bedtools的更多相关文章

  1. bedtools 每天都会用到的工具

    详细的使用说明:http://bedtools.readthedocs.org/en/latest/ Collectively, the bedtools utilities are a swiss- ...

  2. 关于bedtools merge 功能中sort 命令的解释

    Bedtools 是一个很好的用来处理区间的工具,很多时候用这个底层语言编写的小工具比自己写的脚本运行快很多,但是这个工具中的某些功能对输入文件有一定的要求,比如说里面的一个merge函数,这是里面的 ...

  3. 使用bedtools提取vcf多个位置的变异（extract multi-region of genotypes by bedtools）

    1.下载安装bedtools: 2.生成bed文件:标准的bed文件格式如下: chr7 127471196 127472363 Pos1 0 + 127471196 127472363 255,0, ...

  4. bedtools神器 | gtf转bed | bed文件运算

    我们生信技能书有一篇介绍bedtools的文章,可以在微信里搜着看下,非常有用. http://bedtools.readthedocs.io/en/latest/ gtf转bed用Linux命令完全 ...

  5. bedtools简介及应用

    1)背景处理基因组数据中,比较基因组不同区域,例如寻找overlap等,是一种基本的且常见的问题.虽然UCSC 中‘Table Browser’或者Galaxy可以用来处理,但是当这些工具面对大的数据 ...

  6. bedtools 的安装与使用

    1) 安装 bedtools 提供了3种安装方式 从google code 下载源代码进行安装 利用系统中的包管理工具进行安装, 比如cnetos 下的yum, ubuntu下的apt-get, ma ...

  7. 使用bedtools的一个问题

    问题:有两个平行测序样本,分别得到1.vcf和2.vcf两个文件,想知道这两个文件有多少个重合点. [wangjq@mgmt CHG029194]$ cat t1 chr1 10 10 chr1 11 ...

  8. bedtools 用法大全

    原文:https://cloud.tencent.com/developer/article/1078324 前言: bedtools等工具号称是可以代替普通的生物信息学数据处理工程师的!我这里用一个 ...

  9. Bedtools如何比较两个参考基因组注释版本的基因？

    目录 问题 思路 问题 原问题来自:How to calculate overlapping genes between two genome annotation versions? 其实可分为两个 ...

  10. Bedtools genomecov 计算覆盖度

    简单说明: 从2.28.0版开始,bedtools使用htslib库支持CRAM格式 除了BAM文件,bedtools默认所有的输入文件都以TAB键分割 除非使用-sorted选项,bedtools默 ...

随机推荐

  1. C#图表控件ZedGraph使用

    最近从java转到C#下开发PC端的桌面程序,之前也尝试用java GUI写桌面程序,发现java写桌面程序还是诸多不便变,虽然最后也写出来了,但是决心还是另起平台,有了一定的java基础,来学习C# ...

  2. .Net Core 应用框架。

    1.分布式系统框架  https://github.com/MassTransit/MassTransit 2.搜索引擎  https://github.com/XiLife-OSPC/Masuit. ...

  3. Android Studio 创建虚拟机失败 Failed to load 解决办法

    Name: Nexus_S_API_21 CPU/ABI: ARM (armeabi) Path: H:\Users\Pavkoo\.android\avd\Nexus_S_API_21.avd Er ...

  4. 秒懂JSON.parse()与JSON.stringify()的区别

    在网站开发中,Json是最为常见的一种数据交互手段.在使用过程中,常会遇到Json字段串和对象之间进行转换.很多朋友对于JSON.parse() 和JSON.stringify() 的区别,下面为大家 ...

  5. Activity的Theme主题风格

    在AndroidManifest.xml文件里面: <activity name="test"               android:theme="@andr ...

  6. Lua相关函数整理

    1.asset(a==b,tipmsg);错误处理 2.pcall,xpcall,debug,保护函数执行,并且查看相关信息 3.collectgarbage()函数相关: collectgarbag ...

  7. 学习html5 app项目开发

    这周因为部门接了个小的html5 app case,所以从事android开发的我就接下了这个项目.与其说是项目需要,其实更大部分是我自己想要做html5 app,因为我对这个全新的平台已经好奇很久了 ...

  8. php 编译安装指导

    php 编译安装 下载源码 安装 安装后配置 下载源码 php下载地址:http://php.net/downloads.php php-7.1.11.tar.bz2 安装 安装依赖包 yum ins ...

  9. now()与sysdate()的区别（1）

        now()与sysdate()两个函数都以'YYYY-MM-DD HH:MM:SS'的形式表示表示当前的时间.比如: root@rac1 21:13:10> select sysdate ...

  10. 对类参数的序列化和反序列化XML

    /// <summary> /// Xml序列化与反序列化 /// </summary> public class XmlUtil { #region 反序列化 /// < ...