根据一个打分系统,怎么样排对起来打分能够最大.就认为历史上应该是这样子的.

数据同源搜索软件Fasta和Blast

是目前功能最全，使用最广的同源性数据库搜索软件包。他们在Needleman的动态算法的基础上做了很多技术上的改进，如采用启发式算法。使得在精确度牺牲较小的情况下，速度快了很多。

 

FASTA.是1985年提出的一个全局联配算法.

BLAST.是1990年提出的。最初被设计用于序列局部比对.

BLAST更适合于protein序列比较，FASTA更适用于DNA序列比较.

序列联配(alignment)和数据库搜索方法简介的更多相关文章

  1. BLAST - 序列数据库搜索

    我生信入门,老师就要求我学好blast比对,说得也确实是很有道理,是个人都知道比对是最基本的东西,现在再想想那老师的建议,也只能呵呵一笑. 北大生物信息公开课有一章专门讲得序列数据库搜索,可以好好看看 ...

  2. 30多条mysql数据库优化方法,千万级数据库记录查询轻松解决（转载）

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  3. 优化数据库的方法及SQL语句优化的原则

    优化数据库的方法: 1.关键字段建立索引. 2.使用存储过程,它使SQL变得更加灵活和高效. 3.备份数据库和清除垃圾数据. 4.SQL语句语法的优化.(可以用Sybase的SQL Expert,可惜 ...

  4. 30多条mysql数据库优化方法【转】

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  5. 转载：30多条mysql数据库优化方法,千万级数据库记录查询轻松解决

    1.对查询进行优化,应尽量避免全表扫描,首先应考虑在 where 及 order by 涉及的列上建立索引. 2.应尽量避免在 where 子句中对字段进行 null 值判断,否则将导致引擎放弃使用索 ...

  6. 用ASP.Net(C#)连接Oracle数据库的方法及实例

    今天看了一下asp.net连接oracle数据库的方法,得到了如下代码.这段代码打开了MyTable表,并把操作员的名字列出.字段类型是OracleString.读取的时候用的是字段编号,我不知道怎么 ...

  7. 一个防止误删MSSQL数据库的方法

    一个防止误删MSSQL数据库的方法 环境:Windows2008 R2 .SQL 2012 今天发现一个有趣的现象,之前数据库服务器的其中几个数据库做过镜像,不过现在已经删除了,今天又要在那台服务器上 ...

  8. 查看mysql数据库版本方法总结

    当你接手某个mysql数据库管理时,首先你需要查看维护的mysql数据库版本:当开发人员问你mysql数据库版本时,而恰好你又遗忘了,那么此时也需要去查看mysql数据库的版本............ ...

  9. Oracle shutdown immediate无法关闭数据库解决方法

    在测试服务器上使用shutdown immediate命令关闭数据库时,长时间无法关闭数据库,如下所示 1: [oracle@DB-Server admin]$ sqlplus / as sysdba ...

随机推荐

  1. Java线程：概念及原理

    线程是执行的程序中的一个线程. Java虚拟机允许应用程序必须同时运行多个执行线程. 每个线程都有一个优先事项.具有更高优先级的线程优先于线程的优先级较低的执行.每个线程可能会或可能不会也被标记为一个 ...

  2. IOS获取当前地理位置文本

    本文转载至  http://blog.csdn.net/lvxiangan/article/details/28101119   以下内容摘抄自网络,著作权属于原作者 方法1:使用ios自带联网查询功 ...

  3. C#中的new和override（转）

    在衍生类中的方法上使用new和override关键字有何意义,可以通过一系列问题来找到答案.先看一段代码: 1 class Program 2 { 3 static void Main(string[ ...

  4. iOS应用上架报错解决

    ERROR ITMS-90087: "Unsupported Architectures. The executable for LiveStorage.app/Frameworks/Spe ...

  5. 流畅的python学习笔记：第十三章：重载运算符__add__,__iadd__,__radd__,__mul__,__rmul__,__neg__,__eq__,__invert__,__pos__

    在前面第十章以及第一章的时候介绍了Vector对象的运算符重载.第十三章专门介绍运算符重载.这里我们看几个之前没讲过的运算符__neg__,__pos__,__invert__ class Vecto ...

  6. centos7 安装php

    http://blog.csdn.net/zhaozuosui/article/details/48394409

  7. java中的clone方法

    Java中对象的创建 clone顾名思义就是复制, 在Java语言中, clone方法被对象调用,所以会复制对象.所谓的复制对象,首先要分配一个和源对象同样大小的空间,在这个空间中创建一个新的对象.那 ...

  8. maven采用tomcat7启动项目

    1.maven 集成tomcat7启动项目 <plugin> <groupId>org.apache.tomcat.maven</groupId> <arti ...

  9. okhttp 请求list数据实例

    public class DataBean { /** * id : 61684 * movieName : <猜火车2>先导预告片 * coverImg : http://img31.m ...

  10. sqrt源码

    先找出接近m的浮点数,然后通过下面的不等式中的等于条件得到其平方根. #include <iostream> #include <math.h> using namespace ...