使用Cytoscape画PPI网络图
打开Cytoscape软件,根据菜单导入string_interactions.tsv文件
File ----> Import ----> Network from File
会弹出下图对话框,在对话框中设置如下:
选中string_interactions.tsv文件,点击打开,导入文件,结果如下图所示。
点击OK,弹出如下视图,ctrl+A选中所有基因节点
使用NetworkAnalyzer分析调整网络图
Tools ---> NetworkAnalyzer ---> Network Analysis ---> Analyze Network
弹出如下跳选框
选择Treat the network as undirected,点击ok
最终生成下图网络
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