Graph database_neo4j 底层存储结构分析(7)
3.7 Relationship 的存储
下面是neo4j graph db 中,Relationship数据存储对应的文件:
neostore.relationshipgroupstore.db
neostore.relationshipgroupstore.db.id
neostore.relationshipstore.db
neostore.relationshipstore.db.id
neostore.relationshiptypestore.db
neostore.relationshiptypestore.db.id
neostore.relationshiptypestore.db.names
neostore.relationshiptypestore.db.names.id
neo4j 中, Relationship 的存储是由 RelationshipStore , RelationshipGroupStore, RelationshipTypeTokenStore和StringPropertyStore 4种类型的Store配合来完成的. 其中RelationshipStore 是Relationship最主要的存储结构;当一个Node 的关系数达到一定的阀值时,才会对关系分组(group), RelationshipGroupStore 用来保存关系分组数据;RelationshipTypeTokenStore和StringPropertyStore 配合用来存储关系的类型。
关系的类型的字符串描述值是存在StringPropertyStore这样的DynamicStore 中,如果长度超过一个block ,则分block存储,并将其在StringPropertyStore中的第1个block 的 block_id 保存到 RelationshipTypeTokenStore类型文件相应record 的name_id字段中。

ArrayPropertyStore的存储格式见< 3.3.2 DynamicStore 类型>,下面分别介绍一下RelationshipTypeTokenStore, RelationshipStore和RelationshipStore的文件存储格式。
3.7.1 RelationshipTypeTokenStore的主文件存储格式

类RelationshipTypeTokenStore对应的存储文件是neostore.relationshiptypestore.db,其对应的存储格式如上图所示:是一个长度为 RECORD_SIZE=5 Bytes 的 record 数组和和一个字符串描述符“RelationshipTypeStore v0.A.2”(文件类型描述TYPE_DESCRIPTOR和 neo4j 的 ALL_STORES_VERSION) 构成。访问时,可以通过 token_id 作为数组的下标进行访问。
record 是有 1Byte的 in_use 和 4Bytes 的 name_id 构成。
3.7.2 RelationshipStore的文件存储格式
类RelationshipTypeTokenStore对应的存储文件是neostore.relationshipstore.db,其文件存储格式示意图如下,整个文件是有一个 RECORD_SIZE=34Bytes 的定长数组和一个字符串描述符“RelationshipStore v0.A.2”(文件类型描述TYPE_DESCRIPTOR和 neo4j 的 ALL_STORES_VERSION构成)。访问时,可以通过 node_id 作为数组的下标进行访问。

