1. If dN/dS = 1, amino-acid substitutions may be largely neutral. However, there is also the
possibility that positive selection just cancels purifying selection, so that some amino-
acid substitutions were driven by natural selection. This situation is thus ambiguous. 2. If dN/dS < 1, purifying selection (selection against deleterious non-synonymous
substitutions) has definitely operated. Some amino-acid substitutions have been may
caused by selection, just not enough to overcome the effects of purifying selection. 3. If dN/dS > 1, selection has caused some amino-acid substitutions. Some substitutions
also have been caused by genetic drift. Purifying selection also likely operates, may
but is not strong enough to overcome the effects of positive selection.

ka/ks的更多相关文章

  1. Ka/ Ks|同义替换的三种路径|kaks_Calculator|

    生命组学 研究old gene 和 young gene CAI选择信号:CGmutation信号 Neutrality plot:CG3与GC1.GC2的关系:平:mutation:正相关:sele ...

  2. Unity3D-RayMarch-几何图元-3添加阴影

    效果图: 在RayMarch渲染算法中计算阴影非常简单,当射线碰撞到物体,从碰撞点逆着光源方向再次执行射线步进算法,如果这一过程中碰撞到了其他物体,则碰撞点被其他物体遮挡,该处具有阴影. shader ...

  3. GenTree:基因进化和功能分析

    欢迎来到"bio生物信息"的世界 GenTree是一个集合多种数据的在线数据库. 总共涉及的基因有63152个,蛋白质编码基因有20300个. 评估基因年龄用的是UCSC数据库的1 ...

  4. GWAS中的名称概念

    基因: 是指决定生物某一遗传性状的染色体DNA片段 基因型: `基因型`又称`遗传型`,是某一生物个体全部基因组合的总称.它反应生物体的遗传构成,即从双亲获得的全部基因的总和.遗传学中具体使用的基因型 ...

  5. The sequence and de novo assembly of the giant panda genome.ppt

    sequencing:使用二代测序原因:高通量,短序列 不用长序列原因: 1.算法错误率高 2.长序列测序将嵌合体基因错误积累.嵌合体基因:通过重组由来源与功能不同的基因序列剪接而形成的杂合基因 se ...

  6. 【豆科基因组】利马豆/洋扁豆Lima bean(Phaseolus lunatus L.)基因组2021NC

    目录 一.来源 二.结果 扁豆的染色体水平高质量组装 扁豆相关农艺性状的QTL定位 直系/旁系同源的演化和物种形成事件 与农艺性状相关基因的直系同源物 群体结构分析揭示扁豆遗传簇 豆荚发育过程中的基因 ...

  7. 【豆科基因组】绿豆Mungbean, Vigna radiata苏绿基因组预印

    目录 一.来源 二.结果 测序组装 组装评价 编码基因预测 基因功能注释 非编码RNA注释 假基因预测 重复序列注释 进化分析和分歧时间估计 全基因组复制 LTR插入时间估计 正选择基因 一.来源 H ...

  8. 【豆科基因组】小豆(红豆)adzuki bean, Vigna angularis基因组2015

    目录 一.来源 研究一:Draft genome sequence of adzuki bean, Vigna angularis 研究二:Genome sequencing of adzuki be ...

  9. 柯尔莫可洛夫-斯米洛夫检验(Kolmogorov–Smirnov test,K-S test)

    柯尔莫哥洛夫-斯米尔诺夫检验(Колмогоров-Смирнов检验)基于累计分布函数,用以检验两个经验分布是否不同或一个经验分布与另一个理想分布是否不同. 在进行cumulative probab ...

随机推荐

  1. WaitGroup is reused before previous Wait has returned

    当你Add()之前,就Wait()了,就会发生这个错误.

  2. C#Excel文件加密实现,支持xlsx、docx、pptx(C#\Net\Asp.Net)

    从此刻开始,我已封闭!概不接客! 像风一样的男人,像风一样的性格,无拘无束,不拘一格.那么问题来了,当风遇到沙,不一定你是风儿,我是沙儿的缠缠绵绵,.也许是漫天黄沙,飞粒走石.如果我们期望擒住这漫天的 ...

  3. 移动Web利器transformjs入门

    简介 在过去的两年,越来越多的同事.朋友和其他不认识的童鞋进行移动web开发的时候,都使用了transformjs,所有必要介绍一下,让更多的人受益,提高编程效率,并享受编程乐趣.(当然transfo ...

  4. iOS 如何使用Safari浏览器打开app

    1.首先在info.plist添加一个键值对,如下图 或 2.在appdelegate.m文件如下方法写代码 -(BOOL)application:(UIApplication*)app openUR ...

  5. C++实现DNS域名解析

    一.概述 现在来搞定DNS域名解析,其实这是前面一篇文章C++实现Ping里面的遗留问题,要干的活是ping的过程中画红线的部分: cmd下域名解析的命令是nslookup,比如“nslookup w ...

  6. Hibernate 系列 04 - Hibernate 配置相关的类

    引导目录: Hibernate 系列教程 目录 前言: 通过上一篇的增删改查小练习之后,咱们大概已经掌握了Hibernate的基本用法. 我们发现,在调用Hibernate API的过程中,虽然Hib ...

  7. Centos7安装完毕后无法联网的解决方法

    /etc/sysconfig/network-scripts/ 用ls命令查看网卡配置文件名(在CENTOS7中网卡名貌似变成了随机数字,所以每台机器的网卡名并不相同)

  8. 总结Cnblogs支持的常用Markdown语法

    一.什么是Markdown Markdown是一种可以使用普通文本编辑器编写的标记语言, Markdown的语法简洁明了.学习容易,而且功能比纯文本更强,因此有很多人用它写博客.世界上最流行的博客平台 ...

  9. 搭建SpringMVC+Spring+Hibernate平台

    一. 开发环境 1. 点击此查看并下载需要的 Eclipse IDE for Java EE Developers 开发工具,推荐选用32位   2. 点击此查看并下载需要的 MySQL Server ...

  10. 用C++开发Binder服务

    用C++来实现Binder服务比较麻烦,原因是没有AIDL的辅助,必须手工来写中间的代码. 首先写一个服务类ExampleServer的代码: class ExampleServer : public ...