利用bcftools软件将vcf格式生成gz格式和index格式,需要用到“-Oz”和“index”命令,具体如下:

/bcftools-1.8/bin/bcftools view ExAC.vcf -Oz -o ExAC.vcf.gz
/bcftools-1.8/bin/bcftools index ExAC.vcf.gz

bcftools将vcf生成bgzip和index格式的更多相关文章

  1. Android使用DOM生成和输出XML格式数据

    Android使用DOM生成和输出XML格式数据 本文主要简单解说怎样使用DOM生成和输出XML数据. 1. 生成和输出XML数据 代码及凝视例如以下: try { DocumentBuilderFa ...

  2. 根据日志来源的不同生成不同的index索引

    使用filebeat收集系统日志,不同应用的日志,然后把这些日志传输给Logstash,再然后交由elasticsearch处理,那么如何区分不同的日志来源呢? filebeat.yml配置文件中不启 ...

  3. [shiro学习笔记]第四节 使用源代码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源代码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源代码 shiro官网: http://shiro.ap ...

  4. [shiro学习笔记]第四节 使用源码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本号为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源码 shiro官网: http://shiro.apa ...

  5. bcftools 提取vcf(snp/indel)文件子集

    做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...

  6. ExtJs动态生成treepanel的Json格式

    在节点中加上"checked"属性,会自动生成checkbox. 获取选中节点 var nodeArray = ""; var nodesObj = mytre ...

  7. mysql格式化整数类型时间生成年月日时分秒格式(long或string接收)

    数据库格式: 数据库mysql语句: FROM_UNIXTIME( s.timemodified, '%Y-%m-%d %h:%i:%s' ) 生成结果: 测试sql为: SELECT *, FROM ...

  8. bcftools合并vcf文件

    见命令: bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz 参考链接:http://vcftools.sourceforge.ne ...

  9. PHP生成和获取XML格式数据

    在做数据接口时,我们通常要获取第三方数据接口或者给第三方提供数据接口,而这些数据格式通常是以XML或者JSON格式传输,本文将介绍如何使用PHP生成XML格式数据供第三方调用以及如何获取第三方提供的X ...

随机推荐

  1. 命名自我规约manual

    前端: 所有文件命名都小写,多个单词连接使用 “-” 变量命名规则还是驼峰式,或者在前面加个 “_” SQL: MySQL: 所有命名都小写,无论库.表.还是字段等等,都小写 多个单词之间的分隔,使用 ...

  2. SpringJdbc框架

    import javax.sql.DataSource; import org.springframework.jdbc.core.JdbcTemplate; import JdbcUtils.Jdb ...

  3. 九、.net core用orm继承DbContext(数据库上下文)方式操作数据库

    一.创建一个DataContext普通类继承DbContext  安装程序集:Pomelo.EntityFrameworkCore.MySql   二.配置连接字符串(MySql/SqlServer都 ...

  4. Python——glob模块

    一.作用: 找到匹配上特定格式的所有文件和文件夹,跟windows的文件搜索功能差不多 二.三种匹配符 *代表0个或多个字符 ?代表一个字符 []匹配指定范围内的字符,如[0-9]匹配数 三.应用方法 ...

  5. vpx

    VPX 编辑 本词条缺少名片图,补充相关内容使词条更完整,还能快速升级,赶紧来编辑吧! VPX总线是VITA(VME International Trade Association, VME国际贸易协 ...

  6. 【C/C++】查找(一):静态查找表

    {静态查找表 + 动态查找表} 所谓动态,就是,找的时候没有则添加,或者能删除 关键字:primary key:用来表示查找表中的一条记录 {主关键字 + 次关键字} 主关键字是唯一的,用来唯一的标识 ...

  7. u盘中毒,启动显示找不到指定模块

    u盘中毒,插入电脑,启动显示找不到指定模块,关闭杀毒软件还是这样: 小编经常是在学校教室的电脑上插入U盘再拔出就出现这样的情况,遇到N次了, 所以决定把方法记录下来: (演示使用的是win10系统,其 ...

  8. 上传第三方jar包至maven私服,以geotools为例

    上传jar包(模块打包方式为jar) mvn deploy:deploy-file -DgroupId=org.geotools -DartifactId=gt-api -Dversion=10.3 ...

  9. MySql 主从同步 (库名不同)

    主库:192.168.1.250 从库:192.168.1.199 主库  my.ini # For advice on how to change settings please see # htt ...

  10. Android Spinner 绑定键值对

    这里给大家提供下绑定 spinner键值对的方法. 首先创建绑定模型BaseItem public class BaseItem { public BaseItem(Integer id,String ...