质控工具之cutadapt的使用方法
fastqc可以用于检测,检测出来了怎么办?
看了几篇高水平文章,有不少再用cutadapt,虽然有时候数据真的不错,但是还是要质控一下,修剪一下。
cutadapt -a ADAPTER_FWD -A ADAPTER_REV -o out.1.fastq -p out.2.fastq reads.1.fastq reads.2.fastq
待续~
质控工具之cutadapt的使用方法的更多相关文章
- ROS_Kinetic_14 ROS工具roswtf的基本使用方法等
ROS_Kinetic_14 ROS工具roswtf的基本使用方法 官网教程:http://wiki.ros.org/cn/ROS/Tutorials/Getting%20started%20with ...
- Newtonsoft.Json C# Json序列化和反序列化工具的使用、类型方法大全 C# 算法题系列(二) 各位相加、整数反转、回文数、罗马数字转整数 C# 算法题系列(一) 两数之和、无重复字符的最长子串 DateTime Tips c#发送邮件,可发送多个附件 MVC图片上传详解
Newtonsoft.Json C# Json序列化和反序列化工具的使用.类型方法大全 Newtonsoft.Json Newtonsoft.Json 是.Net平台操作Json的工具,他的介绍就 ...
- iSkysoft iMedia Converter Deluxe Mac如何制作视频?视频格式转换工具制作动图的方法
使用iSkysoft iMedia Converter Deluxe Mac如何制作视频?使用视频格式转换工具,你可以轻松进行动图或视频的制作,也可以把你喜欢的视频的某一段提取出来,制作成你自己风格的 ...
- 质控工具之TrimGalore使用方法
TrimGalore 就是一个简单的perl wrapper,打包了fastqc和cutadapt,但是却非常实用. 因为cutadapt的参数选择实在是有够复杂,光接头类型就有5种,还有各种参数,大 ...
- Google软件构建工具Bazel原理及使用方法介绍
近期,Google开源了强大的自动化构建工具Bazel. 正好博主近期在使用china版的Bazel--腾讯自主开发的Blade,所以准备跟大家分享一下Google Bazel这个分布式构建系统的原理 ...
- charles抓包工具的中文乱码解决方法
charles是 MAC上最好用的抓包工具.charles 网上的参考文档已经很多,我就不再赘述啦.只是说说我在安装过程遇到的问题和解决方法,仅供参考. charles抓包的数据中的中文内容显示乱码, ...
- 为Autodesk Viewer添加自定义工具条的更好方法
上一篇文章中我介绍了使用Autodesk Viewer的UI API来给viewer添加自定义工具条的方法,看起来很简单是吧.不过有个问题,就是关于自定义工具条的信息(包括按钮的文本.图标.样式.ca ...
- ADB工具和手机抓包方法介绍
Android抓包方法 工具包内容如下:(下载地址:http://download.csdn.net/download/yezhaohui2011/8368061) adb ——谷歌提供的安卓远程调试 ...
- Android基础知识02—安卓日志工具LogCat的五种方法
--------Android 02-------- >>> Android的日志工具LogCat 五个方法,记录信息的级别不一样,从低到高为: 1.Log.v()-日志 ...
随机推荐
- (6CBIR模拟问题)自己动手,编写神经网络程序,解决Mnist问题,并网络化部署
个方面: 最初的图像检索研究主要集中在如何选择合适的全局特征去描述图像内容和采用什么样的相似性度量方法进行图像匹配. 第二个研究热点是基于区域的图像检索方法,其主要思想是图像分割技术提取出图像中的物体 ...
- C语言三个结束符:EOF ‘\0’ '\n'
- 使用Jenkins构建、部署spring boot项目
一.环境搭建 本次实验的环境为Ubuntu 16.04,Jenkins 2.8.3 1.安装ssh sudo apt-get update # 更新软件源 sudo apt-get install o ...
- 牛客网数据库SQL实战(11-15)
11.获取所有员工当前的manager,如果当前的manager是自己的话结果不显示,当前表示to_date='9999-01-01'.结果第一列给出当前员工的emp_no,第二列给出其manager ...
- innerHTML和 innerText的区别
共同点:innerHTML和innerText都会把元素内内容替换掉.不同点:1,innerHTML: 也就是从对象的起始位置到终止位置的全部内容,包括Html标签. 上例中的test.innerHT ...
- 【原理、应用】Quartz集群原理及配置应用
一.Quartz任务调度的基本实现原理 Quartz是OpenSymphony开源组织在任务调度领域的一个开源项目,完全基于Java实现.作为一个优秀的开源调度框架,Quartz具有以下特点: 强大的 ...
- 【拼接属性查询方式】MySql某一列属性值为拼接时的查询方式
数据库中某一列的值为 使用IN查询是无法查询到数据的,只能查询到IN(2)或者IN(2,3) 查询结果: , style_id) 正确方式:使用FIND_IN_SET函数 , style_id) , ...
- Cannot retrieve metalink for repository: epel 错误解决办法
centos下安装完EPEL源, 然后更新一下yum缓存, 如果发现这样的错误:Error: Cannot retrieve metalink for repository: epel. Please ...
- 浅谈FFT、NTT和MTT
前言 \(\text{FFT}\)(快速傅里叶变换)是 \(O(n\log n)\) 解决多项式乘法的一个算法,\(\text{NTT}\)(快速数论变换)则是在模域下的,而 \(\text{MTT} ...
- Python实现机器学习算法:线性回归
import numpy as np from sklearn.datasets import load_diabetes from sklearn.utils import shuffle impo ...