INSTALLMENT of QValue
##########################################
## INSTALLMENT
##########################################
## try http:// if https:// URLs are not supported
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("qvalue")
package ‘qvalue’ successfully unpacked and MD5 sums checked
The downloaded binary packages are in
C:\Users\Administrator\AppData\Local\Temp\RtmpSWjrKo\downloaded_packages
Old packages: 'boot', 'class', 'cluster', 'codetools', 'colorspace',
'digest', 'foreign', 'Formula', 'ggplot2', 'gplots', 'gtools', 'Hmisc',
'KernSmooth', 'lattice', 'MASS', 'Matrix', 'matrixStats', 'mgcv', 'nlme',
'nnet', 'R.methodsS3', 'RColorBrewer', 'Rcpp', 'reshape2', 'rpart',
'RSQLite', 'spatial', 'survival', 'WGCNA'
Update all/some/none? [a/s/n]: n
##########################################
## TEST
##########################################
library(qvalue)
data(hedenfalk)
pvalues <- hedenfalk
qobj <- qvalue(p = pvalues)
INSTALLMENT of QValue的更多相关文章
- 假设检验:p-value,FDR,q-value
来源:http://blog.sina.com.cn/s/blog_6b1c9ed50101l02a.html,http://wenku.baidu.com/link?url=3mRTbARl0uPH ...
- qvalue: Check that you have valid p-values or use a different range of lambda
ERROR: The estimated pi0 <= 0. Check that you have valid p-values or use a different range of lam ...
- SAGE|DNA微阵列|RNA-seq|lncRNA|scripture|tophat|cufflinks|NONCODE|MA|LOWESS|qualitile归一化|permutation test|SAM|FDR|The Bonferroni|Tukey's|BH|FWER|Holm's step-down|q-value|
生物信息学-基因表达分析 为了丰富中心法则,研究人员使用不断更新的技术研究lncRNA的方方面面,其中技术主要是生物学上的微阵列芯片技术和表达数据分析方法,方方面面是指lncRNA的位置特征. Bac ...
- [01] Preparation - Sitecore Installment
Sitecore CMS 是一套内容管理系统商业软件,其底层平台依托于微软.net技术.由于最近的一个项目采用了这个平台,所以有机会接触到了这个产品. 虽然接触该产品已有一段时间,但总感觉对这个产品缺 ...
- (转) Deep Learning Research Review Week 2: Reinforcement Learning
Deep Learning Research Review Week 2: Reinforcement Learning 转载自: https://adeshpande3.github.io/ad ...
- HTTP超文本传输协议-HTTP/1.1中文版
摘要 超文本传输协议(HTTP)是一种为分布式,合作式,多媒体信息系统服务,面向应用层的协议.它是一种通用的,不分状态(stateless)的协议,除了诸如名称服务和分布对象管理系统之类的超文本用途外 ...
- [转]Part 3: Understanding !PTE - Non-PAE and X64
http://blogs.msdn.com/b/ntdebugging/archive/2010/06/22/part-3-understanding-pte-non-pae-and-x64.aspx ...
- SIP 解析
1 general-header类: 为描述消息基本属性的通用头域,可用于请求消息或响应消息:通用头域的域名只有在协议版本改变时才可有效地扩展.不过,通信中的所有方均认为是“通用头域”的新的头域也可认 ...
- 使用Graph工具观察FFT波形
2014年8月1日,经过很长时间的上网查阅资料,走了很多弯路,终于可以成功使用Graph工具仿真波形了,虽然这个的确很简单,但是经过自己摸索出来的,兴奋之情难于言表. 明天就是七夕了,刚和女朋友分手的 ...
随机推荐
- coolpro2 剪切并淡出
1.先将音乐暂停或者停止. 2.选择需要淡出的一段音乐 3.选择效果--波形振幅--渐变 4.选择Fade-out,确定
- 奥迪--Q5
-型号:Q5 -价格:40-53W -动力:2T -变速箱:8挡手自一体 -长宽高:4.63,1.90,1.66 -油箱:75L -发动机:EA888 -大灯:氙气
- awk 合并文件
问题描述:两个文件a.dat, b.dat a.dat 0 100 1 99 2 93 3 90 ... b.dat 0 0 1 3 2 0 3 2 ... ...
- Nhiberate (三)测试
(一)添加数据: public void AddUser(User user) { ISession session = NhibernateFactory.GetInstance().GetSess ...
- [PointCloud] GICP
泛化的ICP算法,通过协方差矩阵起到类似于权重的作用,消除某些不好的对应点在求解过程中的作用.不过可以囊括Point to Point,Point to Plane的ICP算法,真正的是泛化的ICP. ...
- raspberry pi
1. Expend System (sudo raspi-config) 2. Change keybaord layout to 104 key (US) 3. Change update sour ...
- php日期,时间相关知识整理
unix 时间戳:从1970年1月1日0点开始到当前时间所经过的秒数. 1.将日期转换为UNIX时间戳 mktime():可以自动校正越界的输入 原型 : mktime(hour,minute,sec ...
- navicat------------利用navicat查看两个数据库之间的差异
- Centos7中源码安装Nodejs
Step 1.确认服务器有nodejs编译及依赖相关软件,如果没有可通过运行以下命令安装. [root@BobServerStation local]# yum -y install gcc gcc- ...
- windows7 professional.iso
目前使用的笔记本是PC,在重新安装系统的时候,我比较挑剔. 我希望它是原样的,我希望它能够 windows update,拥有 office 2007/2003,它的个人文件夹就原封不动地在默认在 C ...