TM-align是由zhang yang LAB开发的一款做蛋白结构比对的软件。

下载链接:http://zhanglab.ccmb.med.umich.edu/TM-align/TMtools20170708.tar.gz 平台:Linux

下载下来的为TMtools,压缩包里包含TM-align及TM-score的可执行文件及编译文件。

如果嫌安装麻烦,那你就可以使用可执行文件,但是作者推荐重新对两个工具进行编译,因为这样可以根据自己的PC的环境,使TM-align的速度最快。

tar zxvf TMtools20170708.tar.gz

编译安装命令:

gfortran -static -O3 -ffast-math -lm -o TMalign TMalign.f

gfortran -static -O3 -ffast-math -lm -o TMscore TMscore.f

编译过程中可能出现的问题:

1. gfortran没装,提示gfortran command not found

解决办法:

yum install gcc-gfortran.x86_64 libgfortran-static.x86_64 libgfortran4.x86_64 compat-gcc-44-gfortran.x86_64 compat-libgfortran-41.x86_64 libgfortran.x86_64

2. 编译错误:

/usr/bin/ld: cannot find -lgfortran
/usr/bin/ld: cannot find -lm
/usr/bin/ld: cannot find -lgfortran
/usr/bin/ld: cannot find -lm
/usr/bin/ld: cannot find -lquadmath
/usr/bin/ld: cannot find -lm
/usr/bin/ld: cannot find -lc
collect2: error: ld returned 1 exit status

解决办法:

yum install libgfortran.x86_64 libgfortran-static.x86_64 glibc-static.x86_64

TM-align TM-score安装的更多相关文章

  1. 理解Oracle TM和TX锁

    在Oracle中有很多锁,通过v$lock_type视图可以查看Oracle中所有类型的锁,在本篇文章中我们熟悉一下TM和TX锁的类型 SQL> select * from v$lock_typ ...

  2. time_t和struct tm之间的转换

    time_t到struct tm的转换: #include <time.h> struct tm *localtime(const time_t *timep); struct tm到ti ...

  3. 等待事件:enq: HW - contention和enq: TM - contention

    今天生成了生产库前几日的AWR报告,发现等待事件中出现了一个陌生的event--enq: HW - contention,google一下是ASSM(Auto Segment Space Manage ...

  4. C++中实现 time_t, tm 相互转换

    time_t -> tm: localtime tm -> time_t: mktime time_t curTime; time(&curTime); dwCurTime = c ...

  5. R语言︱文本挖掘套餐包之——XML+SnowballC+tm包

    每每以为攀得众山小,可.每每又切实来到起点,大牛们,缓缓脚步来俺笔记葩分享一下吧,please~ --------------------------- R语言︱文本挖掘套餐包之--XML+tm+Sn ...

  6. Windows7 64bits下安装TensorFlow CPU版本(图文详解)

    不多说,直接上干货! Installing TensorFlow on Windows的官网 https://www.tensorflow.org/install/install_windows 首先 ...

  7. 1. oracle12C的安装

    官方安装文档:https://docs.oracle.com/database/121/LTDQI/toc.htm#BHCCADGD 1.软件准备 oracle12c.zip 安装包 VMware 虚 ...

  8. MHA安装配置

    1. 前言 MHA可以在较短的时间内实现自己主动故障检測和故障转移,通常在10-30秒以内;在复制框架中,MHA可以非常好地解决复制过程中的数据一致性问题,因为不须要在现有的replication中加 ...

  9. Domino V8 在 UNIX/Linux 平台上的安装及其常见问题

    在 IBM Bluemix 云平台上开发并部署您的下一个应用. 开始您的试用 Domino V8 的安装需求 Domino V8 可以支持多种平台和操作系统,表1 列出了其支持的各种 UNIX/Lin ...

  10. PHP安装所最到的问题-解决方案

    Although Drupals 7+ run smoothly on PHP 5.3, Drupal 6 still feels much better with PHP 5.2. Even tho ...

随机推荐

  1. db2 Reorgchk:重组检查,是否需要重组

    Reorgchk:重组检查,是否需要重组.判断表或索引是否需要重组,有2种方法:1.通过reorgchk工具  reorgchk工具利用8个公式(3个表公式,5个索引公式),如果表统计结果F1,F2或 ...

  2. ASP.NET Core 的Windows和IIS宿主(自动翻译记录)

    https://docs.microsoft.com/en-us/aspnet/core/publishing/iis?tabs=aspnetcore2x 支持的操作系统 以下操作系统的支持: Win ...

  3. class in Bad version

    异常信息:class in Bad version:jdk版本不对

  4. 洛谷P1074 靶形数独【dfs】【剪枝】

    题目:https://www.luogu.org/problemnew/show/P1074 题意: 数独的分数如下.一个数独的总分数就是权值乘所填数字之和. 现在给一个未完成的数独,问分数最高的数独 ...

  5. PostgreSQL源码安装文档

    This document describes the installation of PostgreSQL using the source    code distribution. (If yo ...

  6. CM5.x配置spark错误解决

    通过cloudera manager 5.x添加spark服务,在创建服务过程中,发现spark服务创建失败,可以通过控制台错误输出看到如下日志信息: + perl -pi -e 's#{{CMF_C ...

  7. vue中导入外面文件(css,js)方式

    有时我们需要导入外面的css文件(例如reset.css文件,bootstrap.css,jQuery.js文件),通常可通过import "name.css"的形式 对于rese ...

  8. 在Windows Server 2008 R2 Server中,上传视频遇到的问题(二)

    上一篇  在Windows Server 2008 R2 Server中,上传视频遇到的问题(一)中遇到上传40M视频报404,然后修改配置文件节点: <httpRuntime targetFr ...

  9. 如何注册Navicat for MySQL软件

    https://jingyan.baidu.com/article/6181c3e061ca18152ef153b6.html 给力的经验 在注册界面里面输入信息 名:随便输入 组织:随便输入 注册码 ...

  10. 张小龙2018PRO版微信公开课演讲全文 透露2018微信全新计划

    大家好!我是张小龙.欢迎大家来到微信公开课. 刚刚出现的是我打游戏的画面,被大家看到了,那个不是我最好的水平,因为有点紧张,我最高分曾打到6000多分.当然我是练习了很久了,并不是我比大家更厉害,而是 ...