cutadapt

参考：用cutadapt软件来对双端测序数据去除接头

fastqc可以用于检测，检测出来了怎么办？

看了几篇高水平文章，有不少再用cutadapt，虽然有时候数据真的不错，但是还是要质控一下，修剪一下。

cutadapt -a ADAPTER_FWD -A ADAPTER_REV -o out.1.fastq -p out.2.fastq reads.1.fastq reads.2.fastq

　　

待续~

质控工具之cutadapt的使用方法的更多相关文章

  1. ROS_Kinetic_14 ROS工具roswtf的基本使用方法等

    ROS_Kinetic_14 ROS工具roswtf的基本使用方法 官网教程:http://wiki.ros.org/cn/ROS/Tutorials/Getting%20started%20with ...

  2. Newtonsoft.Json C# Json序列化和反序列化工具的使用、类型方法大全 C# 算法题系列(二) 各位相加、整数反转、回文数、罗马数字转整数 C# 算法题系列(一) 两数之和、无重复字符的最长子串 DateTime Tips c#发送邮件，可发送多个附件 MVC图片上传详解

    Newtonsoft.Json C# Json序列化和反序列化工具的使用.类型方法大全   Newtonsoft.Json Newtonsoft.Json 是.Net平台操作Json的工具,他的介绍就 ...

  3. iSkysoft iMedia Converter Deluxe Mac如何制作视频？视频格式转换工具制作动图的方法

    使用iSkysoft iMedia Converter Deluxe Mac如何制作视频?使用视频格式转换工具,你可以轻松进行动图或视频的制作,也可以把你喜欢的视频的某一段提取出来,制作成你自己风格的 ...

  4. 质控工具之TrimGalore使用方法

    TrimGalore 就是一个简单的perl wrapper,打包了fastqc和cutadapt,但是却非常实用. 因为cutadapt的参数选择实在是有够复杂,光接头类型就有5种,还有各种参数,大 ...

  5. Google软件构建工具Bazel原理及使用方法介绍

    近期,Google开源了强大的自动化构建工具Bazel. 正好博主近期在使用china版的Bazel--腾讯自主开发的Blade,所以准备跟大家分享一下Google Bazel这个分布式构建系统的原理 ...

  6. charles抓包工具的中文乱码解决方法

    charles是 MAC上最好用的抓包工具.charles 网上的参考文档已经很多,我就不再赘述啦.只是说说我在安装过程遇到的问题和解决方法,仅供参考. charles抓包的数据中的中文内容显示乱码, ...

  7. 为Autodesk Viewer添加自定义工具条的更好方法

    上一篇文章中我介绍了使用Autodesk Viewer的UI API来给viewer添加自定义工具条的方法,看起来很简单是吧.不过有个问题,就是关于自定义工具条的信息(包括按钮的文本.图标.样式.ca ...

  8. ADB工具和手机抓包方法介绍

    Android抓包方法 工具包内容如下:(下载地址:http://download.csdn.net/download/yezhaohui2011/8368061) adb ——谷歌提供的安卓远程调试 ...

  9. Android基础知识02—安卓日志工具LogCat的五种方法

    --------Android 02-------- >>> Android的日志工具LogCat    五个方法,记录信息的级别不一样,从低到高为:    1.Log.v()-日志 ...

随机推荐

  1. 20145308 《网络对抗》 MSF基础应用 学习总结

    20145308 <网络对抗> MSF基础应用 学习总结 实验内容 掌握metasploit的基本应用方式,掌握常用的三种攻击方式的思路.具体需要完成(1)一个主动攻击,如ms08_067 ...

  2. 20145311 王亦徐 《网络对抗技术》 Web基础

    20145311 王亦徐 <网络对抗技术> Web基础 实验内容 简单的web前端页面(HTML.CSS等) 简单的web后台数据处理(PHP) Mysql数据库 一个简单的web登陆页面 ...

  3. Ubuntu软件操作的相关命令

    Ubuntu软件操作的相关命令 sudo apt-get update ------------------------------- 更新源 sudo apt-get install package ...

  4. Python中的对象行为与特殊方法(二)类型检查与抽象基类

    类型检查 创建类的实例时,该实例的类型为类本身: class Foo(object): pass f = Foo() 要测试实例是否属于某个类,可以使用type()内置函数: >>> ...

  5. PyCharm史上最强攻略

    Ctrl + D 复制选定的区域或行 Ctrl + Y 删除选定的行 Ctrl + Alt + L 代码格式化 Ctrl + Alt + O 优化导入(去掉用不到的包导入) Ctrl + 鼠标 简介/ ...

  6. SOAP和WebService的那些事

    当初对这段历史有过一点研究,不过当初写得关于这部分历史的论文不知道被我丢哪儿去了,下面我用通俗一点的语言来话说一下这段历史吧,因为当初详细到具体人物具体时间的已经记不清了,所以这里写得不够专业,大家就 ...

  7. Python 处理 CSV/EXCEL 表格文件

    只想说,数据挖掘工作,80%时间都花在处理数据上了,这句话真不假! 最近和小伙伴组了个队参加数据分析比赛,记录下我处理 csv 文件的一些步骤吧: 修改csv文件 可以用csv模块1,官方文档2 im ...

  8. JXOI2018守卫 区间DP

    链接 https://loj.ac/problem/2545 思路 f[i][j]表示i到j区间的最小监视人数 可以预处理出来g[i][j],表示i能否监视到j (其实预处理的关系不大,完全可以直接判 ...

  9. SpringBoot 使用jwt进行身份验证

    这里只供参考,比较使用jwt方式进行身份验证感觉不好,最不行的就是不能退出 登陆时设定多长过期时间,只能等这个时间过了以后才算退出,服务端只能验证请求过来的token是否通过验证 Code: /** ...

  10. （转）Applications of Reinforcement Learning in Real World

    Applications of Reinforcement Learning in Real World 2018-08-05 18:58:04 This blog is copied from: h ...