根据一个打分系统,怎么样排对起来打分能够最大.就认为历史上应该是这样子的.

数据同源搜索软件Fasta和Blast

是目前功能最全,使用最广的同源性数据库搜索软件包。他们在Needleman的动态算法的基础上做了很多技术上的改进,如采用启发式算法。使得在精确度牺牲较小的情况下,速度快了很多。

 

FASTA.是1985年提出的一个全局联配算法.

BLAST.是1990年提出的。最初被设计用于序列局部比对.

BLAST更适合于protein序列比较,FASTA更适用于DNA序列比较.

序列联配(alignment)和数据库搜索方法简介的更多相关文章

  1. BLAST - 序列数据库搜索

    我生信入门,老师就要求我学好blast比对,说得也确实是很有道理,是个人都知道比对是最基本的东西,现在再想想那老师的建议,也只能呵呵一笑. 北大生物信息公开课有一章专门讲得序列数据库搜索,可以好好看看 ...

  2. 30多条mysql数据库优化方法,千万级数据库记录查询轻松解决(转载)

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  3. 优化数据库的方法及SQL语句优化的原则

    优化数据库的方法: 1.关键字段建立索引. 2.使用存储过程,它使SQL变得更加灵活和高效. 3.备份数据库和清除垃圾数据. 4.SQL语句语法的优化.(可以用Sybase的SQL Expert,可惜 ...

  4. 30多条mysql数据库优化方法【转】

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  5. 转载:30多条mysql数据库优化方法,千万级数据库记录查询轻松解决

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  6. 用ASP.Net(C#)连接Oracle数据库的方法及实例

    今天看了一下asp.net连接oracle数据库的方法,得到了如下代码.这段代码打开了MyTable表,并把操作员的名字列出.字段类型是OracleString.读取的时候用的是字段编号,我不知道怎么 ...

  7. 一个防止误删MSSQL数据库的方法

    一个防止误删MSSQL数据库的方法 环境:Windows2008 R2 .SQL 2012 今天发现一个有趣的现象,之前数据库服务器的其中几个数据库做过镜像,不过现在已经删除了,今天又要在那台服务器上 ...

  8. 查看mysql数据库版本方法总结

    当你接手某个mysql数据库管理时,首先你需要查看维护的mysql数据库版本:当开发人员问你mysql数据库版本时,而恰好你又遗忘了,那么此时也需要去查看mysql数据库的版本............ ...

  9. Oracle shutdown immediate无法关闭数据库解决方法

    在测试服务器上使用shutdown immediate命令关闭数据库时,长时间无法关闭数据库,如下所示 1: [oracle@DB-Server admin]$ sqlplus / as sysdba ...

随机推荐

  1. Java 集成域登陆

    参考: 1. JAVA中使用jcifs集成AD域用户认证 2. https://liaosy.iteye.com/blog/1887092 3.其他库 https://github.com/Waffl ...

  2. 成为高级Java工程师,你必须要看的技术书籍

    学习的最好途径就是看书 "学习的最好途径就是看书",这是我自己学习并且小有了一定的积累之后的第一体会.个人认为看书有两点好处: 1.能出版出来的书一定是经过反复的思考.雕琢和审核的 ...

  3. Optimistic concurrency control

    Optimistic concurrency control https://en.wikipedia.org/wiki/Optimistic_concurrency_control Optimist ...

  4. 【学习笔记】快速傅里叶变换(FFT)

    [学习笔记]快速傅里叶变换 学习之前先看懂这个 浅谈范德蒙德(Vandermonde)方阵的逆矩阵的求法以及快速傅里叶变换(FFT)中IDFT的原理--gzy hhh开个玩笑. 讲一下\(FFT\) ...

  5. VirtualBox创建VM结果ProcessorType是空的

    用WMI来查询CPU的频率,一直没问题: "Select MaxClockSpeed From Win32_Processor Where ProcessorType = 3" 结 ...

  6. 我的Java开发学习之旅------>解惑Java进行三目运算时的自动类型转换

    今天看到两个面试题,居然都做错了.通过这两个面试题,也加深对三目运算是的自动类型转换的理解. 题目1.以下代码输出结果是(). public class Test { public static vo ...

  7. install_driver(mysql) failed

        安装好了mysql监控神器innotop,正得意,innotoop不可用,其错误提示为install_driver(mysql) failed: Can't load '/usr/lib64/ ...

  8. mysql 查看或者修改数据库密码

    首先启动命令行 1.在命令行运行:taskkill /f /im mysqld-nt.exe 下面的操作是操作mysql中bin目录下的一些程序,如果没有配置环境变量的话,需要切换到mysql的bin ...

  9. 【linux】如何给sudo的root设置环境变量

    如果系统不能通过root登陆,而是需要使用其他用户sudo的方式登陆root,那么root的环境变量很难设置,修改/etc/profile也没有用.可以通过下面这个方式解决 修改sudoer的配置文件 ...

  10. Android字符设备驱动开发基于高通msm8916【原创 】

    本人才疏浅学,写一篇文档总结自己在msm8916平台上移植自己编写的简单的字符设备驱动开发的整个流程.这个小项目的主要功能是开发一个简单的APP,APP通过JNI去调用位于kernel的字符设备驱动. ...