这道题挺简单的,刚开始理解错误,以为是从已有的字符串里面求最短的距离,后面才发现是求一个到所有字符串最小距离的字符串,因为这样的字符串可能有多个,所以最后取最小字典序的字符串。

我的思路就是求每一列每个基因A、C、G、T的数量,找到最大值,最大值可能不止一个,但是锁定字典序最小的那个为所求字符串当前列的值,求解实例如下所示

TATGATAC
TAAGCTAC
AAAGATCC
TGAGATAC
TAAGATGT

对于上述字符串,第一列A,C,G,T的值分别为1,0,0,4,可见最大值为4,说明当前列到每个字符串之和最短的是T字母,所以得到所求字符串第一个字母为T,同样的方法求得剩下所有字符,最后得到所求字符串为TAAGATAC,而 consensus error的值等于每一列的值相加,第一列,最大值为4,那么consensus error在第一列的值为m-4=5-4=1;所以consensus error的值为1+1+1+0+1+0+2+1=7,具体实现代码如下:

#include<algorithm>
#include<cstring>
#include<cstdio>
#include<iostream>
#define len 1010
#define M 55
using namespace std; char dna[M][len];
int gene[];
int m, n; int main()
{
int T;
int minSum;
char res[];
cin >> T;
while (T--) {
cin >> m >> n;
minSum = ;
for (int i = ;i < m;i++)
cin >> dna[i];
int j = ;
for (j = ;j < n;j++) {
memset(gene, , sizeof(gene));
for (int i = ;i < m;i++) {
switch (dna[i][j]) {
case 'A':gene[]++;break;
case 'C':gene[]++;break;
case 'G':gene[]++;break;
case 'T':gene[]++;break;
default:break;
}
}
int max = ;
for (int i = ;i < ;i++) {
if (gene[i] > max) {
max = gene[i];
switch (i) {
case :res[j] = 'A';break;
case :res[j] = 'C';break;
case :res[j] = 'G';break;
case :res[j] = 'T';break;
default:break;
}
}
}
minSum += m-max;
}
res[j] = '\0';
cout << res << endl;
cout << minSum << endl; }
return ;
}

uva 1368 DNA Consensus String的更多相关文章

  1. 【每日一题】UVA - 1368 DNA Consensus String 字符串+贪心+阅读题

    https://cn.vjudge.net/problem/UVA-1368 二维的hamming距离算法: For binary strings a and b the Hamming distan ...

  2. UVa 3602 - DNA Consensus String 水题 难度: 0

    题目 https://icpcarchive.ecs.baylor.edu/index.php?option=com_onlinejudge&Itemid=8&page=show_pr ...

  3. 贪心水题。UVA 11636 Hello World,LA 3602 DNA Consensus String,UVA 10970 Big Chocolate,UVA 10340 All in All,UVA 11039 Building Designing

    UVA 11636 Hello World 二的幂答案就是二进制长度减1,不是二的幂答案就是是二进制长度. #include<cstdio> int main() { ; ){ ; ) r ...

  4. uva1368 DNA Consensus String

    <tex2html_verbatim_mark> Figure 1. DNA (Deoxyribonucleic Acid) is the molecule which contains ...

  5. DNA Consensus String

    题目(中英对照): DNA (Deoxyribonucleic Acid) is the molecule which contains the genetic instructions. It co ...

  6. 紫书第三章训练1 E - DNA Consensus String

    DNA (Deoxyribonucleic Acid) is the molecule which contains the genetic instructions. It consists of ...

  7. 【习题 3-7 UVA - 1368 】DNA Consensus String

    [链接] 我是链接,点我呀:) [题意] 在这里输入题意 [题解] 枚举每一位字母是什么. 从小到大枚举. 然后计算每一位的总贡献是多少. 取最小的那个输出. [代码] #include <bi ...

  8. DNA Consensus String UVA - 1368

    题目链接:https://vjudge.net/problem/UVA-1368 题意:给出一组字符串,求出一组串,使与其他不同的点的和最小 题解:这个题就是一个点一个点求,利用桶排序,求出最多点数目 ...

  9. uvalive 3602 DNA Consensus String

    https://vjudge.net/problem/UVALive-3602 题意: 给定m个长度均为n的DNA序列,求一个DNA序列,使得它到所有的DNA序列的汉明距离最短,若有多个解则输出字典序 ...

随机推荐

  1. C语言实现快排

    #include <stdio.h> void swap(int *pa, int *pb) { int t = *pa; *pa = *pb; *pb = t; } int partio ...

  2. js 上传文件预览

    1. FILE API html5提供了FIle和FileReader两个方法,可以读取文件信息并读取文件. 2. example <html> <body> <div ...

  3. 三部曲二(基本算法、动态规划、搜索)-1006-The Same Game

    The Same Game Time Limit: 1000MS   Memory Limit: 10000K Total Submissions: 4585   Accepted: 1699 Des ...

  4. 点击含下拉菜单的列表/表单按钮:通过JS创建虚拟按钮并点击

    ${JsCode} | Get Element Attribute | XPATH=//table[@class='mnubar']//tr//td//span[text()='${MenuArr[0 ...

  5. filter_input() 函数

    定义和用法 filter_input() 函数从脚本外部获取输入,并进行过滤. 本函数用于对来自非安全来源的变量进行验证,比如用户的输入. 本函数可从各种来源获取输入: INPUT_GET INPUT ...

  6. Android FM 模块学习之四 源码解析(1)

    Normal 0 7.8 磅 0 2 false false false EN-US ZH-CN X-NONE MicrosoftInternetExplorer4 前一章我们了解了FM手动调频,接下 ...

  7. Android studio 常用插件

    常用插件 GsonFormat 该插件的功能是根据JSON数据生成相应的实体类,插件装好后按Alt+S快捷键呼不出GsonFormat的界面,如果你也遇到类似的问题,就去改一下快捷键吧!我将快捷键改成 ...

  8. hdu2191 悼念512汶川大地震 ——多重背包

    link:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=2191 最简单的那种 #include <iostream> #include <cs ...

  9. Array数组

    array_diff_key() 例子 , , 'purple' , , 'yellow' ); var_dump(array_diff_key($array1, $array2));?> 上例 ...

  10. table中td的空格

    1.css的方式去掉空格 .table{ border-collapse:collapse; border-spacing:0px; }