vcftools安装与使用
官网地址:https://vcftools.github.io/examples.html
vcftools的软件下载:https://vcftools.github.io/examples.html
安装
第一种情况的:
tar -xvf vcfools.0.X.XX.tar.gz
export PERL5LIB=/path/to/your/vcftools-directory/src/perl/
cd vcftools/
./configure
make
make install
第二种情况:
cd vcftools/
./autogen.sh
./configure
make
make install
使用
# 用vcftools软件将vcf格式围成genotype252.map和genotype252.ped两个文件
vcftools --vcf genotype_252_填补.hmp.vcf --plink --out genotype252
vcftools安装与使用的更多相关文章
- linux 安装SAMtools,bcftools,htslib,sratoolkit,bedtools,GATK,TrimGalore,qualimap,vcftools,bwa
--------------------安装Samtools---------------------------------------------------------------------- ...
- UCSC genome browser 个人track 安装
处理基因组数据,很多时候我们会觉得直接看序列文件不够直观,如果绘图的话,把n多G把数据用画图出来不仅费劲,就算操作也不方便.因此我们可以用UCSC开发出的genome browser,可以直接把数据信 ...
- Mac环境 安装brew
一.brew官网主页上的方法: /usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/insta ...
- bcftools或vcftools提取指定区段的vcf文件(extract specified position )
下载安装bcftools 见如下命令: bcftools filter 1000Genomes.vcf.gz --regions 9:4700000-4800000 > 4700000-4800 ...
- docker——容器安装tomcat
写在前面: 继续docker的学习,学习了docker的基本常用命令之后,我在docker上安装jdk,tomcat两个基本的java web工具,这里对操作流程记录一下. 软件准备: 1.jdk-7 ...
- 网络原因导致 npm 软件包 node-sass / gulp-sass 安装失败的处理办法
如果你正在构建一个基于 gulp 的前端自动化开发环境,那么极有可能会用到 gulp-sass ,由于网络原因你可能会安装失败,因为安装过程中部分细节会到亚马逊云服务器上获取文件.本文主要讨论在不变更 ...
- Sublime Text3安装JsHint
介绍 Sublime Text3使用jshint依赖Nodejs,SublimeLinter和Sublimelinter-jshint. NodeJs的安装省略. 安装SublimeLinter Su ...
- Fabio 安装和简单使用
Fabio(Go 语言):https://github.com/eBay/fabio Fabio 是一个快速.现代.zero-conf 负载均衡 HTTP(S) 路由器,用于部署 Consul 管理的 ...
- gentoo 安装
加载完光驱后 1进行ping命令查看网络是否通畅 2设置硬盘的标识为GPT(主要用于64位且启动模式为UEFI,还有一个是MBR,主要用于32位且启动模式为bois) parted -a optima ...
随机推荐
- #Pragma Pack与内存分配
博客转载自:https://blog.csdn.net/mylinx/article/details/7007309 #pragma pack(n) 解释一: 每个特定平台上的编译器都有自己的默认“对 ...
- jQuery基础教程-第8章-002Adding jQuery object methods
一.Object method context 1.We have seen that adding global functions requires extending the jQuery ob ...
- Net-tools
一.简介 Net-tools 包含如下程序,构成了 Linux 网络的基础. arp用来操作核心的ARP(地址解析协议)的高速缓存,通常用来增加.删除一个条目以及转储ARP高速缓存. dnsdomai ...
- HTTP请求:POST和GET的差异
1,一般情况下应用目的不同:GET是从服务器上获取数据,POST是向服务器传送数据. 2,将数据提交到服务器的方式不同:GET是把参数数据队列加到提交表单的ACTION属性所指的URL中,值和表单内各 ...
- DataTable 转换成匿名集合类
using System;using System.CodeDom.Compiler;using System.Collections.Generic;using System.Data;using ...
- Struts2获取Action中的数据
当我们用Struts2框架开发时,经常有要获取jsp页面的数据或者在jsp中获取后台传过来的数据(Action),那么怎么去获取自己想要的数据呢? 后台获取前端数据: 在java程序中生成要获取字段的 ...
- css属性position的运用
随着web标准的规范化,网页的布局也随之千变万化.各种复杂漂亮有创意的页面布局冲 击这人们的视野,相比以前的table布局那就不是一等级的事儿.这个很大一部分功劳是css 样式的引入.而这个多样性布局 ...
- 解决Spring Boot(2.1.3.RELEASE)整合spring-data-elasticsearch3.1.5.RELEASE报NoNodeAvailableException[None of the configured nodes are available
Spring Boot(2.1.3.RELEASE)整合spring-data-elasticsearch3.1.5.RELEASE报NoNodeAvailableException[None of ...
- 【Head First Java 读书笔记】(五)编写程序
第五章 编写程序 伪码:伪码能帮你专注于逻辑而不需要顾虑到程序语法 测试码:测试用的程序代码 真实码:实际代码 伪码 伪码是介于真正的java程序与正常英语之间的一种语言.伪码大致包括3部分:实例变量 ...
- ORACLE_EBS_R12_采购到入库所经历的表
--采购到入库所经历的表 --0.请购单 --创建请购单方式有 --a.从外挂系统导入请购的接口表PO_REQUISITIONS_INTERFACE_ALL,并允许请求(名称:导入申请) SELECT ...