ceRNA 调控机制
ceRNA 不同于mRNA, lncRNA, ncRNA 等概念,其指的既不是某一种类型的RNA(比如mRNA, lncRNA), 也不是某一类的RNA(如ncRNA);
ceRNA 其实指的是不同种类的RNA之间的调控机制,英文名为 competing endogenous RNA , 翻译成中文叫做 " 竞争性内源RNA ";
在这个概念中有两个关键词,竞争和内源, 内源指的是这个调控机制本来在生物体内就存在,而竞争就是这个调控机制的核心;
对于miRNA, 研究的都很成熟,其通过和mRNA的3'UTR 进行结合,抑制mRNA的翻译或者导致mRNA降解,实现转录后的调控基因表达的功能;
在miRNA和 mRNA 结合的机制中,有一个概念叫做 MREs (microRNA response elements), 中文名叫做 miRNA 应答元件,正是由于mRNA上存在相关的MREs, 所以才能够和miRNA进行结合;
对于lncRNA, circRNA 等其他类型的RNA, 也存在MREs ,对于某些 假基因来说,其转录本由于和祖先基因的高同源性,也存在MREs, 这就导致在生物体内,对于同一个miRNA来说,mRNA, lncRNA, circRNA, pseudogene-mRNA 都会来结合这个miRNA, mRNA, lncRNA, circRNA 这三者之间就存在了一个竞争关系, 通过竞争性的结合miRNA, 形成了一个复杂的调控网络,从而调控基因的表达;
那么ceRNA机制如何来调控基因的表达量呢?如下图所示,RNA X 和 RNA Y 都有相同的MREs, 竞争性的结合同种类型的miRNA

假设细胞内该miRNA 一共只有4个,在正常的表达情况下,RNA X 结合1个miRNA, RNA Y 结合2个miRNA,
当RNA Y表达量降低时,RNA X 结合3个miRNA, RNA Y 结合1个miRNA;
当RNA Y表达量提高时,RNA X 结合1个miRNA, RNA Y 结合3个miRNA;
由于miRNA对表达量起一个负调控作用,当RNA Y 表达量降低时,RNA X与更多的miRNA结合,导致RNA X的表达量也相应降低,当RNA Y 表达量提高时, 与RNA X 结合的miRNA 变少,RNA X的表达量也相应提高;
参考文献: A ceRNA hypothesis: the Rosetta stone of a hidden RNA language ?
ceRNA 调控机制的更多相关文章
- JIPB | 两篇连发:华中农大黄俊斌团队报道二羟基异丁酰化调控稻曲病菌致病新机制
水稻是我国重要的粮食作物,稻曲病是水稻三大病害之一,不仅造成稻米产量损失,更重要的是稻曲球中的稻曲菌素的毒性和致畸作用,给人畜健康带来严重威胁.病原菌对植物的侵袭是由病原菌的毒力和植物免疫系统相互作用 ...
- Mol Cell丨吕志民团队揭示琥珀酰化介导的肿瘤细胞氧化应激调控新机制
蛋白质琥珀酰化修饰 (succinylation) ,作为赖氨酸酰化修饰家族的重要一员,于2011年由芝加哥大学赵英明教授团队在Nature Chemical Biology 发文被首次报道,并被评为 ...
- Nature | 多层次蛋白质组学综合分析冠状病毒侵染宿主细胞的分子机制
冠状病毒是一种自然界普遍存在的单股正链RNA病毒,电镜下呈日冕状或皇冠状,故命名为冠状病毒.在本世纪初短短20年中,共爆发了三次冠状病毒疫情,即2003年SARS-CoV.2012年MERS-CoV和 ...
- Nature Cancer | 宋尔卫/苏士成团队揭示lncRNA调控巨噬细胞“双刃剑”作用新机制
巨噬细胞 (macrophage, Mϕ) 是先天免疫系统中重要的免疫细胞,也是血液.淋巴和所有哺乳动物组织类型中最常见的吞噬细胞,具有极强的功能多样性.其中,肿瘤微环境组织中存在的巨噬细胞也被称作肿 ...
- lncRNA研究
------------------------------- Long noncoding RNAs are rarely translated in two human cell lines. ( ...
- 长链非编码RNA(lncRNA)
长链非编码RNA(lncRNA) 转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_909da11301010bkz.html 长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长 ...
- [转帖][超级少儿不宜]一氧化氮(NO),为什么亚洲人是最硬
阴茎科学:一氧化氮(NO),为什么亚洲人是最硬 尼堪巴图鲁 关注他 2,911 人赞同了该文章 https://zhuanlan.zhihu.com/p/55941740 超级少儿不宜.. ...
- miRTarBase 数据库简介
miRTarBase 是一个手 收集的,经过实验验证过miRNA靶基因的数据库,对于每条miRNA靶基因的记录, 都会赋予1个唯一的 miRNA-target interactions (简称MTs) ...
- DNA motif 搜索算法总结
DNA motif 搜索算法总结 2011-09-15 ~ ADMIN 翻译自:A survey of DNA motif finding algorithms, Modan K Das et. al ...
随机推荐
- 安装composer slim(php web api micro services)
1. 安装php7 2. 下载 https://getcomposer.org/composer.phar 3. 开启ssh, 在 php.ini中.extension=C:\Program File ...
- MYSQLDUMP参数详解(转)
mysqldump客户端可用来转储数据库或搜集数据库进行备份或将数据转移到另一个SQL服务器(不一定是一个MySQL服务器).转储包含创建表和/或装载表的SQL语句. 如果你在服务器上进行备份,并且表 ...
- hadoop环境搭建-完全分布式
用于测试,我用4台虚拟机搭建成了hadoop结构 我用了两个台式机.一个xp系统,一个win7系统.每台电脑装两个虚拟机,要不然内存就满了. 1.安装虚拟机环境 Vmware,收费产品,占内存较大. ...
- android发送短信样例
Android应用开发中我们经常须要发送手机短信.这对于android平台来说,是最简单只是的功能了,无需太多代码,也无需自己定义代码,仅仅须要调用android提供的消息管理类SmsManager就 ...
- 用VIM打造C语言编写器
1.先用vim --version命令查看一下都是安装了那些vim特性,以及版本等等情况. vim --version VIM - Vi IMproved 7.4 (2013 Aug 10, comp ...
- Notes on PEP333 (Python Web Server Gateway Interface)
This note is about PEP3333- Python Web Server Gateway Interface. Refer to (Source: http://legacy.pyt ...
- 【Android】3.14 公交线路查询功能
分类:C#.Android.VS2015.百度地图应用: 创建日期:2016-02-04 一.简介 利用BusLineSearch方法可查询公交线路的详情信息. 二.运行截图 简介:介绍查询公交线路功 ...
- 如何在 Ubuntu 和 CentOS 上启用 Nginx 的 HTTP/2 协议支持
HTTP/2 是 HTTP 网络协议的主要修订版本,其专注于 HTTP 协议的性能改进.HTTP/2 协议的目标是减少延迟,并且允许在 Web 浏览器和服务器之间的一个连接上并行发起多个请求,因此 W ...
- C++ 智能指针 shared_ptr
今天晚上去旁听了C++高级编程的课,其中提到智能指针.第一反映还以为是auto_ptr呢,一听才知道是share_ptr这个.哦,原来是C++11特性.大致的原因是auto_ptr有一点缺陷,而sha ...
- SQL中AND与OR的优先级
突然发现,把基础给忘了,AND的优先级大于OR,试验如下: Oracle --Y ; --Y ) ; --No value ); 附,Oracle文档: http://docs.oracle.com/ ...