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</pre><div>// record header size// directed|in_use(byte)+first_node(int)+second_node(int)+rel_type(int)+// first_prev_rel_id(int)+first_next_rel_id+second_prev_rel_id(int)+// second_next_rel_id+next_prop_id(int)+first-in-chain-markers(1)public static final int RECORD_SIZE = 34;</div><pre> |
下面介绍一下 relationship record 中每个字段的含义:
- in_use(1 Byte) : 第 1 字节, 分成3部分.
// [ , x] in use flag
// [ ,nnn ] first node high order bits
// [pppp, ] next prop high order bits
第1 bit 表示 record 是否在 use;
第2~4 bit 表示first_node的node_id的高3位;
第 5~8 bit表示 next_prop_id 的property_id 的 高4位
- first_node(4 Bytes) : 第2~5字节是RelationShip的from_node 的node_id 的低32位. 加上inUse 字节的第 2~4 bit 作为高3位,构成一个完整的35位node_id。
- second_node(4 Bytes) : 第6~9字节是RelationShip的to_node 的node_id 的低32位. 加上rel_type的第29~31 bit作为高3位,构成一个完整的35位node_id。
- rel_type(4 Bytes) : 第 10~13 字节, 分成6部分;
// [ , ][ , ][xxxx,xxxx][xxxx,xxxx] type
- 第29~31 位是second_node 的node_id高3位;
- 第26~28 位是first_next_rel_id 的 relationship_id高3位;
- 第23~25 位是first_next_rel_id 的relationship_id高3位;
- 第20~22 位是second_prev_rel_id 的relationship_id高3位;
- 第17~19 位是second_next_rel_id 的relationship_id高3位;
- 第 1~16 位 表示 RelationShipType;
- first_prev_rel_id(4 Bytes) : 第14~17字节是from_node 的排在本RelationShip 前面一个RelationShip的 relationship_id 的低32位. 加上rel_type的第 26~28 bit 作为高3位,构成一个完整的35位relationship_id。
- first_next_rel_id(4 Bytes) : 第18~21字节是from_node 的排在本RelationShip 前面一个RelationShip的 relationship_id 的低32位. 加上rel_type的第 23~25 bit 作为高3位,构成一个完整的35位relationship_id。
- second_prev_rel_id(4 Bytes) : 第22~25字节是from_node 的排在本RelationShip 前面一个RelationShip的 relationship_id 的低32位. 加上rel_type的第 20~22 bit 作为高3位,构成一个完整的35位relationship_id。
- second_next_rel_id(4 Bytes) : 第26~29字节是from_node 的排在本RelationShip 前面一个RelationShip的 relationship_id 的低32位. 加上rel_type的第 17~19 bit 作为高3位,构成一个完整的35位relationship_id。
- next_prop_id(4 Bytes) : 第30~33字节是本RelationShip第1个Property的property_id 的低32位. 加上in_use的第 5~8 bit 作为高3位,构成一个完整的36 位property_id。
- first-in-chain-markers(1 Byte) : 目前只用了第1位和第2位,其作用笔者还没搞清楚。
3.7.2.1 RelationshipStore.java
与neostore.relationshipstore.db文件相对应的类是RelationshipStore,负责RelationshipRecord从neostore.relationshipstore.db文件的读写。下面看一下 neostore.relationshipstore.db 中 getRecord 成员函数,可以帮助理解 Relationship Record 的存储格式。
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</pre><div>private RelationshipRecord getRecord( long id, PersistenceWindow window,RecordLoad load ){Buffer buffer = window.getOffsettedBuffer( id );// [ , x] in use flag// [ ,xxx ] first node high order bits// [xxxx, ] next prop high order bitslong inUseByte = buffer.get();boolean inUse = (inUseByte & 0x1) == Record.IN_USE.intValue();if ( !inUse ){switch ( load ){case NORMAL:throw new InvalidRecordException( "RelationshipRecord[" + id + "] not in use" );case CHECK:return null;}}long firstNode = buffer.getUnsignedInt();long firstNodeMod = (inUseByte & 0xEL) << 31;long secondNode = buffer.getUnsignedInt();// [ xxx, ][ , ][ , ][ , ] second node high order bits, 0x70000000// [ ,xxx ][ , ][ , ][ , ] first prev rel high order bits, 0xE000000// [ , x][xx , ][ , ][ , ] first next rel high order bits, 0x1C00000// [ , ][ xx,x ][ , ][ , ] second prev rel high order bits, 0x380000// [ , ][ , xxx][ , ][ , ] second next rel high order bits, 0x70000// [ , ][ , ][xxxx,xxxx][xxxx,xxxx] typelong typeInt = buffer.getInt();long secondNodeMod = (typeInt & 0x70000000L) << 4;int type = (int)(typeInt & 0xFFFF);RelationshipRecord record = new RelationshipRecord( id,longFromIntAndMod( firstNode, firstNodeMod ),longFromIntAndMod( secondNode, secondNodeMod ), type );record.setInUse( inUse );long firstPrevRel = buffer.getUnsignedInt();long firstPrevRelMod = (typeInt & 0xE000000L) << 7;record.setFirstPrevRel( longFromIntAndMod( firstPrevRel, firstPrevRelMod ) );long firstNextRel = buffer.getUnsignedInt();long firstNextRelMod = (typeInt & 0x1C00000L) << 10;record.setFirstNextRel( longFromIntAndMod( firstNextRel, firstNextRelMod ) );long secondPrevRel = buffer.getUnsignedInt();long secondPrevRelMod = (typeInt & 0x380000L) << 13;record.setSecondPrevRel( longFromIntAndMod( secondPrevRel, secondPrevRelMod ) );long secondNextRel = buffer.getUnsignedInt();long secondNextRelMod = (typeInt & 0x70000L) << 16;record.setSecondNextRel( longFromIntAndMod( secondNextRel, secondNextRelMod ) );long nextProp = buffer.getUnsignedInt();long nextPropMod = (inUseByte & 0xF0L) << 28;byte extraByte = buffer.get();record.setFirstInFirstChain( (extraByte & 0x1) != 0 );record.setFirstInSecondChain( (extraByte & 0x2) != 0 );record.setNextProp( longFromIntAndMod( nextProp, nextPropMod ) );return record;} |
3.7.3 RelationshipGroupStore类型的存储格式
当Node的Relationship数量超过一个阀值时,neo4j 会对 Relationship 进行分组,以便提供性能。neo4j 中用来实现这一功能的类是 RelationshipGroupStore.

其对应的文件存储格式如下:
整个文件是有一个 RECORD_SIZE=20Bytes 的定长数组和一个字符串“RelationshipGroupStore v0.A.2”(文件类型描述TYPE_DESCRIPTOR和 neo4j 的 ALL_STORES_VERSION构成)。访问时,可以通过 id 作为数组的下标进行访问。数组下标为0的 record 前4 Bytes 保存Relationship分组的阀值。
RelationshipGroupStore 的record 的格式如下:
- inUse(1 Byte):第1字节,共分成4部分
// [ , x] in use
// [ ,xxx ] high next id bits
// [ xxx, ] high firstOut bits
long inUseByte = buffer.get();
- 第1 bit: 表示 record 是否在 use;
- 第2~4 bit: 表示 next 的高3位;
- 第 5~7 bit:表示 firstOut高3位
- 第8 bit:没有用。
- highByte(1 Byte):第1字节,共分成4部分
// [ , x] in use
// [ ,xxx ] high next id bits
// [ xxx, ] high firstOut bits
long inUseByte = buffer.get();
- 第1 bit:没有用;
- 第2~4 bit: 表示 firstIn 的高3位;
- 第 5~7 bit:表示 firstLoop高3位
- 第8 bit:没有用。
- next :
- firstOut
- firstIn
- firstLoop
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