SimpleITK 和 Nibabel 区别在于:(nii图像可以看成2维,也可以看成三维)

SimpleITK读取数据是(X,Y,Z)显示,Nibabel读取图像是(Z,Y,X)显示,也就是Nibabel加载的图像会旋转90°,其中X表示通道数,即切片层数。详情

import SimpleITK as sitk
import skimage.io as io def read_img(path):
img = sitk.ReadImage(path)
data = sitk.GetArrayFromImage(img)
return data
#显示一个系列图
def show_img(data):
for i in range(data.shape[0]):
io.imshow(data[i,:,:], cmap = 'gray')
print(i)
io.show()
#单张显示
def show_img(ori_img):
io.imshow(ori_img[60], cmap = 'gray')
io.show()
path = 'F:/BaiduNetdiskDownload/COVID-19CTSeg/data/volume-0.nii'
data = read_img(path)
show_img(data)
import nibabel as nib
import matplotlib.pyplot as plt def read_data(path):
image_data = nib.load(path).get_data()
return image_data
# 单张显示
def show_img(ori_img):
plt.imshow(ori_img[:,:,60], cmap = 'gray')
plt.show() path = 'F:/BaiduNetdiskDownload/COVID-19CTSeg/data/volume-0.nii'
data = read_data(path)
show_img(data)

SimpleITK图像:

Nibabel图像:
 

SimpleITK 和 Nibabel 读取医学图像 nii 数据(2D显示)的更多相关文章

  1. excel to datatable (c#用NPOI将excel文件内容读取到datatable数据表中)

    将excel文件内容读取到datatable数据表中,支持97-2003和2007两种版本的excel 1.第一种是根据excel文件路径读取excel并返回datatable /// <sum ...

  2. 解剖SQLSERVER 第五篇 OrcaMDF里读取Bits类型数据(译)

    解剖SQLSERVER 第五篇  OrcaMDF里读取Bits类型数据(译) http://improve.dk/reading-bits-in-orcamdf/ Bits类型的存储跟SQLSERVE ...

  3. 从多个XML文档中读取数据用于显示webapi帮助文档

    前言: 你先得知道HelpPageConfig文件,不知道说明你现在不需要这个,所以下文就不用看了,等知道了再看也不急.当然如果你很知道这个,下文也不用看了,因为你会了. 方法一: new XmlDo ...

  4. Java读取Execl表格数据

    在前面提到用java代码新建一个Execl 表格并添加数据到表格中, 这次写了一个读取Execl表格数据并添加导数据库中的案列 给定对方一个Execl模板表格,如果导入的Execl表格和预订的表格不相 ...

  5. 上传读取Excel文件数据

    /// <summary> /// 上传读取Excel文件数据 /// 来自http://www.cnblogs.com/cielwater /// </summary> // ...

  6. JAVA TcpServer端使用Scanner读取不到数据的解决办法

    在使用JAVA进行Socket通信时,在Server端使用Scanner的nextLine()方法读取数据时,一直读取不到数据是因为Scanner是一个扫描器,它扫描数据都是去内存中一块缓冲区中进行扫 ...

  7. 我写的一个ExcelHelper通用类,可用于读取或生成数据

    读取或生成EXCEL数据的方法有很多,一般常见的有: 1.通过OFFICE EXCEL组件,优点:读取与生成EXCEL文件方便,缺点:服务器上必须安装OFFICE软件,且进程无法及时释放 2.通过第三 ...

  8. VC6.0读取Excel文件数据

    啰嗦一下:本人所在公司从事碟式斯特林太阳能发电设备的研发与销售.单台设备图如下: 工作原理如下:整个设备大致可分为五个部分, 1.服务器,负责气象.发电等数据存取,电.网连接等处理: 2.气象站,通过 ...

  9. 转: 从Mysql某一表中随机读取n条数据的SQL查询语句

    若要在i ≤ R ≤ j 这个范围得到一个随机整数R ,需要用到表达式 FLOOR(i + RAND() * (j – i + 1)).例如, 若要在7 到 12 的范围(包括7和12)内得到一个随机 ...

随机推荐

  1. 从0开发3D引擎(十二):使用领域驱动设计,从最小3D程序中提炼引擎(第三部分)

    目录 上一篇博文 继续实现 实现"DirectorJsAPI.init" 实现"保存WebGL上下文"限界上下文 实现"初始化所有Shader&quo ...

  2. Java面试必问之Hashmap底层实现原理(JDK1.8)

    1. 前言 上一篇从源码方面了解了JDK1.7中Hashmap的实现原理,可以看到其源码相对还是比较简单的.本篇笔者和大家一起学习下JDK1.8下Hashmap的实现.JDK1.8中对Hashmap做 ...

  3. Vue+Axios+iview+vue-router实战管理系统项目

    项目实现登陆验证,iviewui组件使用,vue-router路由拦截,在删除登陆存储的token后,直接路由进登陆页面,实战数据请求,本地data.json,笔者也是初出茅庐,在项目运行后,会一直c ...

  4. 关于HTTP那些事

    写这篇文章的原因 记录前端性能优化用到的关键概念 简化大家对HTTP的学习 大家或许面试的时候可以用得到哦 HTTP是什么 Web的应用层协议(超文本传输协议HyperText Transfer Pr ...

  5. Echarts轻松入门,内附踩坑秘籍

    首先介绍一下我们的主角ECharts ECharts,一个纯 Javascript 的图表库,可以流畅的运行在 PC 和移动设备上,兼容当前绝大部分浏览器(IE8/9/10/11,Chrome,Fir ...

  6. Python-Requests库的安装和调用

    #使用pip或者pip3安装requests库pip3 install requests #requests库:python #输入python进入命令行模式在cmd命令行中依次运行以下代码,或者直接 ...

  7. Data Vault 简介

    Data Vault 简介 Data Vault 2.0 不仅是建模技术,也提供了一整套数据仓库项目的方法论.它能提供一套非常可行的方案来满足数据仓库项目中对于历史轨迹和审核两个方面的需求. 多年来, ...

  8. IntelliJ IDEA 2018.3 x64的破解和安装

    IntelliJ IDEA 2018.3 x64的破解和安装 前言 IntelliJ IDEA 作为一个优秀的Java开发环境,深受许多开发者喜爱,但是它的价格却贵得让人无法接受,这篇文章将介绍永久激 ...

  9. nuxt.js如何实现同级目录下建多个动态路由,并将链接设置.html后缀

    nuxt.js中如果在同级目录中建两个_xxxx.vue的动态路由文件,那么页面跳转始终是跳的一个页面,如何解决这个问题呢?下面举个栗子: 第一步:新建两个页面文件 第二步:在nuxt.config. ...

  10. 通过CGAL将一个多边形剖分成Delaunay三角网

    目录 1. 概述 2. 实现 3. 结果 4. 参考 1. 概述 对于平面上的点集,通过Delaunay三角剖分算法能够构建一个具有空圆特性和最大化最小角特性的三角网.空圆特性其实就是对于两个共边的三 ...