参考:

Lander-Waterman Model

这个模型是鸟枪法测序和基因组装的最基本的理论模型,它揭示了测序深度与覆盖度之间的关系。

该模型回答了一个最基本的问题:How many reads to we need to be sure we cover the whole genome?

Genome Sequencing - PPT

Chapter 5.1. Lander-Waterman Statistics for Shotgun Sequencing

这个模型是用来做基因组装的。
鸟枪法做了shotgun后,每个碱基被检测的概率是很小的,碱基长度长,
即 p小,n长,二次分布就近似为泊松分布。
在这个理论下,碱基期望深度,(就是每个碱基被检测的次数)为泊松分布的期望值u,基因组覆盖率为1-exp(-u)。

Lander-Waterman model的更多相关文章

  1. Evaluate|GC content|Phred|BAC|heterozygous single nucleotide polymorphisms|estimate genome size|

    (Evaluate):检查reads,可使用比对软件:使用SOAPaligner重新排列:采用massively parallel next-generation sequencing technol ...

  2. Spring Boot笔记一

    Spring Boot 入门 Spring Boot 简介 > 简化Spring应用开发的一个框架:> 整个Spring技术栈的一个大整合:> J2EE开发的一站式解决方案: 微服务 ...

  3. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之二

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之二 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 上一篇<[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一> ...

  4. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之一

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 之前一直看别人的源码,虽然对自己提升比较大,但毕竟不是自己写的,很容易遗 ...

  5. 详解树莓派Model B+控制蜂鸣器演奏乐曲

    步进电机以及无源蜂鸣器这些都需要脉冲信号才能够驱动,这里将用GPIO的PWM接口驱动无源蜂鸣器弹奏乐曲,本文基于树莓派Mode B+,其他版本树莓派实现时需参照相关资料进行修改! 1 预备知识 1.1 ...

  6. 【AutoMapper官方文档】DTO与Domin Model相互转换(上)

    写在前面 AutoMapper目录: [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(上) [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(中) [Au ...

  7. 拨开迷雾,找回自我:DDD 应对具体业务场景,Domain Model 到底如何设计?

    写在前面 除了博文内容之外,和 netfocus 兄的讨论,也可以让你学到很多(至少我是这样),不要错过哦. 阅读目录: 迷雾森林 找回自我 开源地址 后记 毫无疑问,领域驱动设计的核心是领域模型,领 ...

  8. 使用mybatis-generator在自动生成Model类和Mapper文件

    使用mybatis-generator插件可以很轻松的实现mybatis的逆向工程,即,能通过表结构自动生成对应的java类及mapper文件,可以大大提高工作效率,并且它提供了很多自定义的设置可以应 ...

  9. “RazorEngine.Templating.TemplateParsingException”类型的异常在 RazorEngine.NET4.0.dll 中发生,但未在用户代码中进行处理 其他信息: Expected model identifier.

    这个问题是由于在cshtml中 引用了model这个单词  它可能和Model在解析时有冲突. 解决方法:把model换成别的单词就可以了.

  10. QT内省机制、自定义Model、数据库

    本文将介绍自定义Model过程中数据库数据源的获取方法,我使用过以下三种方式获取数据库数据源: 创建 存储对应数据库所有字段的 结构体,将结构体置于容器中返回,然后根据索引值(QModelIndex) ...

随机推荐

  1. RGB颜色表

    RGB(255,23,140)是光的三原色,也即红绿蓝Red.Green.Blue,它们的最大值是255,相当于100%. 白色:rgb(255,255,255) 黑色:rgb(0,0,0) 红色:r ...

  2. 源代码编译安装Python3.5.2

    由于没有找到Python3.5的rpm安装包,因此进行源代码编译安装 1.下载Python3.5.2 [root@seastar ~]# cd /usr/local/src [root@seastar ...

  3. Install Jenkins Slave as Windows Service

    https://wiki.jenkins-ci.org/display/JENKINS/Installing+Jenkins+as+a+Windows+service SC 直接创建windows s ...

  4. 货运APP雨后春笋 传统物流模式将被改变

    移动互联网正在改变我们的生活方式,各种手机APP充斥着人们的生活,物流行业也不例外.货运APP的出现,对于物流行业是一个提升的机会,也是迈向标准化和专业化的一个有效途径.有专家预测,这将为物流行业的发 ...

  5. iOS检测用户截屏并获取所截图片

    iOS检测用户截屏并获取所截图片 微信可以检测到用户截屏行为(Home + Power),并在稍后点击附加功能按钮时询问用户是否要发送刚才截屏的图片,这个用户体验非常好.在iOS7之前, 如果用户截屏 ...

  6. Weblogic的安装与配置

    安装准备  下载WebLogic10.2 for x86 linux安装文件: 安装RHEL 5.4: 检查Linux环境,确保安装目录所在的文件系统空闲空间在2G以上.如果空间不足,则应扩展root ...

  7. CacheHelper

    public static ObjectCache Cache { get { return MemoryCache.Default; } } public static bool TryGetCac ...

  8. loadrunner总体使用篇

    为什么要进行性能测试呢?  有些问题是只有在大并发或者压力测试下才会暴露出来的,在平常的公司内部测试中,感觉一切都是正常的,但是把服务放到生产线上,例如某个时刻突然有很多的用户要向我们的服务发送请求, ...

  9. Quick-lua3.3之listview

    前言 listview列表,在游戏中非常常见,比如道具列表,玩家列表,排行榜等等.每个版本可能使用方法可能有些差别,但是大同小异,原理和用途都是那几种,设置方向,间隔等. 这里是quick-lua3. ...

  10. SVN图形管理工具-Submint

    1.安装svn及相关依赖包 yum install subversion httpd mod_dav_svn apr-util-sqlite   2.下载submin wget https://sup ...