参考:

Lander-Waterman Model

这个模型是鸟枪法测序和基因组装的最基本的理论模型,它揭示了测序深度与覆盖度之间的关系。

该模型回答了一个最基本的问题:How many reads to we need to be sure we cover the whole genome?

Genome Sequencing - PPT

Chapter 5.1. Lander-Waterman Statistics for Shotgun Sequencing

这个模型是用来做基因组装的。
鸟枪法做了shotgun后,每个碱基被检测的概率是很小的,碱基长度长,
即 p小,n长,二次分布就近似为泊松分布。
在这个理论下,碱基期望深度,(就是每个碱基被检测的次数)为泊松分布的期望值u,基因组覆盖率为1-exp(-u)。

Lander-Waterman model的更多相关文章

  1. Evaluate|GC content|Phred|BAC|heterozygous single nucleotide polymorphisms|estimate genome size|

    (Evaluate):检查reads,可使用比对软件:使用SOAPaligner重新排列:采用massively parallel next-generation sequencing technol ...

  2. Spring Boot笔记一

    Spring Boot 入门 Spring Boot 简介 > 简化Spring应用开发的一个框架:> 整个Spring技术栈的一个大整合:> J2EE开发的一站式解决方案: 微服务 ...

  3. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之二

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之二 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 上一篇<[疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一> ...

  4. 【疯狂造轮子-iOS】JSON转Model系列之一

    [疯狂造轮子-iOS]JSON转Model系列之一 本文转载请注明出处 —— polobymulberry-博客园 1. 前言 之前一直看别人的源码,虽然对自己提升比较大,但毕竟不是自己写的,很容易遗 ...

  5. 详解树莓派Model B+控制蜂鸣器演奏乐曲

    步进电机以及无源蜂鸣器这些都需要脉冲信号才能够驱动,这里将用GPIO的PWM接口驱动无源蜂鸣器弹奏乐曲,本文基于树莓派Mode B+,其他版本树莓派实现时需参照相关资料进行修改! 1 预备知识 1.1 ...

  6. 【AutoMapper官方文档】DTO与Domin Model相互转换(上)

    写在前面 AutoMapper目录: [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(上) [AutoMapper官方文档]DTO与Domin Model相互转换(中) [Au ...

  7. 拨开迷雾,找回自我:DDD 应对具体业务场景,Domain Model 到底如何设计?

    写在前面 除了博文内容之外,和 netfocus 兄的讨论,也可以让你学到很多(至少我是这样),不要错过哦. 阅读目录: 迷雾森林 找回自我 开源地址 后记 毫无疑问,领域驱动设计的核心是领域模型,领 ...

  8. 使用mybatis-generator在自动生成Model类和Mapper文件

    使用mybatis-generator插件可以很轻松的实现mybatis的逆向工程,即,能通过表结构自动生成对应的java类及mapper文件,可以大大提高工作效率,并且它提供了很多自定义的设置可以应 ...

  9. “RazorEngine.Templating.TemplateParsingException”类型的异常在 RazorEngine.NET4.0.dll 中发生,但未在用户代码中进行处理 其他信息: Expected model identifier.

    这个问题是由于在cshtml中 引用了model这个单词  它可能和Model在解析时有冲突. 解决方法:把model换成别的单词就可以了.

  10. QT内省机制、自定义Model、数据库

    本文将介绍自定义Model过程中数据库数据源的获取方法,我使用过以下三种方式获取数据库数据源: 创建 存储对应数据库所有字段的 结构体,将结构体置于容器中返回,然后根据索引值(QModelIndex) ...

随机推荐

  1. python求解ax² + bx + c = 0

    系数需满足条件: a,b不能同时为0 b2-4ac≠0 代码如下def quadratic(a, b, c): """ 返回ax² + bx + c = 0的 " ...

  2. 关于SQL Server将一列的多行内容拼接成一行的问题讨论

    http://blog.csdn.net/rolamao/article/details/7745972 昨天遇到一个SQL Server的问题:需要写一个储存过程来处理几个表中的数据,最后问题出在我 ...

  3. 百度api短信开发

    公司原来有一个短信发送的功能,是调用第三方的,但是很不稳定,时不时就收不到短信,但是钱已经扣了.对于这样的事,谁都忍受不了的.于是想找一个稳定短信发送平台,第一想到的是阿里云,百度.在这两个平台上公司 ...

  4. python 编辑xml中namespace问题中出现很多ns0

    原始文件:

  5. CSS 样式优先级

    首先,选择器优先级顺序 优先级逐级增加的选择器列表: 通用选择器(*) 元素(类型)选择器 类选择器 属性选择器 伪类 ID 选择器 内联样式 !important 规则例外,该样式声明会覆盖CSS中 ...

  6. ubuntu 设置 默认的JDK路径

    首先查询有多少种JDK已经被安装了 sudo update-alternatives --list java 其次 配置你想默认的JDK sudo update-alternatives --conf ...

  7. oracle 删除用户时的坑

    ORACLE在使用 SELECT SID,SERIAL# FROM V$SESSION WHERE USERNAME='dt_zntg_trade' 删除会话时,一定要注意dt_zntg_trade的 ...

  8. Android 网络开发之WIFI

    WIFI就是一种无线联网技术,常见的是使用无线路由器.那么在这个无线路由器的信号覆盖的范围内都可以采用WIFI连接的方式进行联网.如果无线路由器连接了一个ADSL线路或其他的联网线路,则又被称为&qu ...

  9. Fragment全解析系列(一):那些年踩过的坑

    开始之前 最新版知乎,单Activity多Fragment的架构,响应可以说非常"丝滑",非要说缺点的话,就是没有转场动画,并且转场会有类似闪屏现象.我猜测可能和Fragment转 ...

  10. SharePoint常用目录介绍

    SharePoint常用目录介绍 stsadm命令管理程序目录:C:\Program Files\Common Files\Microsoft Shared\web server extensions ...