smith waterman算法
http://www.360doc.com/content/14/0106/00/14641369_342933143.shtml
smith waterman算法的更多相关文章
- DNA序列局部比对(Smith–Waterman algorithm)
生物信息原理作业第三弹:DNA序列局部比对,利用Smith–Waterman算法,python3.6代码实现. 实例以及原理均来自https://en.wikipedia.org/wiki/Smith ...
- [Sequence Alignment Methods] Smith–Waterman algorithm
Smith–Waterman algorithm 首先需要澄清一个事实,Smith–Waterman algorithm是求两个序列的最佳subsequence匹配,与之对应的算法但是求两个序列整体匹 ...
- [Sequence Alignment Methods] Dynamic time warping (DTW)
本系列介绍几种序列对齐方法,包括Dynamic time warping (DTW),Smith–Waterman algorithm,Cross-recurrence plot Dynamic ti ...
- Evaluate|GC content|Phred|BAC|heterozygous single nucleotide polymorphisms|estimate genome size|
(Evaluate):检查reads,可使用比对软件:使用SOAPaligner重新排列:采用massively parallel next-generation sequencing technol ...
- Smith-Waterman算法及其Java实现
Smith-Waterman算法是1981年Smith和Waterman提出的一种用来寻找并比较具有局部相似性区域的动态规划算法,很多后来的算法都是在该算法的基础上发展的.这是一种两序列局部比对算法, ...
- javascript数据结构与算法--基本排序算法分析
javascript中的基本排序算法 对计算机中存储的数据执行的两种最常见操作是排序和检索,排序和检索算法对于前端开发尤其重要,对此我会对这两种算法做深入的研究,而不会和书上一样只是会贴代码而已,下面 ...
- javascript数据结构与算法--散列
一:javascript数据结构与算法--散列 一:什么是哈希表? 哈希表也叫散列表,是根据关键码值(key,value)而直接进行访问的数据结构,它是通过键码值映射到表中一个位置来访问记录的,散列 ...
- 基于Matlab的MMSE的语音增强算法的研究
本课题隶属于学校的创新性课题研究项目.2012年就已经做完了,今天一并拿来发表. 目录: --基于谱减法的语音信号增强算法..................................... ...
- POJ 1142 Smith Numbers(史密斯数)
Description 题目描述 While skimming his phone directory in 1982, Albert Wilansky, a mathematician of Leh ...
随机推荐
- yii2搭建完美后台并实现rbac权限控制实例教程
1.安装yii2 未安装的请参考yii2史上最简单式安装教程,没有之一 或者参考yii2实战教程之详细安装步骤 已安装的请继续看下一步操作 2.配置数据库 2.1 配置数据库 修改common/con ...
- android相关技术及岗位
Android应用开发 Android底层嵌入式 Android架构师 应用开发路线javaSE-->java for Android——>eclipse使用技巧-->A ...
- ubuntu下nginx的启停等常用命令
开发过程中,我们会经常的修改nginx的配置文件,每次修改配置文件都可以先测试下本次修改的配置文件是否正确,可以利用以下命令: ? 1 service nginx -t -c /alidata/ser ...
- js获取上传的文件并用ajax提交
<form id="form1" name="form1" encType="multipart/form-data" method= ...
- 【CodeVS 5032】【省队集训2016 Day5 T1】Play with array
一开始我用分块大法,分成$\sqrt{n}$块,每个块上维护一个Splay,然后balabala维护一下,时间复杂度是$O(n\sqrt{n}logn)$.后来对拍的时候发现比$O(n^2)$的暴力跑 ...
- 【BZOJ 1023】【SHOI 2008】cactus仙人掌图
良心的题解↓ http://z55250825.blog.163.com/blog/static/150230809201412793151890/ tarjan的时候如果是树边则做树形DP(遇到环就 ...
- windows无法安装到这个磁盘怎样解决
装操作系统,出提示:windows无法安装到这个磁盘.这台计算机的硬件可能不支持启动到此盘.你甚至用专业的分区软件都无法解决这个问题,比如说PM等.一般在更换好新的硬盘的时候或者将操作系统装入移动硬盘 ...
- Hadoop 权威指南学习1 (主要框架)
1. Hadoop 最出名的是 MapReduce和 HDFS,不过也有很多其他有用的子项目. 技术栈如下: Core 一系列分布式文件系统和通用I/O的组件和接口(序列化.Java RPC和持久化数 ...
- 【faster-rcnn】训练自己的数据集时的坑
既然faster-rcnn原版发表时候是matlab版代码,那就用matlab版代码吧!不过遇到的坑挺多的,不知道python版会不会好一点. ======= update ========= 总体上 ...
- BZOJ 1034 泡泡堂BNB 贪心+简单博弈
同样是今天做bzoj时做到的,感觉能力范围之内的就做了,也是蛮简单的 1034: [ZJOI2008]泡泡堂BNB Time Limit: 10 Sec Memory Limit: 162 MB Su ...