利用bcftools软件将vcf格式生成gz格式和index格式，需要用到“-Oz”和“index”命令，具体如下：

/bcftools-1.8/bin/bcftools view ExAC.vcf -Oz -o ExAC.vcf.gz

/bcftools-1.8/bin/bcftools index ExAC.vcf.gz

bcftools将vcf生成bgzip和index格式的更多相关文章

  1. Android使用DOM生成和输出XML格式数据

    Android使用DOM生成和输出XML格式数据 本文主要简单解说怎样使用DOM生成和输出XML数据. 1. 生成和输出XML数据 代码及凝视例如以下: try { DocumentBuilderFa ...

  2. 根据日志来源的不同生成不同的index索引

    使用filebeat收集系统日志,不同应用的日志,然后把这些日志传输给Logstash,再然后交由elasticsearch处理,那么如何区分不同的日志来源呢? filebeat.yml配置文件中不启 ...

  3. [shiro学习笔记]第四节 使用源代码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源代码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源代码 shiro官网: http://shiro.ap ...

  4. [shiro学习笔记]第四节 使用源码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本号为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源码 shiro官网: http://shiro.apa ...

  5. bcftools 提取vcf（snp/indel）文件子集

    做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...

  6. ExtJs动态生成treepanel的Json格式

    在节点中加上"checked"属性,会自动生成checkbox. 获取选中节点 var nodeArray = ""; var nodesObj = mytre ...

  7. mysql格式化整数类型时间生成年月日时分秒格式(long或string接收)

    数据库格式: 数据库mysql语句: FROM_UNIXTIME( s.timemodified, '%Y-%m-%d %h:%i:%s' ) 生成结果: 测试sql为: SELECT *, FROM ...

  8. bcftools合并vcf文件

    见命令: bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz 参考链接:http://vcftools.sourceforge.ne ...

  9. PHP生成和获取XML格式数据

    在做数据接口时,我们通常要获取第三方数据接口或者给第三方提供数据接口,而这些数据格式通常是以XML或者JSON格式传输,本文将介绍如何使用PHP生成XML格式数据供第三方调用以及如何获取第三方提供的X ...

随机推荐

  1. php redis常用方法代码例子

    1,connect 描述:实例连接到一个Redis.参数:host: string,port: int返回值:BOOL 成功返回:TRUE;失败返回:FALSE 示例: <?php $redis ...

  2. python之路--MySQL权限管理 数据备份还原

    一 权限管理 mysql最高管理者是root用户, 这个一般掌握在公司DBA手里, 当你想去对数据库进行一些操作的时候,需要DBA授权给你. 1. 对新用户增删改 1. 创建用户 # 要先use my ...

  3. 重写TreeView模板来实现数据分层展示(一)

    总想花些时间来好好总结一下TreeView这个WPF控件,今天来通过下面的这几个例子来好好总结一下这个控件,首先来看看一个常规的带虚线的TreeView控件吧,在介绍具体如何完成之前首先来看看最终实现 ...

  4. HTML实现包含公共部分：通过ECMA6的模块化，纯前端实现类似jsp:include的功能

    以前一直是用 jsp:include 的方式来引入 html 头部的公共部分 php也有类似的方式 但以上两种,个人感觉都并不纯粹,本着折腾的精神,优化原有代码,解耦合 使用 ECMA6 的模块化方式 ...

  5. solr安装配置（一）

    本文使用的solr版本是solr-5.5.5. 步骤: 1.解压solr压缩包. 2.将solr-5.5.5\server\solr-webapp目录下面的文件拷贝到Tomcat的webapps目录下 ...

  6. Java使用RabbitMQ之订阅分发（Topic）

    使用RabbitMQ进行消息发布和订阅,生产者将消息发送给转发器(exchange),转发器根据路由键匹配已绑定的消息队列并转发消息,主题模式支持路由键的通配. 生产者代码: package org. ...

  7. 【python练习题】程序10

    #10.题目:暂停一秒输出,并格式化当前时间. import time print(time.time())#timestamp print(time.localtime(time.time()))# ...

  8. iOS WKWebView全屏浏览网页返回 状态栏问题

    问题: 用这个方法隐藏显示状态栏,总是带有残余 过一会才能消失掉 [[UIApplication sharedApplication]setStatusBarHidden:YES]; 可以切换状态栏的 ...

  9. BZOJ5419[Noi2018]情报中心——线段树合并+虚树+树形DP

    题目链接: [NOI2018]情报中心 题目大意:给出一棵n个节点的树,边有非负边权,并给出m条链,对于每条链有一个代价,要求选出两条有公共边的链使两条链的并的边权和-两条链的代价和最大. 花了一天的 ...

  10. BZOJ4372烁烁的游戏——动态点分治+线段树(点分树套线段树)

    题目描述 背景:烁烁很喜欢爬树,这吓坏了树上的皮皮鼠.题意:给定一颗n个节点的树,边权均为1,初始树上没有皮皮鼠.烁烁他每次会跳到一个节点u,把周围与他距离不超过d的节点各吸引出w只皮皮鼠.皮皮鼠会被 ...