利用bcftools软件将vcf格式生成gz格式和index格式，需要用到“-Oz”和“index”命令，具体如下：

/bcftools-1.8/bin/bcftools view ExAC.vcf -Oz -o ExAC.vcf.gz

/bcftools-1.8/bin/bcftools index ExAC.vcf.gz

bcftools将vcf生成bgzip和index格式的更多相关文章

  1. Android使用DOM生成和输出XML格式数据

    Android使用DOM生成和输出XML格式数据 本文主要简单解说怎样使用DOM生成和输出XML数据. 1. 生成和输出XML数据 代码及凝视例如以下: try { DocumentBuilderFa ...

  2. 根据日志来源的不同生成不同的index索引

    使用filebeat收集系统日志,不同应用的日志,然后把这些日志传输给Logstash,再然后交由elasticsearch处理,那么如何区分不同的日志来源呢? filebeat.yml配置文件中不启 ...

  3. [shiro学习笔记]第四节 使用源代码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源代码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源代码 shiro官网: http://shiro.ap ...

  4. [shiro学习笔记]第四节 使用源码生成Shiro的CHM格式的API文档

    版本号为1.2.3的shiro API chm个事故文档生成. 获取shiro源码 编译生成API文档 转换成chm格式 API 获取shiro源码 shiro官网: http://shiro.apa ...

  5. bcftools 提取vcf（snp/indel）文件子集

    做群体变异检测后,通常会有提取子集的操作,之前没有发现bcftools有这个功能,都是自己写脚本操作,数据量一上来,速度真的是让人无语凝噎.这里记录下提取子vcf文件的用法,软件版本:bcftools ...

  6. ExtJs动态生成treepanel的Json格式

    在节点中加上"checked"属性,会自动生成checkbox. 获取选中节点 var nodeArray = ""; var nodesObj = mytre ...

  7. mysql格式化整数类型时间生成年月日时分秒格式(long或string接收)

    数据库格式: 数据库mysql语句: FROM_UNIXTIME( s.timemodified, '%Y-%m-%d %h:%i:%s' ) 生成结果: 测试sql为: SELECT *, FROM ...

  8. bcftools合并vcf文件

    见命令: bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz 参考链接:http://vcftools.sourceforge.ne ...

  9. PHP生成和获取XML格式数据

    在做数据接口时,我们通常要获取第三方数据接口或者给第三方提供数据接口,而这些数据格式通常是以XML或者JSON格式传输,本文将介绍如何使用PHP生成XML格式数据供第三方调用以及如何获取第三方提供的X ...

随机推荐

  1. 无法将从VSS中的解决方案添加到TFS的源代码管理器中

    VSS是一种非常有用的项目文件管理工具,百度百科的解释是:VSS 的全称为 Visual Source Safe .作为 Microsoft Visual Studio 的一名成员,它主要任务就是负责 ...

  2. UDP反射DDoS攻击原理和防范

    东南大学:UDP反射DDoS攻击原理和防范 2015-04-17 中国教育网络 李刚 丁伟 反射攻击的防范措施 上述协议安装后由于有关服务默认处于开启状态,是其被利用的一个重要因素.因此,防范可以从配 ...

  3. centos7根分区扩容(亲测有效)

    root@haojftest:~# df -h 文件系统 容量 已用 可用 已用% 挂载点 /dev/mapper/centos_test2-root 28G 14G 15G % / devtmpfs ...

  4. Puppet日常总结

    在工作中常常会有这样一种需求:某几个人需要某些测试服务器的root权限.比如,开发部门的张三,李四,王五,赵六需要rsync服务器的root权限.有些同学会说那直接 visudo在里面添加几个人不就行 ...

  5. JavaSE从入门到精通

      1.JavaSE的安装 windows下安装完成后,配置环境变量如下: JAVA_HOME       C:\Program Files (x86)\Java\jdk1.8.0_91 CLASSP ...

  6. Delphi 限制Edit输入 多个例子

    procedure TForm1.Edit1KeyPress(Sender: TObject; var Key: Char); begin if not (key in [ '.',#8]) then ...

  7. 二、kubernetes

    一.kubernetes(简称k8s) 集群示意图 Kubernetes工作模式server-client,Kubenetes Master提供集中化管理Minions.部署1台Kubernetes ...

  8. Membership 介绍

    ASP.NET成员资格为您提供了验证和存储用户凭据的内置方式.因此,ASP.NET成员可以帮助您管理网站中的用户身份验证.您可以使用ASP.NET表单身份验证使用ASP.NET成员身份,方法是使用AS ...

  9. 【C/C++】实现数据结构广义表

    1. 广义表的定义     每个元素可以为Atom,原子,也可以为线性表.      线性表的推广.线性表元素有唯一的前驱和后继,为线性表,而广义表是多层次的线性表      表头:第一个元素,可能是 ...

  10. Power Network POJ - 1459 网络流 DInic 模板

    #include<cstring> #include<cstdio> #define FOR(i,f_start,f_end) for(int i=f_startl;i< ...