参考：

Lander-Waterman Model

这个模型是鸟枪法测序和基因组装的最基本的理论模型，它揭示了测序深度与覆盖度之间的关系。

该模型回答了一个最基本的问题：How many reads to we need to be sure we cover the whole genome?

Genome Sequencing - PPT

Chapter 5.1. Lander-Waterman Statistics for Shotgun Sequencing

这个模型是用来做基因组装的。
鸟枪法做了shotgun后，每个碱基被检测的概率是很小的，碱基长度长，
即 p小，n长，二次分布就近似为泊松分布。
在这个理论下，碱基期望深度，（就是每个碱基被检测的次数）为泊松分布的期望值u，基因组覆盖率为1-exp(-u)。

Lander-Waterman model的更多相关文章

  1. Evaluate|GC content|Phred|BAC|heterozygous single nucleotide polymorphisms|estimate genome size|

    (Evaluate):检查reads,可使用比对软件:使用SOAPaligner重新排列:采用massively parallel next-generation sequencing technol ...

  2. Spring Boot笔记一

    Spring Boot 入门 Spring Boot 简介 > 简化Spring应用开发的一个框架:> 整个Spring技术栈的一个大整合:> J2EE开发的一站式解决方案: 微服务 ...

  3. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之二

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之二 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 上一篇<[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一> ...

  4. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之一

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 之前一直看别人的源码,虽然对自己提升比较大,但毕竟不是自己写的,很容易遗 ...

  5. 详解树莓派Model B+控制蜂鸣器演奏乐曲

    步进电机以及无源蜂鸣器这些都需要脉冲信号才能够驱动,这里将用GPIO的PWM接口驱动无源蜂鸣器弹奏乐曲,本文基于树莓派Mode B+,其他版本树莓派实现时需参照相关资料进行修改! 1 预备知识 1.1 ...

  6. 【AutoMapper官方文档】DTO与Domin Model相互转换（上）

    写在前面 AutoMapper目录: [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(上) [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(中) [Au ...

  7. 拨开迷雾，找回自我：DDD 应对具体业务场景，Domain Model 到底如何设计？

    写在前面 除了博文内容之外,和 netfocus 兄的讨论,也可以让你学到很多(至少我是这样),不要错过哦. 阅读目录: 迷雾森林 找回自我 开源地址 后记 毫无疑问,领域驱动设计的核心是领域模型,领 ...

  8. 使用mybatis-generator在自动生成Model类和Mapper文件

    使用mybatis-generator插件可以很轻松的实现mybatis的逆向工程,即,能通过表结构自动生成对应的java类及mapper文件,可以大大提高工作效率,并且它提供了很多自定义的设置可以应 ...

  9. “RazorEngine.Templating.TemplateParsingException”类型的异常在 RazorEngine.NET4.0.dll 中发生，但未在用户代码中进行处理 其他信息: Expected model identifier.

    这个问题是由于在cshtml中 引用了model这个单词  它可能和Model在解析时有冲突. 解决方法:把model换成别的单词就可以了.

  10. QT内省机制、自定义Model、数据库

    本文将介绍自定义Model过程中数据库数据源的获取方法,我使用过以下三种方式获取数据库数据源: 创建 存储对应数据库所有字段的 结构体,将结构体置于容器中返回,然后根据索引值(QModelIndex) ...

随机推荐

  1. 用 WEKA 进行数据挖掘，第 1 部分: 简介和回归（转）

    http://www.ibm.com/developerworks/cn/opensource/os-weka1/index.html 简介 什么是 数据挖掘?您会不时地问自己这个问题,因为这个主题越 ...

  2. 学习js回调函数

    <!DOCTYPE HTML> <html> <head> <meta charset="GBK" /> <title> ...

  3. PHP命令行脚本接收传入参数的三种方式

    通常PHP都做http方式请求了,可以使用GET or POST方式接收参数,有些时候需要在shell命令下把PHP当作脚本执行,比如定时任务.这就涉及到在shell命令下如何给php传参的问题,通常 ...

  4. selenium测试（Java）--多窗口切换（十三）

    selenium测试(Java)--多窗口切换(十三) 如果遇到点击按钮或链接后出现新窗口的情况,就需要使用窗口切换的方法. 本例中就是先打开百度搜索界面,然后利用js打开一个百度新闻界面,然后通过s ...

  5. 浅析Java.lang.Process类

    一.概述      Process类是一个抽象类(所有的方法均是抽象的),封装了一个进程(即一个执行程序).      Process 类提供了执行从进程输入.执行输出到进程.等待进程完成.检查进程的 ...

  6. [转]iOS开发中@property的属性weak nonatomic strong readonly等介绍

    转载地址: http://www.lvtao.net/ios/504.html @property与@synthesize是成对出现的,可以自动生成某个类成员变量的存取方法.在Xcode4.5以及以后 ...

  7. java.sql.SQLException: null, message from server: "Host '192.168.xxx.xxx' is not allowed to connect to this MySQL server"

    当你连接自己的电脑上的MySQL时,报这样的错,你可以把ip换成 127.0.0.1或者localhost  ,当然前提是用户名和密码正确

  8. JZ2440开发板学习 1. 刚接触开发板， 安装驱动

    一. jtag和串口驱动 1. 驱动下载 http://pan.baidu.com/s/1pJkAHJH 2. 驱动安装 禁用win10的驱动数字签名 http://www.100ask.org/bb ...

  9. Codeforces Round #389 (Div. 2, Rated, Based on Technocup 2017 - Elimination Round 3) A

    Description Santa Claus is the first who came to the Christmas Olympiad, and he is going to be the f ...

  10. ionic 中$ionicView.beforeEnter 事件的一个bug

    我在使用ionic写app的时候,需要使用$IonicView.beforeEnter事件,在页面进入前做一些事情,但是发现,它不起作用,很蛋疼,后来,看了别人做的app例子,也涉及到这个$Ionic ...