res = read.table("ttest_expression.tsv",sep=",",header = TRUE)
rownames(res)=res[,colnames(res)[1]]

res[rownames(res),colnames(res)[2:length(colnames(res))]]

res = read.table(exp_file, header=T, quote="",row.names=1, sep='\t',check.names=F,as.is=TRUE, encoding="utf-8")

rest = t(res)

ncols(res) nrows(res)

dim(rest)     dimnames(rest)  rownames(rest)  colnames(rest)

typeof class

同种数据类型: Array 数组 Matrix 二维数组

不同种数据类型 :List 列表 data.frame 数据框  (命名元素)

v <- 1:20; w<-sapply(v,function(i){i^2})

>xxx<-matrix(1:20,ncol=4)

>apply(xxx,1,mean)

[1]  8.5  9.5 10.5 11.5 12.5

>apply(xxx,2,mean)

[1]  3  8 13 18

m <- factor(c("red","blue","green","green"))

l <- levels(m)

R 培训之 Table的更多相关文章

  1. R之data.table -melt/dcast(数据合并和拆分)

    p.p1 { margin: 0.0px 0.0px 0.0px 0.0px; font: 30.0px "Helvetica Neue"; color: #323333 } p. ...

  2. R之data.table速查手册

    R语言data.table速查手册 介绍 R中的data.table包提供了一个data.frame的高级版本,让你的程序做数据整型的运算速度大大的增加.data.table已经在金融,基因工程学等领 ...

  3. R语言data.table包fread读取数据

    R语言处理大规模数据速度不算快,通过安装其他包比如data.table可以提升读取处理速度. 案例,分别用read.csv和data.table包的fread函数读取一个1.67万行.230列的表格数 ...

  4. R(7): data.table

    这个包让你可以更快地完成数据集的数据处理工作.放弃选取行或列子集的传统方法,用这个包进行数据处理.用最少的代码,你可以做最多的事.相比使用data.frame,data.table可以帮助你减少运算时 ...

  5. 【R】write.table输出数据带有行名?

    目录 问题 解决一 解决二 问题 这个问题应该很常见吧.R中输出数据框时,想要把行名和列名都输出.如果直接输出的话,输出的结果列名会往前移动一位,这显然不是我们想要的. 直接上例子: > a = ...

  6. R语言reads.table 自动将字符串变成了逻辑值

    今天遇到了一个问题,文件中有一列的值为全为F, 用read.table 读取的时候,自动将F 变成了false 对于这样的转换,可以通过 colClass 参数控制 colClass 参数指定每一列的 ...

  7. R语言数据分析利器data.table包 —— 数据框结构处理精讲

        R语言data.table包是自带包data.frame的升级版,用于数据框格式数据的处理,最大的特点快.包括两个方面,一方面是写的快,代码简洁,只要一行命令就可以完成诸多任务,另一方面是处理 ...

  8. R语言基因组数据分析可能会用到的data.table函数整理

    R语言data.table包是自带包data.frame的升级版,用于数据框格式数据的处理,最大的特点快.包括两个方面,一方面是写的快,代码简洁,只要一行命令就可以完成诸多任务,另一方面是处理快,内部 ...

  9. 将基因组数据分类并写出文件,python,awk,R data.table速度PK

    由于基因组数据过大,想进一步用R语言处理担心系统内存不够,因此想着将文件按染色体拆分,发现python,awk,R 语言都能够非常简单快捷的实现,那么速度是否有差距呢,因此在跑几个50G的大文件之前, ...

随机推荐

  1. 用Kotlin语言重新编写Plaid APP:经验教训(I)

    原文标题:Converting Plaid to Kotlin: Lessons learned (Part 1) 原文链接:http://antonioleiva.com/plaid-kotlin- ...

  2. [Android]使用Dagger 2依赖注入 - 图表创建的性能(翻译)

    以下内容为原创,欢迎转载,转载请注明 来自天天博客:http://www.cnblogs.com/tiantianbyconan/p/5098943.html 使用Dagger 2依赖注入 - 图表创 ...

  3. webView 自适应高度 document.body 属性

    前段时间开发遇到webView 高度自适应问题,用最初的方法无效,找了些资料,记录下. 1.若网页中含有< !DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTM ...

  4. jTemplates部分语法介绍

    1.{#if} {#if |COND|}..{#elseif |COND|}..{#else}..{#/if} Examples: {#if 2*8==16} good {#else} fail {# ...

  5. yii2分页扩展之实现跳转到具体某页

    作者:白狼 出处:http://www.manks.top/yii2_linkpager_widget.html 本文版权归作者,欢迎转载,但未经作者同意必须保留此段声明,且在文章页面明显位置给出原文 ...

  6. spring加载配置文件

    spring加载配置文件 1.把applicationContext.xml直接放在WEB-INF/classes下,spring会采用默认的加载方式2.采用在web.xml中配置ContextLoa ...

  7. Thread Object wait() notify()基本

    package com.thread.test.thread; import java.util.ArrayDeque; import java.util.Queue; import java.uti ...

  8. C语言运算符优先级

    优先级 运算符 名称或含义 使用形式 结合方向 说明 1 [] 数组下标 数组名[常量表达式] 左到右 -- () 圆括号 (表达式)/函数名(形参表) -- . 成员选择(对象) 对象.成员名 -- ...

  9. MVC中在RAZOR 模板里突然了现了 CANNOT RESOLVE SYMBOL ‘VIEWBAG’ 的错误提示

    然后在Razor中出现了@ViewBag的不可用,@Url不可用,@Html 这些变量都不能用了. 异常提示: 编译器错误消息: CS0426: 类型“XX.Model.System”中不存在类型名称 ...

  10. 从一道面试题来认识java类加载时机与过程

    说明:本文的内容是看了<深入理解Java虚拟机:JVM高级特性与最佳实践>后为加印象和理解,便记录了重要的内容. 1  开门见山 以前曾经看到过一个java的面试题,当时觉得此题很简单,可 ...