转自 https://www.plob.org/article/4603.html

具体请去上面的网页查看。

my $DNA="ATGCCCGGT";
my $pep=&TranslateDNASeq($DNA);

sub TranslateDNASeq{
    use Bio::Seq;
    (my $dna)=@_;
    my $seqobj=Bio::Seq->new(-seq =>$dna, -alphabet =>'dna');
    return $seqobj->translate()->seq();
}

利用BioPerl将DNA序列翻译成蛋白序列的更多相关文章

  1. 把一个序列转换成严格递增序列的最小花费 CF E - Sonya and Problem Wihtout a Legend

    //把一个序列转换成严格递增序列的最小花费 CF E - Sonya and Problem Wihtout a Legend //dp[i][j]:把第i个数转成第j小的数,最小花费 //此题与po ...

  2. mRNA翻译成蛋白

    dna = "ATGCACGTGCGCTCACTGCGAGCTGCGGCGCCGCACAGCTTCGTGGCGCTCTGGGCACCCCTGTTCCTGCTGCGCTCCGCCCTGGCCG ...

  3. 【Python小试】将核酸序列翻译成氨基酸序列

    三联密码表 gencode = { 'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M', 'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT' ...

  4. 利用Google翻译成多国语言的见解

    1.首先注意,英语句子中的 第一个单词的首字母要大写, 2.句子结尾了,要用句号. 3.英语中单词和前面的标点符号要留一个空格,如:  you.Are   应该是 you. Are you..... ...

  5. 机器指令翻译成 JavaScript —— No.5 指令变化

    上一篇,我们通过内置解释器的方案,解决任意跳转的问题.同时,也提到另一个问题:如果指令发生变化,又该如何应对. 指令自改 如果指令加载到 RAM 中,那就和普通数据一样,也是可以随意修改的.然而,对应 ...

  6. 机器指令翻译成 JavaScript —— No.6 深度优化

    第一篇 中我们曾提到,JavaScript 最终还得经过浏览器来解析.因此可以把一些优化工作,交给脚本引擎来完成. 现代浏览器的优化能力确实很强,但是,运行时的优化终归是有限的.如果能在事先实现,则可 ...

  7. 利用Bioperl的SeqIO模块解析fastq文件

    测序数据中经常会接触到fastq格式的文件,比如说拿到fastq格式的原始数据后希望查看测序碱基的质量并去除低质量碱基.一般而言大家都是用现有的工具,比如说fastqc这个Java写的小程序,确实很好 ...

  8. 每日一题 - 剑指 Offer 46. 把数字翻译成字符串

    题目信息 时间: 2019-07-02 题目链接:Leetcode tag: 动态规划 难易程度:中等 题目描述: 给定一个数字,我们按照如下规则把它翻译为字符串:0 翻译成 "a" ...

  9. 力扣 - 剑指 Offer 46. 把数字翻译成字符串

    题目 剑指 Offer 46. 把数字翻译成字符串 思路1(递归,自顶向下) 这题和青蛙跳台阶很类似,青蛙跳台阶说的是青蛙每次可以跳一层或者两层,跳到第 n 层有多少种解法,而这题说的是讲数字翻译成字 ...

随机推荐

  1. 19、Java访问修饰符

    修饰符 本类 同一个包中的类 子类 其它类 public 可以访问 可以访问 可以访问 可以访问 protected 可以访问 可以访问 可以访问 不能访问 默认 可以访问 可以访问 不能访问 不能访 ...

  2. windows安装tensorflow GPU

    一.安装Anaconda Anaconda是Python发行包,包含了很多Python科学计算库.它是比直接安装Python更好的选择. 二.安装Tensorflow 如果安装了tensorflow, ...

  3. HighCharts: 设置时间图x轴的宽度

    这个x轴宽度的设置整了好久,被老板催的要死 highcharts的api文档很难找,找了半天也没找到,网上资料少,说的试了下,也没有,我用的图里api文档里没有介绍,这个属性不知道的话,根本不好找.为 ...

  4. Windows最常用的网络命令精萃

    最常用的网络命令精萃   ★ping  它是用来检查网络是否通畅或者网络连接速度的命令.作为一个生活在网络上的管理员或者黑客来说,ping命令是第一个必须掌握的DOS命令,它所利用的原理是这样的:网络 ...

  5. [Python]网络爬虫(七):Python中的正则表达式教程(转)

    接下来准备用糗百做一个爬虫的小例子. 但是在这之前,先详细的整理一下Python中的正则表达式的相关内容. 正则表达式在Python爬虫中的作用就像是老师点名时用的花名册一样,是必不可少的神兵利器. ...

  6. 如何生成KeyStore

    介绍如何生成keystore cmd下: 进入到jdk的bin目录,这样的话,android.keystore文件就会生成在这个目录下,签名的时候我们需要这个文件. C:\Program Files\ ...

  7. 使用Xfire发布WebService接口遇到的问题:

    问题一: log4j:WARN No appenders could be found for logger (org.codehaus.xfire.transport.DefaultTranspor ...

  8. 在linux下导入.sql文件,数据库中文乱码

    现象描述 我是在aix下面导入如下SQL语句时,数据库中显示乱码. insert into CONFERENCE(CONFERENCEID,SUBCONFERENCEID,ACCESSNUMBER,A ...

  9. win常用

    //base.Invoke((MethodInvoker)delegate() //{ // this.Close(); //});

  10. python 开发在线音乐播放器-简易版

    在线音乐播放器,使用python的Tkinter库做了一个界面,感觉这个库使用起来还是挺方便的,音乐的数据来自网易云音乐的一个接口,通过urllib.urlopen模块打开网址,使用Json模块进行数 ...