首先准备数据:表达矩阵

ACC.uncv2.mRNAseq_RSEM_normalized_log2.txt(以下载的TCGA的数据,log之后的)

上面数据中01为tumor,11为normal

我们进行差异分析,就是看两组的表达值,是否差异,而检验的方法就是T检验

a=AVERAGE(B2:G2)    ##求tumor组的平均表达量

b=AVERAGE(H2:O2)    ##求normal的平均表达量

c=tumor-normal          ##计算得到logFC值

d=AVERAGE(B2:O2)    ##得到所有样本的平均表达量

e=F.TEST(B2:G2,H2:O2) ##F检验,两组方差齐性检验

p=if(e>0.05,T.TEST(B2:G2,H2:O2,2,2),T.TEST(B2:G2,H2:O2,2,3) ) ###用T检验得到两个组的表达量的差异显著程度。

***注意缺失数据的处理。

然后计算FDR

FDR=p.value*count(n)/k

在这里是p.value*16/[1:16]得出Q值

用excel做差异表达的更多相关文章

  1. java结合testng,利用excel做数据源的数据驱动实例

    数据驱动部分,是自动化测试常用部分,也是参数化设计的重要环节,前面分享了,mysql.yaml做数据源,那么再来分享下excel做数据驱动 思路: 先用POI读取excel.解析读取数据,返回list ...

  2. 用EXCEL做快速傅立葉轉換_FFT in Excel

    转载来自:http://yufan-fansbook.blogspot.tw/2013/09/excel-fft-fast-fourier-transform02.html [Excel]-用EXCE ...

  3. numpy.loadtxt() 出现codecError_____ Excel 做矩阵乘法

    1) 用 numpy读入csv文件是报错 UnicodeDecodeError: 'gbk' codec can't decode byte 0xbf in position 2: illegal m ...

  4. C#中如何防止Excel做科学计算法转换

    C#中如何防止Excel做科学计算法转换  string style = @"<style>.text{mso-number-format:\@;}</style>& ...

  5. 关于Excel做表小知识记录

    关于Excel做表小知识记录 最近使用Excel做了一系列的报表,觉得这是个很神奇的东西哈哈哈,以前我可是一想到Excel就开始头疼的人...  能用代码或者SQL语句解决的问题绝不会愿意留在Exce ...

  6. 平时没有怎么用Excel做 加减乘除 计算,猛地发现,其实Excel 是一个很好的简单计算器

    平时没有怎么用Excel做 加减乘除 计算,猛地发现,其实Excel 是一个很好的简单计算器

  7. 2021年都要过去啦,你还在用Excel做数据可视化效果吗?

    2021年都要过去啦,你还在用Excel做数据可视化效果吗?古语有云,"工欲善其事,必先利其器",没有专业的工具,前期准备的再好也是白搭.现在运用数据可视化工具于经营活动中的企业是 ...

  8. 别人都在用数据分析软件,你还在用excel做数据分析?

    之前听朋友吐槽过,他们是上千人的企业,但做数据分析居然还是靠手动上传数据,而且还是用的excel做的.但其实excel并不是企业做数据分析的好工具. 数据分析是指用适当的统计分析方法对收集来的大量数据 ...

  9. 还在用excel做分析?你已经out了!

    Excel 是个很有趣的工具,不管你是不是数据分析领域的打工人,都一定听过它的名字,甚至在全球拥有大量虔诚的粉丝.Excel这个名字其实源自英语中的" Excellence "一词 ...

随机推荐

  1. P1941 飞扬的小鸟

    此题很容易写出方程,由以前的知识可以迁移得,本题可以用完全背包的方法进行优化,使用滚动数组即可得到答案. //莫名奇妙60分.不知道什么细节出了错. #include <bits/stdc++. ...

  2. C#编程利器之二:结构与枚举(Structure and enumeration)【转】

    C#编程利器之二:结构与枚举(Structure and enumeration) 在上一篇文章中,介绍了类如何封装程序中的对象.而实际中,出了类可以封装对象外,结构和枚举也可以封装一些对象,本文将着 ...

  3. 64位win10系统无法安装.Net framework3.5的解决方法

    前言 Win10不会自带安装.net framework 3.5,而很多软件必须基于.net framework 3.5 sp1(例如:Sql Server 2014),从官网上下载的.net fra ...

  4. sql 在not in 子查询有null值情况下经常出现的陷阱

    如果下:TempSalesPriceFixedValues表和SalesPriceFixedValues表,要求查询出在TempSalesPriceFixedValues表中且不在SalesPrice ...

  5. ftp列表错误或长城宽带连不上ftp的解决方法

    有些是长城宽带,我 帮忙测试,在客户PC机上测试,PING 任何网站 不通:tracert 超时:FTP 超时,不出现用户名提示.但访问网站正常,检测后进入到路由器,禁用DHCP服务 ,问题解决. 或 ...

  6. NSMutableAttributedString 富文本的使用

    //富文本的使用 UILabel *testLabel = [[UILabel alloc]initWithFrame:CGRectMake(, , , )]; testLabel.backgroun ...

  7. SQL*Plus命令行工具连接Oracle数据库

    1.在命令行中输入"sqlplus /nolog"即可启动该工具. 2.连接到Oracle服务器  conn 用户名/密码@服务器连接字符串 as 连接身份 客户端工具根据&quo ...

  8. JDBC的增删改写成一个方法,调用一个工具类

    package com.hx.jdbc.connection; import java.sql.Connection; import java.sql.Statement; import com.my ...

  9. jquery获取input表单值的代码

    [导读] jquery取radio单选按钮的值$("input[name=items]:checked") val();jquery radio取值,checkbox取值,sele ...

  10. windows系统调用 semaphore信号量

    #include "iostream" #include "windows.h" #include "cstring" using name ...