转自 https://www.plob.org/article/4603.html

具体请去上面的网页查看。

my $DNA="ATGCCCGGT";
my $pep=&TranslateDNASeq($DNA);

sub TranslateDNASeq{
    use Bio::Seq;
    (my $dna)=@_;
    my $seqobj=Bio::Seq->new(-seq =>$dna, -alphabet =>'dna');
    return $seqobj->translate()->seq();
}

利用BioPerl将DNA序列翻译成蛋白序列的更多相关文章

  1. 把一个序列转换成严格递增序列的最小花费 CF E - Sonya and Problem Wihtout a Legend

    //把一个序列转换成严格递增序列的最小花费 CF E - Sonya and Problem Wihtout a Legend //dp[i][j]:把第i个数转成第j小的数,最小花费 //此题与po ...

  2. mRNA翻译成蛋白

    dna = "ATGCACGTGCGCTCACTGCGAGCTGCGGCGCCGCACAGCTTCGTGGCGCTCTGGGCACCCCTGTTCCTGCTGCGCTCCGCCCTGGCCG ...

  3. 【Python小试】将核酸序列翻译成氨基酸序列

    三联密码表 gencode = { 'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M', 'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT' ...

  4. 利用Google翻译成多国语言的见解

    1.首先注意,英语句子中的 第一个单词的首字母要大写, 2.句子结尾了,要用句号. 3.英语中单词和前面的标点符号要留一个空格,如:  you.Are   应该是 you. Are you..... ...

  5. 机器指令翻译成 JavaScript —— No.5 指令变化

    上一篇,我们通过内置解释器的方案,解决任意跳转的问题.同时,也提到另一个问题:如果指令发生变化,又该如何应对. 指令自改 如果指令加载到 RAM 中,那就和普通数据一样,也是可以随意修改的.然而,对应 ...

  6. 机器指令翻译成 JavaScript —— No.6 深度优化

    第一篇 中我们曾提到,JavaScript 最终还得经过浏览器来解析.因此可以把一些优化工作,交给脚本引擎来完成. 现代浏览器的优化能力确实很强,但是,运行时的优化终归是有限的.如果能在事先实现,则可 ...

  7. 利用Bioperl的SeqIO模块解析fastq文件

    测序数据中经常会接触到fastq格式的文件,比如说拿到fastq格式的原始数据后希望查看测序碱基的质量并去除低质量碱基.一般而言大家都是用现有的工具,比如说fastqc这个Java写的小程序,确实很好 ...

  8. 每日一题 - 剑指 Offer 46. 把数字翻译成字符串

    题目信息 时间: 2019-07-02 题目链接:Leetcode tag: 动态规划 难易程度:中等 题目描述: 给定一个数字,我们按照如下规则把它翻译为字符串:0 翻译成 "a" ...

  9. 力扣 - 剑指 Offer 46. 把数字翻译成字符串

    题目 剑指 Offer 46. 把数字翻译成字符串 思路1(递归,自顶向下) 这题和青蛙跳台阶很类似,青蛙跳台阶说的是青蛙每次可以跳一层或者两层,跳到第 n 层有多少种解法,而这题说的是讲数字翻译成字 ...

随机推荐

  1. java Socket Tcp 浏览器和服务器(一)

    自定义服务端,使用已有的客户端IE,了解一下客户端给服务端发了什么请求? 发送的请求是: GET / HTTP/1.1  请求行  请求方式  /myweb/1.html  请求的资源路径   htt ...

  2. java Socket Udp聊天

    import java.io.BufferedReader;import java.io.IOException;import java.io.InputStreamReader;import jav ...

  3. apachebench的简单使用

    apachebench的简单使用 2013-03-08 15:48:47 分类: LINUX ApacheBench是 Apache 附带的一个小工具,专门用于 HTTP Server 的benchm ...

  4. Spring框架文档与API(4.3.6版本)

    http://docs.spring.io/spring/docs/current/spring-framework-reference/htmlsingle/ Table of Contents I ...

  5. Hadoop分布式文件系统:架构和设计

    原文地址:http://hadoop.apache.org/docs/r1.0.4/cn/hdfs_design.html 引言 前提和设计目标 硬件错误 流式数据访问 大规模数据集 简单的一致性模型 ...

  6. oc 异常处理

    #import <UIKit/UIKit.h> #import "AppDelegate.h" int main(int argc, char * argv[]) { ...

  7. 浅谈原始套接字 SOCK_RAW 的内幕及其应用(port scan, packet sniffer, syn flood, icmp flood)

    一.SOCK_RAW 内幕 首先在讲SOCK_RAW 之前,先来看创建socket 的函数: int socket(int domain, int type, int protocol); domai ...

  8. Linux内核同步 - memory barrier

    一.前言 我记得以前上学的时候大家经常说的一个词汇叫做所见即所得,有些编程工具是所见即所得的,给程序员带来极大的方便.对于一个c程序员,我们的编写的代码能所见即所得吗?我们看到的c程序的逻辑是否就是最 ...

  9. C语言sprintf与sscanf函数

    1.前言 我们经常涉及到数字与字符串之间的转换,例如将32位无符号整数的ip地址转换为点分十进制的ip地址字符串,或者反过来.从给定的字符串中提取相关内容,例如给定一个地址:http://www.bo ...

  10. winform dataGridView DataGridViewComboBoxColumn 下拉框事件

    有一个dataGridView ,有一列是DataGridViewComboBoxColumn .用动态绑定,在绑定数据的时候.我们也给这一列绑定数据 在dataGridView的RowsAdded事 ...