利用bcftools软件将vcf格式生成gz格式和index格式,需要用到“-Oz”和“index”命令,具体如下:

/bcftools-1.8/bin/bcftools view ExAC.vcf -Oz -o ExAC.vcf.gz
/bcftools-1.8/bin/bcftools index ExAC.vcf.gz

bcftools将vcf生成bgzip和index格式的更多相关文章

  1. Android使用DOM生成和输出XML格式数据

    Android使用DOM生成和输出XML格式数据 本文主要简单解说怎样使用DOM生成和输出XML数据. 1. 生成和输出XML数据 代码及凝视例如以下: try { DocumentBuilderFa ...

  2. 根据日志来源的不同生成不同的index索引

    使用filebeat收集系统日志,不同应用的日志,然后把这些日志传输给Logstash,再然后交由elasticsearch处理,那么如何区分不同的日志来源呢? filebeat.yml配置文件中不启 ...

  3. [shiro学习笔记]第四节 使用源代码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源代码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源代码 shiro官网: http://shiro.ap ...

  4. [shiro学习笔记]第四节 使用源码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本号为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源码 shiro官网: http://shiro.apa ...

  5. bcftools 提取vcf(snp/indel)文件子集

    做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...

  6. ExtJs动态生成treepanel的Json格式

    在节点中加上"checked"属性,会自动生成checkbox. 获取选中节点 var nodeArray = ""; var nodesObj = mytre ...

  7. mysql格式化整数类型时间生成年月日时分秒格式(long或string接收)

    数据库格式: 数据库mysql语句: FROM_UNIXTIME( s.timemodified, '%Y-%m-%d %h:%i:%s' ) 生成结果: 测试sql为: SELECT *, FROM ...

  8. bcftools合并vcf文件

    见命令: bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz 参考链接:http://vcftools.sourceforge.ne ...

  9. PHP生成和获取XML格式数据

    在做数据接口时,我们通常要获取第三方数据接口或者给第三方提供数据接口,而这些数据格式通常是以XML或者JSON格式传输,本文将介绍如何使用PHP生成XML格式数据供第三方调用以及如何获取第三方提供的X ...

随机推荐

  1. linux redis服务安装

    redis下载 官网地址:https://redis.io/download 在Linux下安装Redis非常简单,具体步骤如下(官网有说明): 1.下载源码,解压缩后编译源码. $ wget htt ...

  2. 关于jenkins旧的构建导致磁盘空间不足问题

    简述: Jenkins在每一次的执行构建后,都会对该构建的项目生成一个历史构建记录以及生成一份历史构建的项目发布包,长期累积可能会占用大量磁盘空间 jenkins构建jobs路径如下图: 解决办法: ...

  3. SQL Server中的完全连接(full join)

    一.建库和建表 create database scort use scort create table emp ( empno int primary key, ename ), sal int, ...

  4. falsk 项目中日志设置

    app/__init__.py: 1 import logging from logging.handlers import RotatingFileHandler ''' 开发中使用DEBUG级别, ...

  5. Hack You CTF 2014: NotEasyTask

    exe文件,运行后闪退,peid查一下,发现是是c#写的 Reflector打开 找到Main: private static void Main(string[] args) { string ho ...

  6. How to sign app

    codesign --display --verbose=4 /applications/qq.app codesign --display --entitlements - /application ...

  7. web font

    gfx.downloadable_fonts.enabled

  8. 页面传递的都是string ; 每个标签要有name的原因是为了取值 因为传递给后台是键值对的形式

    页面传递的都是string ; 每个标签要有name的原因是为了取值  因为传递给后台是键值对的形式

  9. 训练赛-Move Between Numbers

    题意:给你n个数,每个数有20个数字,每两个数字之间如果相等的数字数量为17个(一定是17),就能从一个数字到达另一个数字,给你两个数字编号,求从第一个数字编号到第二个数字编号之间最少需要走几次: 解 ...

  10. TP5.x——打印SQL语句

    操作 使用fetchSql,然后sql就会只输出sql语句而不执行 var_dump(Db::name('user')->where(array('id'=>$this->_uid, ...