官网地址:https://vcftools.github.io/examples.html

vcftools的软件下载:https://vcftools.github.io/examples.html

安装

第一种情况的:

tar -xvf vcfools.0.X.XX.tar.gz
export PERL5LIB=/path/to/your/vcftools-directory/src/perl/
cd vcftools/
./configure
make
make install

第二种情况:

cd vcftools/
./autogen.sh
./configure
make
make install

 

使用

# 用vcftools软件将vcf格式围成genotype252.map和genotype252.ped两个文件
vcftools --vcf genotype_252_填补.hmp.vcf --plink --out genotype252

  

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