质控工具之cutadapt的使用方法
fastqc可以用于检测,检测出来了怎么办?
看了几篇高水平文章,有不少再用cutadapt,虽然有时候数据真的不错,但是还是要质控一下,修剪一下。
cutadapt -a ADAPTER_FWD -A ADAPTER_REV -o out.1.fastq -p out.2.fastq reads.1.fastq reads.2.fastq
待续~
质控工具之cutadapt的使用方法的更多相关文章
- ROS_Kinetic_14 ROS工具roswtf的基本使用方法等
ROS_Kinetic_14 ROS工具roswtf的基本使用方法 官网教程:http://wiki.ros.org/cn/ROS/Tutorials/Getting%20started%20with ...
- Newtonsoft.Json C# Json序列化和反序列化工具的使用、类型方法大全 C# 算法题系列(二) 各位相加、整数反转、回文数、罗马数字转整数 C# 算法题系列(一) 两数之和、无重复字符的最长子串 DateTime Tips c#发送邮件,可发送多个附件 MVC图片上传详解
Newtonsoft.Json C# Json序列化和反序列化工具的使用.类型方法大全 Newtonsoft.Json Newtonsoft.Json 是.Net平台操作Json的工具,他的介绍就 ...
- iSkysoft iMedia Converter Deluxe Mac如何制作视频?视频格式转换工具制作动图的方法
使用iSkysoft iMedia Converter Deluxe Mac如何制作视频?使用视频格式转换工具,你可以轻松进行动图或视频的制作,也可以把你喜欢的视频的某一段提取出来,制作成你自己风格的 ...
- 质控工具之TrimGalore使用方法
TrimGalore 就是一个简单的perl wrapper,打包了fastqc和cutadapt,但是却非常实用. 因为cutadapt的参数选择实在是有够复杂,光接头类型就有5种,还有各种参数,大 ...
- Google软件构建工具Bazel原理及使用方法介绍
近期,Google开源了强大的自动化构建工具Bazel. 正好博主近期在使用china版的Bazel--腾讯自主开发的Blade,所以准备跟大家分享一下Google Bazel这个分布式构建系统的原理 ...
- charles抓包工具的中文乱码解决方法
charles是 MAC上最好用的抓包工具.charles 网上的参考文档已经很多,我就不再赘述啦.只是说说我在安装过程遇到的问题和解决方法,仅供参考. charles抓包的数据中的中文内容显示乱码, ...
- 为Autodesk Viewer添加自定义工具条的更好方法
上一篇文章中我介绍了使用Autodesk Viewer的UI API来给viewer添加自定义工具条的方法,看起来很简单是吧.不过有个问题,就是关于自定义工具条的信息(包括按钮的文本.图标.样式.ca ...
- ADB工具和手机抓包方法介绍
Android抓包方法 工具包内容如下:(下载地址:http://download.csdn.net/download/yezhaohui2011/8368061) adb ——谷歌提供的安卓远程调试 ...
- Android基础知识02—安卓日志工具LogCat的五种方法
--------Android 02-------- >>> Android的日志工具LogCat 五个方法,记录信息的级别不一样,从低到高为: 1.Log.v()-日志 ...
随机推荐
- hdu 1151 Air Raid - 二分匹配
Consider a town where all the streets are one-way and each street leads from one intersection to ano ...
- Jmeter在Linux下执行
1.上传jmeter文件到服务器上(最好自己建一个文件夹:如:mkidr yzb_jmeter) 2.上传jmeter脚本到yzb_jmeter,并修改权限:chmod +x 脚本文件 3.修改统计的 ...
- Eclipse git commit错误;Committing changes has encountered a problem An Internal error occured
背景 在使用eclipse时,使用git commit 提交代码时,出项如下错误 解决方法 在工程目录下找到 .git 文件夹 ,找到里面的 index.lock 文件,然后删掉这个文件就可以了,如下 ...
- ODAC(V9.5.15) 学习笔记(四)TMemDataSet (3)
3.其他 名称 类型 说明 GetBlob TBlob 按照字段名获取当前数据集中某个Blob类型的字段值,并以TBlob对象形式返回 Prepared Boolean 检查Query的SQL是否已准 ...
- 编译openwrt时总是报错“staging_dir/target-aarch64_generic_glibc/stam$/.tools_compile_yynyyyyynyyyyynyynnyyyynyyyyyyyyyyyyyyynyynynnyyynny' failed”
1. 详细错误如下: tools/Makefile:146: recipe for target '/home/jello/openwrt/staging_dir/target-aarch64_gen ...
- SpringBoot 全局统一记录日志
1.记录日志 使用aop来记录controller中的请求返回日志 pom.xml引入: <dependency> <groupId>org.springframework.b ...
- nowcoder 合并回文子串
链接:https://www.nowcoder.com/acm/contest/6/C来源:牛客网题目输入两个字符串A和B,合并成一个串C,属于A和B的字符在C中顺序保持不变.如"abc&q ...
- entity framework浅谈
1. 什么是EF 微软提供的ORM工具. ORM让开发人员节省数据库访问代码的时间. 将更多的时间放在业务逻辑层面上. 开发人员使用linq语言, 对数据库进行操作. 2. EF的使用场景 EF有三种 ...
- PS与PL协同设计
https://blog.csdn.net/Fei_Yang_YF/article/details/79676172 什么是PS和PL ZYNQ-7000是Xilinx推出的一款全可编程片上系统(Al ...
- 总结Javascript中数组各种去重的方法
相信大家都知道网上关于Javascript中数组去重的方法很多,这篇文章给大家总结Javascript中数组各种去重的方法,相信本文对大家学习和使用Javascript具有一定的参考借鉴价值,有需要的 ...