cutadapt

参考:用cutadapt软件来对双端测序数据去除接头

fastqc可以用于检测,检测出来了怎么办?

看了几篇高水平文章,有不少再用cutadapt,虽然有时候数据真的不错,但是还是要质控一下,修剪一下。

cutadapt -a ADAPTER_FWD -A ADAPTER_REV -o out.1.fastq -p out.2.fastq reads.1.fastq reads.2.fastq

  

待续~

质控工具之cutadapt的使用方法的更多相关文章

  1. ROS_Kinetic_14 ROS工具roswtf的基本使用方法等

    ROS_Kinetic_14 ROS工具roswtf的基本使用方法 官网教程:http://wiki.ros.org/cn/ROS/Tutorials/Getting%20started%20with ...

  2. Newtonsoft.Json C# Json序列化和反序列化工具的使用、类型方法大全 C# 算法题系列(二) 各位相加、整数反转、回文数、罗马数字转整数 C# 算法题系列(一) 两数之和、无重复字符的最长子串 DateTime Tips c#发送邮件,可发送多个附件 MVC图片上传详解

    Newtonsoft.Json C# Json序列化和反序列化工具的使用.类型方法大全   Newtonsoft.Json Newtonsoft.Json 是.Net平台操作Json的工具,他的介绍就 ...

  3. iSkysoft iMedia Converter Deluxe Mac如何制作视频?视频格式转换工具制作动图的方法

    使用iSkysoft iMedia Converter Deluxe Mac如何制作视频?使用视频格式转换工具,你可以轻松进行动图或视频的制作,也可以把你喜欢的视频的某一段提取出来,制作成你自己风格的 ...

  4. 质控工具之TrimGalore使用方法

    TrimGalore 就是一个简单的perl wrapper,打包了fastqc和cutadapt,但是却非常实用. 因为cutadapt的参数选择实在是有够复杂,光接头类型就有5种,还有各种参数,大 ...

  5. Google软件构建工具Bazel原理及使用方法介绍

    近期,Google开源了强大的自动化构建工具Bazel. 正好博主近期在使用china版的Bazel--腾讯自主开发的Blade,所以准备跟大家分享一下Google Bazel这个分布式构建系统的原理 ...

  6. charles抓包工具的中文乱码解决方法

    charles是 MAC上最好用的抓包工具.charles 网上的参考文档已经很多,我就不再赘述啦.只是说说我在安装过程遇到的问题和解决方法,仅供参考. charles抓包的数据中的中文内容显示乱码, ...

  7. 为Autodesk Viewer添加自定义工具条的更好方法

    上一篇文章中我介绍了使用Autodesk Viewer的UI API来给viewer添加自定义工具条的方法,看起来很简单是吧.不过有个问题,就是关于自定义工具条的信息(包括按钮的文本.图标.样式.ca ...

  8. ADB工具和手机抓包方法介绍

    Android抓包方法 工具包内容如下:(下载地址:http://download.csdn.net/download/yezhaohui2011/8368061) adb ——谷歌提供的安卓远程调试 ...

  9. Android基础知识02—安卓日志工具LogCat的五种方法

    --------Android 02-------- >>> Android的日志工具LogCat    五个方法,记录信息的级别不一样,从低到高为:    1.Log.v()-日志 ...

随机推荐

  1. C# asp:FileUpload上传文件使用JS实现预览效果

    js代码: <script type="text/javascript"> //下面用于图片上传预览功能 function setImagePreview() { va ...

  2. ODAC(V9.5.15) 学习笔记(四)TCustomDADataSet(3)

    4. 主从表关系 名称 类型 说明 MasterSource 从表对应于主表的DataSource组件 DetailFields 从表中对应于主表字段的外键字段 MasterFields 主表中关联从 ...

  3. Python3 tkinter基础 LabelFrame Radiobutton 形成两组不相互限制的单选按钮

             Python : 3.7.0          OS : Ubuntu 18.04.1 LTS         IDE : PyCharm 2018.2.4       Conda ...

  4. SOAP和WebService的那些事

    当初对这段历史有过一点研究,不过当初写得关于这部分历史的论文不知道被我丢哪儿去了,下面我用通俗一点的语言来话说一下这段历史吧,因为当初详细到具体人物具体时间的已经记不清了,所以这里写得不够专业,大家就 ...

  5. SpringBoot 全局统一记录日志

    1.记录日志 使用aop来记录controller中的请求返回日志 pom.xml引入: <dependency> <groupId>org.springframework.b ...

  6. docker-compose安装与部署项目

    安装: 1.curl安装慢的问题 解决:改用pip安装,需要先安装pip相关,参照: https://www.cnblogs.com/YatHo/p/7815400.html 2.pip安装依赖库re ...

  7. java 之 dom4j解析xml

    *dom4j,是一个组织,针对xml解析,提供解析器dom4j *dom4j不是javase的一部分,想要使用需要导入dom4j提供的jar包 *第一步:创建lib文件夹,将压缩文件放到此处 *第二步 ...

  8. 题解——Codeforces Round #508 (Div. 2) T2 (构造)

    按照题意构造集合即可 注意无解情况的判断 #include <cstdio> #include <algorithm> #include <cstring> #in ...

  9. Deep Reinforcement Learning for Visual Object Tracking in Videos 论文笔记

    Deep Reinforcement Learning for Visual Object Tracking in Videos 论文笔记 arXiv 摘要:本文提出了一种 DRL 算法进行单目标跟踪 ...

  10. js为什么返回两个对象字符串 objcet objcet ?

    js中两个使用 toString() 对有个有对象的数组进行操作时,为什么返回两个对象字符串 objcet objcet ? [{}].toString(); 返回 "[object Obj ...