官网地址：https://vcftools.github.io/examples.html

vcftools的软件下载：https://vcftools.github.io/examples.html

安装

第一种情况的：

tar -xvf vcfools.0.X.XX.tar.gz

export PERL5LIB=/path/to/your/vcftools-directory/src/perl/

cd vcftools/

./configure

make

make install

第二种情况：

cd vcftools/

./autogen.sh

./configure

make

make install

　

使用

# 用vcftools软件将vcf格式围成genotype252.map和genotype252.ped两个文件

vcftools --vcf genotype_252_填补.hmp.vcf --plink --out genotype252

　　

vcftools安装与使用的更多相关文章

  1. linux 安装SAMtools，bcftools，htslib，sratoolkit，bedtools,GATK，TrimGalore，qualimap，vcftools，bwa

    --------------------安装Samtools---------------------------------------------------------------------- ...

  2. UCSC genome browser 个人track 安装

    处理基因组数据,很多时候我们会觉得直接看序列文件不够直观,如果绘图的话,把n多G把数据用画图出来不仅费劲,就算操作也不方便.因此我们可以用UCSC开发出的genome browser,可以直接把数据信 ...

  3. Mac环境 安装brew

    一.brew官网主页上的方法: /usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/insta ...

  4. bcftools或vcftools提取指定区段的vcf文件（extract specified position ）

    下载安装bcftools 见如下命令: bcftools filter 1000Genomes.vcf.gz --regions 9:4700000-4800000 > 4700000-4800 ...

  5. docker——容器安装tomcat

    写在前面: 继续docker的学习,学习了docker的基本常用命令之后,我在docker上安装jdk,tomcat两个基本的java web工具,这里对操作流程记录一下. 软件准备: 1.jdk-7 ...

  6. 网络原因导致 npm 软件包 node-sass / gulp-sass 安装失败的处理办法

    如果你正在构建一个基于 gulp 的前端自动化开发环境,那么极有可能会用到 gulp-sass ,由于网络原因你可能会安装失败,因为安装过程中部分细节会到亚马逊云服务器上获取文件.本文主要讨论在不变更 ...

  7. Sublime Text3安装JsHint

    介绍 Sublime Text3使用jshint依赖Nodejs,SublimeLinter和Sublimelinter-jshint. NodeJs的安装省略. 安装SublimeLinter Su ...

  8. Fabio 安装和简单使用

    Fabio(Go 语言):https://github.com/eBay/fabio Fabio 是一个快速.现代.zero-conf 负载均衡 HTTP(S) 路由器,用于部署 Consul 管理的 ...

  9. gentoo 安装

    加载完光驱后 1进行ping命令查看网络是否通畅 2设置硬盘的标识为GPT(主要用于64位且启动模式为UEFI,还有一个是MBR,主要用于32位且启动模式为bois) parted -a optima ...

随机推荐

  1. codeforce469DIV2——C. Zebras

    题意 0, 010, 01010 这一类的01交替且开头和结尾都为0的序列被称为zebra序列.给出一段01序列,尝试能否把他分为k个子序列使得每个子序列都是zebra序列. 分析 这个题应该算是水题 ...

  2. 一个完整的用java客户端使用httpClient请求网页并返回的方法

    import java.io.ByteArrayOutputStream;import java.io.IOException;import java.io.InputStream;import ja ...

  3. linux系统上部署一个web项目

    对于apache开源项目中tomcat的认识,大多停留在Windows下,这次我通过一个简单的实例来介绍一下在linux下如何搭建tomcat环境,并且部署一个web项目. 先从基本安装开始,可别小看 ...

  4. 利用JDBC连接数据库（MySQL）

    1 在eclipse中创建一个maven项目(在Java模式下,不要在JavaEE模式下) 1.1 file  -->> new  -->> project 2 下载数据库驱动 ...

  5. 符合mvc思维的分页思想

    .Model Student.cs namespace WebApplication14.Models { public class Student { public int Id { get; se ...

  6. Mybatis XML 配置文件

    <?xml version="1.0" encoding="UTF-8" ?> <!DOCTYPE configuration PUBLIC ...

  7. KMP算法细讲（豁然开朗）

    一.KMP算法是如何针对传统算法修改的 用模式串P去匹配字符串S,在i=6,j=4时发生失配: ---------------------------------------------------- ...

  8. sql 存储过程返回多个值

    ALTER PROCEDURE your_sp_name    ASBEGIN    DECLARE @a INT, @b INT, @c INT    SELECT @a= COUNT(1) FRO ...

  9. 浅谈Android内存管理

    最近在网上看了不少Android内存管理方面的博文,但是文章大多都是就单个方面去介绍内存管理,没有能全局把握,缺乏系统性阐述,而且有些观点有误,仅仅知道这些,还是无法从整体上理解内存管理,对培养系统优 ...

  10. touchmove和touchend的使用

    touchstart:当手指触摸屏幕时触发:即使已经有一个手指放在了屏幕上也会触发.touchmove:当手指在屏幕上滑动时连续的触发.在这个事件发生期间,调用preventDefault()可阻止滚 ...