推荐R语言界的国内大佬于淼写的代谢组学workflow，包含了大部分代谢组学（以及暴露组）的数据分析方法。

Meta-Workflow

主要内容包括：

  • Sample collection
  • Pretreatment
  • Principles of metabolomics data analysis
  • Software selection
  • Batch correction
  • Annotation
  • Omics analysis
  • Exposome

顺便附上大佬的博客：

https://yufree.cn/

科学网：

http://blog.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=430956&do=blog&view=me&from=space&page=1

Metabolomics Workfolw的更多相关文章

  1. Integrated Metabolomics and Lipidomics Analyses Reveal Metabolic Reprogramming in Human Glioma with IDH1 Mutation (文献分享一组-黄旭蕾)

    题目:Integrated Metabolomics and Lipidomics Analyses Reveal Metabolic Reprogramming in Human Glioma wi ...

  2. 【代谢组学】Metabolomics资源推送

    入门课程 伯明翰大学: Metabolomics: Understanding Metabolism in the 21st Century 数据处理 阿拉巴马大学伯明翰分校5年(2013-2018) ...

  3. 数据挖掘 workfolw 总结

    个人将数据挖掘的流程简单表示为“ 数据 → 特征 → 模型 ”.   首先,明确问题的性质和任务(分类.回归.聚类.推荐.排序.关联分析.异常检测等): 其次,理解数据(含义.类型.值的范围),并通过 ...

  4. Integration of Metabolomics and Transcriptomics To Reveal Metabolic Characteristics and Key Targets Associated with Cisplatin Resistance in Nonsmall Cell Lung Cancer（解读人：林山云）

    期刊名:J. Proteome Res 发表时间:(2019年8月) IF:3.78 单位: 上海第九人民医院药学系,上海交通大学药学院 上海交通大学药物与生物化学系   物种:人源A549细胞系 技 ...

  5. 环境与工具2：建立高效的mac环境

    你的工作与生活离不开电脑,电脑是一个工具,也是一个环境.环境是不是绿水青山,是不是得心应手,这是很重要的事情.小程平时使用macbook来学习跟娱乐,最近重装了系统,很多环境与工具都需要重新组建. 那 ...

  6. 数据仓库 - 2.数据仓库设计思路及ETL设计思路

    一.数据仓库构建思想 构造数据仓库有两种方式:一是自上而下,一是自下而上. Bill Inmon先生推崇“自上而下”的方式,即一个企业建立唯一的数据中心,就像一个数据的仓库,其中数据是经过整合.经过清 ...

  7. 转录组分析综述A survey of best practices for RNA-seq data analysis

    转录组分析综述 转录组 文献解读 Trinity cufflinks 转录组研究综述文章解读 今天介绍下小编最近阅读的关于RNA-seq分析的文章,文章发在Genome Biology 上的A sur ...

  8. 2008 SCI 影响因子(Impact Factor)

    2008 SCI 影响因子(Impact Factor) Excel download 期刊名缩写 影响因子 ISSN号 CA-CANCER J CLIN 74.575 0007-9235 NEW E ...

  9. Oozie wordcount实战

    一.定义 基本概念 Action: An execution/computation task (Map-Reduce job, Pig job, a shell command). It can a ...

随机推荐

  1. Noip模拟63 2021.9.27（考场惊现无限之环）

    T1 电压机制 把题目转化为找那些边只被奇数环包含. 这样的话直接$dfs$生成一棵树,给每个点附上一个深度,根据其他的非树边都是返祖边 可以算出环内边的数量$dep[x]-dep[y]+1$,然后判 ...

  2. Unity——射线系统

    Unity射线系统 Demo展示 UI+Physical射线测试: FPS自定义射线测试: UGUI射线工具 实现功能,鼠标点击UI,返回鼠标点击的UI对象: 需要使用到鼠标点击事件-PointerE ...

  3. 大型DELETE（删除大量数据）的一种解决方案

    通过执行单条DELETE语句来删除一个大型的数据集会有以下的缺点: 1.DELETE语句的操作要被完整地记录到日志中,这要求在事务日志中要有足够的空间以完成整个事务: 2.在删除操作期间(可能会花费很 ...

  4. 神经网络 感知机 Perceptron python实现

    import numpy as np import matplotlib.pyplot as plt import math def create_data(w1=3,w2=-7,b=4,seed=1 ...

  5. Python import commands ImportError: No module named 'commands'

    ImportError: No module named 'commands' 在Python3中执行shell脚本,想要获取其执行状态和标准输出.错误输出 的数据,遇到这个错误,原因是command ...

  6. 攻防世界 WEB 高手进阶区 easytornado Writeup

    攻防世界 WEB 高手进阶区 easytornado Writeup 题目介绍 题目考点 Python模板 tornado 模板注入 Writeup 进入题目, 目录遍历得到 /flag.txt /w ...

  7. 集合之Map接口

    Map接口概述 Map与Collection并列存在.用于存储具有映射关系的数据 : key-value Map 中的 key 和 value 都可以是任何引用类型的数据 Map 中的 key 用Se ...

  8. MongoDB与MySQL效率对比

    本文主要通过批量与非批量对比操作的方式介绍MongoDB的bulkWrite()方法的使用.顺带与关系型数据库MySQL进行对比,比较这两种不同类型数据库的效率.如果只是想学习bulkWrite()的 ...

  9. django前后端分离403 csrf token missing or incorrect

    根据这个链接https://stackoverflow.com/a/26639895 这是一个django的跨域访问问题. django,会对合法的跨域访问做这样的检验,cookies里面存储的'cs ...

  10. VM的三种连接方式（转载）

    概述: VMWare提供了三种工作模式,它们是bridged(桥接模式).NAT(网络地址转换模式)和host-only(主机模式).要想在网络管理和维护中合理应用它们,你就应该先了解一下这三种工作模 ...