点. 而强联通分量便是在一个图中如果有一个子图,且这个子图中所有的点都可以相互到达,这个子图便是一个强连通分量,并 ...