SimpleITK和nibable读取nii文件

import SimpleITK as sitk

path = 'nii全路径'

nii_obj = sitk.GetArrayFromImage(sitk.ReadImage(path)) #shape为(c,h,w)，c为所有slice的数量

 

import nibable as nil

nii_obj = nil.load(path)

data_obj = nii_obj.dataobj #shape为 w,h,c

data_obj = np.transpose(data_obj,(2,1,0)) #shape为（c,h,w），c为所有slice的数量

 

速度对比: nibable比simpleitk快

   加载18*512*512的图像，SimpleITK耗时：0.1018986701965332 s   nibable加载+维度变换耗时: 0.09411430358886719 s