一篇关于cfDNA的综述

文章题目：A Field Guide for Cancer Diagnostics using cell-free DNA: from Principles to Practice and Clinical Applications

时间：2017年11月

摘要：癌症患者的基因分子层面的信息给新药开发和治疗方法带来了一场新的革命。目前组织样本检测是基因分子检测的金标准，但其存在两点不足：1.取样方式为风险性入侵式取样，有许多癌种和患者无法满足该要求。  2.由于异质性的原因，取得的组织样本可能不能完整地代表肿瘤信息。  检测血液中cfDNA的信息能很好的弥补上述的缺点。cfDNA是人体组织排放到血液里的DNA片段，不管是正常人还是病人都会发生，能够作为癌症早筛，癌症治疗，治疗后的分子标记物。随着cfDNA在临床中的广泛应用，需要建立标准规则，包括样本的前处理：分离和定量，以及后面的不同分析方法，从单点的PCR到基因组范围的技术。

内容：

第一部分:

1.可能存在cfDNA的地方：血液，尿液，粪便，脑脊髓液，胸水，唾液。

1948年，首次在人类血液中发现了cfDNA。30年后，发现癌症病人中有更高含量的cfDNA。随后发现，肿瘤特异性的dna片段ctDNA也在cfDNA中。在膀胱癌和结直肠癌，非小细胞肺癌患者的尿液中也发现了cfDNA。

2.cfDNA的片段和含量：

cfDNA的片段大都集中在167bp。

cfDNA的大部分来源了细胞的正常凋亡，而ctDNA的含量有很大变化，低至0.01%，高达超过60%，这和肿瘤的大小和进展有关。

表A：检测几个明确的突变需要的cfDNA投入量，以及对应的基因组当量。

图B：肿瘤的大小和cfDNA中检测到的突变频率的大小成正比。

图C：是表A的展示图。

3.cfDNA检测的重要性：

多区域取样研究，就是从原发灶和转移灶各自取样检测，发现在两者在形态学上和分子表型上有异质性。而一个组织检测不能完全代表整个肿瘤信息，ctDNA来源于多个组织，包括原发灶和转移灶，其携带的信息更全面，也更有用，特别是在用药治疗后出现耐药性的情况下。

第二部分：

待续。。