Lander-Waterman model
参考:
这个模型是鸟枪法测序和基因组装的最基本的理论模型,它揭示了测序深度与覆盖度之间的关系。
该模型回答了一个最基本的问题:How many reads to we need to be sure we cover the whole genome?
Genome Sequencing - PPT
Chapter 5.1. Lander-Waterman Statistics for Shotgun Sequencing
这个模型是用来做基因组装的。
鸟枪法做了shotgun后,每个碱基被检测的概率是很小的,碱基长度长,
即 p小,n长,二次分布就近似为泊松分布。
在这个理论下,碱基期望深度,(就是每个碱基被检测的次数)为泊松分布的期望值u,基因组覆盖率为1-exp(-u)。
Lander-Waterman model的更多相关文章
- Evaluate|GC content|Phred|BAC|heterozygous single nucleotide polymorphisms|estimate genome size|
(Evaluate):检查reads,可使用比对软件:使用SOAPaligner重新排列:采用massively parallel next-generation sequencing technol ...
- Spring Boot笔记一
Spring Boot 入门 Spring Boot 简介 > 简化Spring应用开发的一个框架:> 整个Spring技术栈的一个大整合:> J2EE开发的一站式解决方案: 微服务 ...
- 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之二
[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之二 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 上一篇<[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一> ...
- 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之一
[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 之前一直看别人的源码,虽然对自己提升比较大,但毕竟不是自己写的,很容易遗 ...
- 详解树莓派Model B+控制蜂鸣器演奏乐曲
步进电机以及无源蜂鸣器这些都需要脉冲信号才能够驱动,这里将用GPIO的PWM接口驱动无源蜂鸣器弹奏乐曲,本文基于树莓派Mode B+,其他版本树莓派实现时需参照相关资料进行修改! 1 预备知识 1.1 ...
- 【AutoMapper官方文档】DTO与Domin Model相互转换(上)
写在前面 AutoMapper目录: [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(上) [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(中) [Au ...
- 拨开迷雾,找回自我:DDD 应对具体业务场景,Domain Model 到底如何设计?
写在前面 除了博文内容之外,和 netfocus 兄的讨论,也可以让你学到很多(至少我是这样),不要错过哦. 阅读目录: 迷雾森林 找回自我 开源地址 后记 毫无疑问,领域驱动设计的核心是领域模型,领 ...
- 使用mybatis-generator在自动生成Model类和Mapper文件
使用mybatis-generator插件可以很轻松的实现mybatis的逆向工程,即,能通过表结构自动生成对应的java类及mapper文件,可以大大提高工作效率,并且它提供了很多自定义的设置可以应 ...
- “RazorEngine.Templating.TemplateParsingException”类型的异常在 RazorEngine.NET4.0.dll 中发生,但未在用户代码中进行处理 其他信息: Expected model identifier.
这个问题是由于在cshtml中 引用了model这个单词 它可能和Model在解析时有冲突. 解决方法:把model换成别的单词就可以了.
- QT内省机制、自定义Model、数据库
本文将介绍自定义Model过程中数据库数据源的获取方法,我使用过以下三种方式获取数据库数据源: 创建 存储对应数据库所有字段的 结构体,将结构体置于容器中返回,然后根据索引值(QModelIndex) ...
随机推荐
- python求解ax² + bx + c = 0
系数需满足条件: a,b不能同时为0 b2-4ac≠0 代码如下def quadratic(a, b, c): """ 返回ax² + bx + c = 0的 " ...
- 关于SQL Server将一列的多行内容拼接成一行的问题讨论
http://blog.csdn.net/rolamao/article/details/7745972 昨天遇到一个SQL Server的问题:需要写一个储存过程来处理几个表中的数据,最后问题出在我 ...
- 百度api短信开发
公司原来有一个短信发送的功能,是调用第三方的,但是很不稳定,时不时就收不到短信,但是钱已经扣了.对于这样的事,谁都忍受不了的.于是想找一个稳定短信发送平台,第一想到的是阿里云,百度.在这两个平台上公司 ...
- python 编辑xml中namespace问题中出现很多ns0
原始文件:
- CSS 样式优先级
首先,选择器优先级顺序 优先级逐级增加的选择器列表: 通用选择器(*) 元素(类型)选择器 类选择器 属性选择器 伪类 ID 选择器 内联样式 !important 规则例外,该样式声明会覆盖CSS中 ...
- ubuntu 设置 默认的JDK路径
首先查询有多少种JDK已经被安装了 sudo update-alternatives --list java 其次 配置你想默认的JDK sudo update-alternatives --conf ...
- oracle 删除用户时的坑
ORACLE在使用 SELECT SID,SERIAL# FROM V$SESSION WHERE USERNAME='dt_zntg_trade' 删除会话时,一定要注意dt_zntg_trade的 ...
- Android 网络开发之WIFI
WIFI就是一种无线联网技术,常见的是使用无线路由器.那么在这个无线路由器的信号覆盖的范围内都可以采用WIFI连接的方式进行联网.如果无线路由器连接了一个ADSL线路或其他的联网线路,则又被称为&qu ...
- Fragment全解析系列(一):那些年踩过的坑
开始之前 最新版知乎,单Activity多Fragment的架构,响应可以说非常"丝滑",非要说缺点的话,就是没有转场动画,并且转场会有类似闪屏现象.我猜测可能和Fragment转 ...
- SharePoint常用目录介绍
SharePoint常用目录介绍 stsadm命令管理程序目录:C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\web server extensions ...