根据一个打分系统,怎么样排对起来打分能够最大.就认为历史上应该是这样子的.

数据同源搜索软件Fasta和Blast

是目前功能最全,使用最广的同源性数据库搜索软件包。他们在Needleman的动态算法的基础上做了很多技术上的改进,如采用启发式算法。使得在精确度牺牲较小的情况下,速度快了很多。

 

FASTA.是1985年提出的一个全局联配算法.

BLAST.是1990年提出的。最初被设计用于序列局部比对.

BLAST更适合于protein序列比较,FASTA更适用于DNA序列比较.

序列联配(alignment)和数据库搜索方法简介的更多相关文章

  1. BLAST - 序列数据库搜索

    我生信入门,老师就要求我学好blast比对,说得也确实是很有道理,是个人都知道比对是最基本的东西,现在再想想那老师的建议,也只能呵呵一笑. 北大生物信息公开课有一章专门讲得序列数据库搜索,可以好好看看 ...

  2. 30多条mysql数据库优化方法,千万级数据库记录查询轻松解决(转载)

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  3. 优化数据库的方法及SQL语句优化的原则

    优化数据库的方法: 1.关键字段建立索引. 2.使用存储过程,它使SQL变得更加灵活和高效. 3.备份数据库和清除垃圾数据. 4.SQL语句语法的优化.(可以用Sybase的SQL Expert,可惜 ...

  4. 30多条mysql数据库优化方法【转】

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  5. 转载:30多条mysql数据库优化方法,千万级数据库记录查询轻松解决

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  6. 用ASP.Net(C#)连接Oracle数据库的方法及实例

    今天看了一下asp.net连接oracle数据库的方法,得到了如下代码.这段代码打开了MyTable表,并把操作员的名字列出.字段类型是OracleString.读取的时候用的是字段编号,我不知道怎么 ...

  7. 一个防止误删MSSQL数据库的方法

    一个防止误删MSSQL数据库的方法 环境:Windows2008 R2 .SQL 2012 今天发现一个有趣的现象,之前数据库服务器的其中几个数据库做过镜像,不过现在已经删除了,今天又要在那台服务器上 ...

  8. 查看mysql数据库版本方法总结

    当你接手某个mysql数据库管理时,首先你需要查看维护的mysql数据库版本:当开发人员问你mysql数据库版本时,而恰好你又遗忘了,那么此时也需要去查看mysql数据库的版本............ ...

  9. Oracle shutdown immediate无法关闭数据库解决方法

    在测试服务器上使用shutdown immediate命令关闭数据库时,长时间无法关闭数据库,如下所示 1: [oracle@DB-Server admin]$ sqlplus / as sysdba ...

随机推荐

  1. H2 database 操作操作内存表

    本例开发工具为 NetBeans,使用b2前提安装jdk. 第一步:在官网下载驱动包 :http://www.h2database.com ,本例版本为: h2-1.4.192.jar 第二步:安装开 ...

  2. 关于 Delphi 中流的使用(7) 压缩与解压缩(TCompressionStream、TDecompressionStream)

    unit Unit1; interface uses   Windows, Messages, SysUtils, Variants, Classes, Graphics, Controls, For ...

  3. EasyDSS RTMP流媒体解决方案之Windows服务安装方案

    Windows服务安装 EasyDSS_Solution流媒体解决方案,可以通过start一键启动.在实际应用中,我们希望可以设置成系统服务,那么下面我将会介绍,如何在windows中将流媒体解决方案 ...

  4. 九度OJ 1051:数字阶梯求和 (大数运算)

    时间限制:1 秒 内存限制:32 兆 特殊判题:否 提交:6718 解决:2280 题目描述: 给定a和n,计算a+aa+aaa+a...a(n个a)的和. 输入: 测试数据有多组,输入a,n(1&l ...

  5. dm层 集市层 四层 Build a multi-level data strategy

    集市层 四层模型 ODS(临时存储层) MID(中间层) DM(数据集市层) APP(应用层) http://www.datamartist.com/data-warehouse-vs-data-ma ...

  6. 我的Java开发学习之旅------>Java使用Fork/Join框架来并行执行任务

    现代的计算机已经向多CPU方向发展,即使是普通的PC,甚至现在的智能手机.多核处理器已被广泛应用.在未来,处理器的核心数将会发展的越来越多. 虽然硬件上的多核CPU已经十分成熟,但是很多应用程序并未这 ...

  7. phpPHP创建创建jpg格式图片以及压缩图片(转)

    其实是因为一些业务上的需求,所以需要对用户上传后的图片进行压缩,因为上传的图片比较大,显示的时候加载起来如果网速不给力的话就很吃力了,而且大图片也浪费空间,于是找了一下相关的资源,主要方法在开源中国上 ...

  8. iOS 多语言支持

    如果app将来面向国际化,比如说中国需要使用,美国也需要使用,此时就需要考虑app支持多国语言 具体方式如下 首先在Supporting Files中新建 Strings 起名: Localizabl ...

  9. 3D焦点图插件

    在线演示 本地下载

  10. Dubbo之生产者

    环境步骤: 安装Zookeepr启动 创建Maven项目搭建生产者和消费者 安装DubboAdmin平台,实现监控 Dubbo注册中心采用的是Zookeeper.为什么采用Zookeeper呢? Zo ...