Windows+anaconda+jupyter notebook+R+python3.6

Windows+anaconda+jupyter notebook+R+python3.6 环境配置

1. 设置国内清华大学镜像

打开 anaconda prompt，输入命令

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r/win-64

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/mro/

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/pro/

2.  安装R

conda install R

3. 更新R

install.packages("installr")

require(installr)

updateR()

会弹出来安装地址，注意安装到anaconda/R路径下面，或者默认安装后把文件拷贝过来

4. 配置jupyter notebook

注意安装源选兰州的，不要选上海和广州！！！

install.packages(c('repr', 'IRdisplay', 'evaluate', 'crayon', 'pbdZMQ', 'devtools', 'uuid', 'digest'))
devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')
# 只在当前用户下安装
IRkernel::installspec()
# 或者是在系统下安装
IRkernel::installspec(user = FALSE)

搞定！

安装R包的时候注意：

conda安装R包有两种方式，一种是使用conda命令安装：conda install -c r package-name，需要注意的是conda下面的r包的名称与普通R包的名称不一样，具体名称可以在官网上面查询（http://docs.anaconda.com/anaconda/packages/r-language-pkg-docs/）；另外一种是直接进入conda下面的R交互界面，安装普通安装R包的方式进行安装，比如bioconductor或者install.packages方式。

参考：https://blog.csdn.net/weixin_44510615/article/details/92128641