根据一个打分系统,怎么样排对起来打分能够最大.就认为历史上应该是这样子的.

数据同源搜索软件Fasta和Blast

是目前功能最全,使用最广的同源性数据库搜索软件包。他们在Needleman的动态算法的基础上做了很多技术上的改进,如采用启发式算法。使得在精确度牺牲较小的情况下,速度快了很多。

 

FASTA.是1985年提出的一个全局联配算法.

BLAST.是1990年提出的。最初被设计用于序列局部比对.

BLAST更适合于protein序列比较,FASTA更适用于DNA序列比较.

序列联配(alignment)和数据库搜索方法简介的更多相关文章

  1. BLAST - 序列数据库搜索

    我生信入门,老师就要求我学好blast比对,说得也确实是很有道理,是个人都知道比对是最基本的东西,现在再想想那老师的建议,也只能呵呵一笑. 北大生物信息公开课有一章专门讲得序列数据库搜索,可以好好看看 ...

  2. 30多条mysql数据库优化方法,千万级数据库记录查询轻松解决(转载)

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  3. 优化数据库的方法及SQL语句优化的原则

    优化数据库的方法: 1.关键字段建立索引. 2.使用存储过程,它使SQL变得更加灵活和高效. 3.备份数据库和清除垃圾数据. 4.SQL语句语法的优化.(可以用Sybase的SQL Expert,可惜 ...

  4. 30多条mysql数据库优化方法【转】

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  5. 转载:30多条mysql数据库优化方法,千万级数据库记录查询轻松解决

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  6. 用ASP.Net(C#)连接Oracle数据库的方法及实例

    今天看了一下asp.net连接oracle数据库的方法,得到了如下代码.这段代码打开了MyTable表,并把操作员的名字列出.字段类型是OracleString.读取的时候用的是字段编号,我不知道怎么 ...

  7. 一个防止误删MSSQL数据库的方法

    一个防止误删MSSQL数据库的方法 环境:Windows2008 R2 .SQL 2012 今天发现一个有趣的现象,之前数据库服务器的其中几个数据库做过镜像,不过现在已经删除了,今天又要在那台服务器上 ...

  8. 查看mysql数据库版本方法总结

    当你接手某个mysql数据库管理时,首先你需要查看维护的mysql数据库版本:当开发人员问你mysql数据库版本时,而恰好你又遗忘了,那么此时也需要去查看mysql数据库的版本............ ...

  9. Oracle shutdown immediate无法关闭数据库解决方法

    在测试服务器上使用shutdown immediate命令关闭数据库时,长时间无法关闭数据库,如下所示 1: [oracle@DB-Server admin]$ sqlplus / as sysdba ...

随机推荐

  1. 基于红帽5裁剪一个简单的Linux

    HOST:宿主机 Target:目标机 1.基于HOST制作一个简单的可启动的Linux 1.给目标磁盘分区 两个: 在宿主机上:/dev/sdb1,/dev/sdb2 /dev/sdb1挂载到 /m ...

  2. 【BZOJ2406】矩阵 二分+有上下界的可行流

    [BZOJ2406]矩阵 Description Input 第一行两个数n.m,表示矩阵的大小. 接下来n行,每行m列,描述矩阵A. 最后一行两个数L,R. Output 第一行,输出最小的答案: ...

  3. 网页直播、微信直播技术解决方案:EasyNVR与EasyDSS流媒体服务器组合之区分不同场景下的easynvr

    近期遇到好多客户咨询关于实现微信直播.或者是将直播页面集成进入自己项目中. 该方案的主要目的:完成在公网一直进行内网摄像头的RTMP/HLS直播! 实现方案的具体实现: EasyNVR+EasyDSS ...

  4. 关于eclipse 插件的挂载

    学习java的时候,不喜欢myeclipse 这种插件,什么都准备好了,自己动手就少了,不利于自己学习,现在我就diy 自己选几个插件来用,基本上就是 eclipse 加上我自己要用的插件,插件的安装 ...

  5. MongoDB API java的使用

    1.创建一个MongoDB数据库连接对象,它默认连接到当前机器的localhost地址,端口是27017. Mongo mongo=new Mongo(); 2.获得与某个数据库(例如“test”)的 ...

  6. Python中的staticmethod和classmethod

    谈谈Python中的staticmethod和classmethod 首先值得说明的是staticmethod和classmethod都是python中定义的装饰器,用的时候需要在前面加@ 即@sta ...

  7. BZOJ4829: [Hnoi2017]队长快跑

    BZOJ4829: [Hnoi2017]队长快跑 Description 众所周知,在P国外不远处盘踞着巨龙大Y. 传说中,在远古时代,巨龙大Y将P国的镇国之宝窃走并藏在了其巢穴中,这吸引着整个P国的 ...

  8. SAP-Function_01

    TH_POPUP –在特定用户屏幕上显示一个系统消息 1 . 函数WS_UPLOAD     功能﹕将TXT文件转换成SAP中的内表定义的数据表格文件    注意﹕1 函数将按参数 data_tab  ...

  9. 让我们再谈谈 iOS 安全

    前言 安全方面的话题总是聊不完的.这不,国外一家有名的专门攻击别人的安全公司 Hacking Team 自己被 Hack 了,结果有 400 多 G 的攻击资料泄漏出来,包括一些 0-day 的漏洞. ...

  10. Builder 模式初探

    Builder 模式是一步一步创建一个复杂对象的创建型模式,它允许用户在不知道内部构建细节的情况下,可以更精细的控制对象的构造流程.该模式是为了将构建复杂对象的过程和它的部件解耦,使得构建过程和部件的 ...